Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_128329 (1898 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_128329

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_3166 1 262 bp MLOC_3166.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_3166






Contig Sequence (1898 bp)

>contig_128329 1898 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAAGATTTCAGTTTTTTATGATGATTGTGTAGAAACTTTTGAAATACTTAAGAAAGCCTT
TATTTCTGCACCTATTGTTCAACCACCTGATTAAATCTACCATTTGAAATTATGTATGAT
GCTGGTGATTATATTGTTGGTGTTGTCCTAGGACAAAGAGTAGACAAGAAATTAAATGGT
ATCCATTATTCTAGTAAAACTCTAGATGGTGTCCGAAGAAATTAGGCTACCACTAAGAAA
GAATTTCTGGTAGTTGTGTTTCTGTGTGATAAGTTTAGAGATTATATTGTCGATTCCAAA
GTTACTATTCACATTGATCATCGTGCTATTAAATACCTTATGGAAAAGAAAGATGTTAAT
CCTGGACTAATAGGTGGGTGCTTTTACCTCAAGAGTTTAATCTGCATATTGTTGATAGAA
AGGGAGCTGAAGACCCGGTACCAAATTTTGTGCATTCCGTCCACCTGCTACAATAGTAAT
GGTCTGTCTCGCAATTAATAAGTAACAAGATGTGTCAGTTAGATACTTATATGTTGTCAT
GTTTGTTGTCAAGTAAGGTCTTGGCAGTACCATGGAGACAATATAGCTATCAGTTTCAGG
TTTCTGTCTCCTCTTTTCTGTAGCAGTTTGTTGAATATCTTTGAGATGCCCTTGGCACCT
TGATCATACTGCTCTTTACTTGAAGCTAAATGGTTGTTGCGTGATCAGTTAATACACCCA
ACTCTTGGTGTACCTTAGCTAATCACTACATATATATGAATTGCTGTCCTTGATATTTCT
AGAAGATCTTCAGTTTAATTGTATGAAAATAATATAAGAATCTCTACCTACATATTATGT
TCAGTGGATTTCATTACTAGAAAATATAACGATAGGACATCCATCTTGAACTAAAAGAAG
ATTTGACTATTGTTCATTTTGTACTCAATACGGATTACCTATTAGTTAATCCTCAATTCT
TCAAACTAGCAATTTCTTATGCTTAGCTAGACAGAAATTTTTATAATGTTTGGCCACGAA
ACCAAGAAACAGTATATGAAGCTTGCATCATAGTGTATACATTTTAGTACGATATGCAAG
TATCCTGAGCAAATGTACCTAATTATGCTCATTGTTCTTGTAGCAGGGCTATGTGGTTTA
TCGAAGGGTGCTTCGGTATTACTCAGGGGAAGAAGATGGCATTGGTAAGTACTTGGAATG
CCATACTTATGTCGTCTTATACTCGGATTATTTGCTCCGGTGCTATTGCTCACCTTTTTT
ATATTCTTATTAGATATGAGAAAGGCGCTATCACAAGATGTTGACAAGAAGTCCATCATA
CCACTCAAGAGACCAATAACACCGGATGAACTTGAATACGACTGACATGCTAAATTCTAA
CTATCACTCTTGATGGTTGTGTCCTAGTCGATCTGCATGACTTATATGGCAGCTCGACAA
GCTATTGTCTCTAGTGTTGTTGAATGAGTGATCGTGAATTTTCTATTTGCACATTCCTGT
TAAGTTTTGACCCACTTTTCAAGGTCTATTCACTTGGATCAGCGGAAGAGGAGCATCATC
AGCACAGGCAGAGGAGTAGCAGCAGCTAGTTCTTTAGGTACAATGGAAAACAAGCAAGCT
TATATCCGAAAAATGAATTTGCTAGGCTCAGAATTTTGAGTTGGCCCCTTTACATAAGTT
TTAGATAAAGTTTCAAGGTTTCTTTAGAGTATTTATTTGTGTCGTTTGGATGTACGGTTT
GAGAGAAGCTATCAATTTAGTTTGCTGTCCCGAAATATATGTTCCTGGGTACAGTATTTT
GATATGGGAGATTAGGCCCTGTTAGAGGTGGTATTAAAATAAAGTTACAACATGAAAATT
TTAGAGGCTGTTCTGTAGATACTTAAAACACATATCAC