Map Locations of contig_129768 (2816 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_129768

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_3325 1 432 bp AK372883 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_3325






Contig Sequence (2816 bp)

>contig_129768 2816 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACGCAGAACTTGTTTGGTTGACATTGCTGTTCTTCTGATATGCAGGGTGTTGGTTATCCC
CTTGATATTGTAGTATGCAGTGCTTTGGGTGCAGATATGTATGACTGCGTCTATCCAACA
CGCACTGCTCGCTTTGGGAGCGCACTTGTGCCTGAGGTAGGAAAGTTCTTTCCCTGACAA
TCATATGCAATTCAAGCTAGAGGAACTGTGTGAAGCATTTTATTTTAGCACTGATAAGTA
TATCTCAGTCTTTTGCTTGAAACTTCCTACTGATCCTTGGCTTTCAAAGAACTTATCTTC
CATTGGCCTAATATTGGTAAAAACAGTAACATATGCAACCATAGTCCAATCTGAACCCTG
AGTTCACAATCTCTGTACTTTCCTAGCTCACCATTACTGCAACGGAATCACATGAGAGGT
GTGTCCGTGTGAGTGAGTGGGAGGGGACATTGTTTCTTCTAGAAACCCCATAAGCTGGAC
TTGTTCATAAATCATTTGATGGTGGTGCAACGGGGACCCTGGCATTTATGCTTTTGGATA
TATTATCTAAATTAACCATGCTTGTTGTAGAAGCAAGCACATTTTTATAGCAGGTTTAGG
CTTTAAGCTTATGTTTGAGGTAGTCTTGGTGCGAATCTACTTTATCTATCCCTTTAACTT
TAATTCTCATTGATGATTTATGTGTCATTTTTCTTCCTGTATCTCCTTAGGGTGTTCTGA
AGTTAAAACAAAACGCAATGGAAACTGATGAACAGCCCATTGATCCTTCCTGTCCATGTA
TGGTATGGCTTCAGCACCACTAGGAACAAAGTGGTAACTCGATTGATATAATTACAATCT
TTGGAGTTCTGTATAAAATGCTAACATGGTGTTCTTCTTGTTCAGGTCTGCAAAAACTAT
ACACGTGCATACTTGCATTGTCTTGTCACGAAAGATCATATGGGCTCTCAACTGTTGTCA
TATCACAATTTATCGTTTATGATGCGGGTACCCTGTCAATATTATTTTCCGATTAGTTCA
TTTTGAGCACCATCAGCTATTGTTTGATCACTCTCATTTCTGTTTCAGTTAAGTAGAGAT
CTCCACATGTCGATTCTTGAAGGACGATTTCCAGAGTATGTTGTCTCATTTGACATAAAT
CTGCCTGATTTGTCAGTGAAATAGTGTGTTGGTAAATAACGAAATTCTAGTGACATGTTG
CAGATTCGTGAGAGGATTCTTGAGGGTGCAGGTTTGTCTTGTTCTCCAATCTCTATTCTA
TCATATATGCTTGAACCAAAAATAGTTGAGCAACAAACTACCCCCTTGTTTCATCTGCTA
CCCAATCATCTACAAAGCCAAAAACCATACCCTCTTTTGTTATTATGTTTCTTAATAGTT
TAAGTTACCCGCAAACGCTAAAATCATGATGATGGCAGTTCCCGAAGGGCGACATGCCAA
AGTGGGTTCACAATGCAATGGAGGTTGCCGGCATTGACATATCGGAGTGTTTCAACCCTA
CCAACTGTCAGCATGACGCAATGGAGGCCGCTGGCGTCGACATACCGGAGTTTTGCCCGC
CGACCAAGTGCCCCTGACGCGGAACCCTCGGGGGAATTCATTCCAGATACCACAGTACCG
GTTGACGATAGGAAGGGTTGCCGCGTGGAGGTGATCCTTCATACTTAACATGACGCGTTT
TCACGAGGTTTTGCTTTAGATTGGGTTTCAGGTAAACAAGGAAAAGGTATAACTGTAGGA
GTGAACACAATATTCTGCCTGAATAACTTTTGTGGCATTCGTCTGCTTTTGTTATGCAAT
GTGCATTGCTTCTATTGTGGTCATAGAAGGGGAGGTGGATGCTTGAGCTATAGGTGCTAA
AGTTATTTTGAGAACTGAAAAAGTGAGTGTTTGCTTGTAAAAATGTTGTTGACATAAGAA
GCTTCATGACTCATCTTCATAGGATGTTCTAATCTTCTAGCCATGTGGTGGTAGTAGTAT
AGTGAGTGATGATTGGCATGTATTGTGTGAGTGCTTGGTTCAATTTATTTTGGTCCAGTT
ACTTACTATGTTGATATGTGAAGTTTCAGGAGTGCTAAACTTAGCATCTTGATTATTGAG
TATGGTGTTGTTATTGTCATAAATTCTATCAGTCGGCACTTTTCGCGCTTTTAGTGTAAT
TGAGGTGTTGGATCGAACATACAATTACTTACATCTGAATCTATTTACTAGCACCGCTAT
GGGTCTCCTCTTACATTATCGGATCACTTTTGACATCATAACTGTATTTTGTTTTTCTAA
TGTGAAGACTGTGAAAAGCAGTCGTTGCCCTTGTAGTACTGTTACTATTTGTGCACCGCC
CTTCTTTCATTTTAAGAATTTGTTGATGAAATTTCAGGTATGCAGCTGCCAATGAAGTGA
AGGAAGAGGTCAAGACCTTTGATGTGATGGAGAGGTTTAAAGTGGAAGCGGACCAAACTG
TATTTTATTCCCTTCTTCGTGCTCTTTGCAGAAGTAAAAACATAGAACATGCTGAGGAGT
TGCTTCTTGCAAGAAGAAATTTTTTCCCACTCACAGCAGAAGGTTTCAATATAATACTTG
ATGGTTGTTGTAACATATTCACTGATCTGGCCGAAGTAAAGAGAATTTGGAGAGAAATGT
CAAATTGCTGCATTACTCCTGATGGTACGGCTTATGCTCTCATGGTCTGTTGTTTCTCTA
AGGTAGGGAACCTTTTTGATACTTTGAGGGTTTACGATGAGATGAAGAAGAGGGGTTGGA
GTCCTCGTATTGATGTCTATAACTAACTTATTTATGTTCTGACAAGAGAGAATTGC