Map Locations of contig_130071 (2239 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_130071

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_3354 3 918 bp MLOC_3354.2 Available Available None





CDS Structure of MLOC_3354






Contig Sequence (2239 bp)

>contig_130071 2239 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGTGATCCCGGGGACGACGTCGGTGACTAACCGACCAGTTCATCAAGCCTTCTTCCCCTG
CACTTCTAACCTGGAGTTGTGTGGCCGAGGTGAGCAGGGTCGCTATGCAAGGCGGTGGCC
TGCGGGAAGGGGAACTGCACGGTGACAGAAGTAAGTCGGAAGGATTCCAGGTGAGCGATT
CGTGTTGCTTCCCATGTTTGATCTGTCAGCTATCTTACTTCTTCGTTGGGCAAGAACATA
GATTGGCTGGTGATTGTTTTTGCCGGTCTAAACAAAAACATTACTAAGTTACTTTTCGAA
ACAGATCCACCTTGCCTGATCCTTGGGGAAGATCCTAGTCATGATGAAGATGCCAGTGAC
CAAGTGTTAGAAGACGAACTCGAAGGGATAACAACAAGAGGACCATAATTCATGTGTTCC
TGTCAAGGATTAATTCCCAGTCCCTTTTTACAGTTCATCATCCATTGTCGGGGAAGCTTT
TGTCTATACTTCTATTATTGATTTAAATGTCCCCTGTTCATCTTGCTTAATTATAATTTT
TGGTCACATGACATTTTTCAAGTCTGATGCATACATGCAAGAAGTGTGCAATTTTAAAAG
TTACTTCGTTGCACTAAATCTCTACTGATACACTGCTAAGTGTCTTATTCCTTCAACATA
TGGTTATACGTTTTACATTCATGTATTAAGGTCCTCTCTCTTTTGTATCAGCTACCCTAT
ATGTCTTTAACAGTGACATATACACATCTCAAACTGCCACGGAGAAAGATTGAAGCGTGC
ATACGGACTTGCTGGACAAGCTGTATTTTTTGGTATGAAGAGATTGGCTTTCTGGCCAGT
AAAATTATTTTTATGGTTCTGGTGCACTAGACGTTTGTTTGATGAAGGATCATCAGGCCT
CTATGATTGGAGGAGCAGGTTCCTTATCCATAGCAAACCCTTTGAAGCAGAACAGGCGCA
CCCACCCGACAATTATAAATTCTGCTATATACTCAGCGTCTACTACTAGTGTAACAAAAA
AGGGATATGCTTATAATATTTTATTTCTTATTGGCAATATAAGGTTATTTTTCTATTTAT
TTTCACCTTGATTTCTCTATTTTTTTCTTAATACTTACATCAGTAAAAATGTTCATCCAT
CTGCATCTGCTCTATTTGGGGTAAAATTTCACTGTTAATCTATTTTTTTCTTTCAGATAT
GTTGCTCTTAACATACTTATGAGGGCCATTACAGTAGATACACAAGCAGTACAGAGGCAC
AGGGTGTCAATATTGGAGTGTGTAAAGGTAACAATAAGTATAAATCTGTCCAATATGCTG
AGTATTTGTCTTCTACTGGGGTTTGGGGACCAATGTATGTTCAGTATCAGAATAAGGATT
CTTGGTAATTCCTCACCCTCCGGAGGCCCACACTTGTGAAAAAATCAATATTTTAGTACA
GTCCACCCAGAAAAAAGAGAAAATATGTTTTAACGTTACTTTATCTTCTTTGACGTTTGT
ATTTCTTTCATCATCTCTCTCCCCCCTCTCAATTTTGTGGAATCAAAACATGTCCCCATA
CAAGAATTGCCAGAAATGCGGGGTTTATTCCTTATGCTTCGAGTGTGGTTGTGTTGTAAA
TAACTTATCCCAATGCTTGGCATATTTAGTCTACAATCTTATCAGGAATCTCATATTTCC
CTGCTCCCTTGGATTAGATAGTTTCCTACTTGCTAAACATTGATTCATATTGTCTAGGCC
TCTGCTGGCATAGTAATGTTTGGATACTGTTGCTCTTTCACAGCAATATTTAATTCAAGG
TTTTACACTTTACTCATATATAAGTAACTCAAACCTTATTGTACAGTAATTCAGTGTTGC
AATCTTTCAGGCTGTAATTAACATTTCTGTTTATTAATTTTGGAACCTTAGTTCTGCTAT
TTTGGAACAGTAATTCTGGAACATATTGTCTAGGCCTCTGCTGGCATAGTCAGGCTGTAA
TCTATTCAGTATTACTCATGATGTAACATTTTCAATCACGTGTGCGCCTTTCAGGATGTT
AATGCCTCCATTCGCGAAAGGGCCCTGGAACTTGTTTATTTGTTGGTCAATGATACCAAT
GTAAAGCTACTGACCAAAGAGCTTGTCGACTACTTGAGAGTAGATGATCCTGACTTCAAA
GAAGATCTCACAGCCAAGATATGCTCCATAGCTGAAAAGTTGGTATTTCTCTATTTAGGG
GGGTTTCCTGTTGATGTAT