Map Locations of contig_130905 (7723 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_130905

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_3448 1 1548 bp MLOC_3448.1 Available Available LOC_Os06g15700.1, FRAME:-1, EVALUE:8e-164, 13106.m01735 protein expressed protein
MLOC_3447 1 204 bp AK353908 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_3448






CDS Structure of MLOC_3447






Contig Sequence (7723 bp)

>contig_130905 7723 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTTAGAATTTCAACATAGTGGCCAAACATTCCATGAGTACATCAACGAGTTCTTCAACAT
TATTCCTTTCTTAGCTAGTCGATTTTTGAAGCCTCCGAGCATTGATGAGCCACATCCAAA
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AATTTACTTTCAGAACTTGAAGTTATTCATCTAATTTGAAGTTCTTTATTGACCTTCAAT
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ATCGTCCTAGTGGTTGTTGAGTGCTTATTTTTGATATCATCACACATAAACTCAGTTTCA
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GCTTAGTACCGAAAATTGTTACTACTCAGCTACCCTAGTAATTGGTGAATTTAGTCAAGT
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TAATAGTGTGTGTGAAGGGGCAAATCAGCTGCATTATTTTTCTTTCCACCCGAAATATAC
TTTTGTTCATTGGATACATCCATCACTTTTGTTCATTGGCCTCTGAACACTCCTATTATA
TTATCTTTGTTATTACTGTTGGAAGGTAACTTCTTTAAAAAGTACAACATTACATATGGA
ATGTCCAATAAATTACAAGTTTGCCTCATAAAATTCAATTGTTGTAGGGTTTATCTATAC
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AATCCATATGCAGTGTTAAAATCTTAAGGGGCAAATGCAAGCTGTTTAGTACTGATTATA
CATGCGAATAAAGAAGAAATTGCATATTTAACCACAAGACGTACTACACAGAATAAATGA
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TGCATAGCACGAGCAGAAGCTGATACTGGAGCTACTGCAGCAGCTGGAGCTCCACAGATT
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TTCATGTTAATCTTAATAACTAGGCAAGACATGAAAAGATGAAAGGTGTATGTAGGATTG
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TGTGCACCCTCAGGCTGGTTAGCTCTTATGTTTTCTTTGGTTTTTTTTGCTTCACGTGAG
GTTAAAGGCGGCGGAACAGCGGTAAGGGCACGCTCTGTCTTCAAAAGCATATCATGAGCT
CCCGCTGCCAAATGGACACCAAGGCCTACAGCTTCGATGGATACACTTCTGATGAAAGCA
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CCTTGAGCAACTTCCGGTCCTTCTTGTAGCTTTTGATTGGTAAGGAGACCAATTTCTTAG
TGCCTGAACCAACGGCAACTAATGACTTTATAGGAGGAAGACCTTTTAACACTTTATGGA
CCTACACAAGCAGCATATTGTCAGTTCAGGTGAGAGCAGGAATTCTTGTGTAAGAAAAGG
CAGATTTACAATATTCTCCACTACATATTTAATCTCTTTTTCTTTCTCATATTCCTTGTC
CTAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATACAACAAGAAGCATGTCTAAATGTACAGTC
GTGCATGGAGAAATCAGAACCTGATTCTTGGAGATGTCCTCCAGCCACTCTGCAGCTACT
GTTTCACATATACTATTCCACCCATAAACACCCATTGCAGAAACATTCTTAAGCTTTAAA
TCGATTCCCTGCACGCAAAAAAAATCATTGTCAGTGTTGCCTATTGATCTACAGATAATC
AGCAGCGAACTGACTGCTCTAAAGTATTTCCTTTTCAACAACAAATTACCTTCCATGGAA
GGATGTTGAGAAGCTCTGCATAATTTCCTTTACCTAGTGCAATAGGATCAAACTGACGAG
GAATATAATTAATATGCAGAACCAGAGGCTTCACATCGAATTTCTGGCACCACAGAAAAA
GAAGATCAGATTGCAACAAATGTTTACTGAAGACAAACAGAGCCCAGCTCGTCCAGTGCA
AATAAAATGAGAAAGGAAAATATTTCGATGACTGTTAATGCACAGAATTTCAAAAAAAAA
ATATGTCAGGTTAAATAGGTGCAAAGAGTTCTTATGTGATCCCTATCAAGTCCCATGATT
AAGAGGAAAACAATAATTGGTAAATCCAAAATACCTGGAAAAAAGGAAGTAATGCTTCAT
CCACAATTGTAGTGCTTCCGTAGGTTGTGCTGTCCATACCAACAATCTCATTTTCGCAAG
GCACATGAGGGTTGTTGTTAATTGAGTCATTCTGGAAGAAACTGATGAGGAAGTTCAGTT
GCCCTTGATCAAGATGCAATTGAAGAGGCAAAATCTCGAGGCATAACCTGAAGAAGGATG
CAAGAGAAGAGGGTCAGACGACAAACTGAGAGAGCATAGAAAGTGTCAGAAAGGAGAAGG
TGAAAAAAAAAAGCCAGCACTATTCTTGCGGACTAGAATCAAACATGGCAGACACAAATT
AGTGGCAAGAACAAAAGTGTAAAGAGCGCGAATGCATAAACAACTAACCATAGCGTACAT
GCACAAATCATGAATATGGATCTGCCATACAATTTTTTCTTCAGAATTCACATATCATTA
ACATAAGCCAACCAAATACTGGAATAGGATGAAAACAACTATTGCACCAGGATACGGTTA
CTACATGAAATTATGTCGCTGATATTTAATTGTGCAAACCCCATATTCCATATACCCCTC
AAAACTAAGGGGAGAAGACAAATTAGCCAAGTACATTAGGATTTAGTCTTGCAATGTTCT
GAAACCAATATATAGCTTATTTTACTACTCCCTCCGTTCCTAA