Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_127690 (3296 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_127690

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_3082 1 934 bp MLOC_3082.1 Available Available None
MLOC_3080 5 3076 bp MLOC_3080.2 Available Available LOC_Os02g13130.1, FRAME:+1, EVALUE:8e-36, 13102.m01454 protein KH domain-containing protein, putative, expressed
MLOC_3081 1 617 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_3082






CDS Structure of MLOC_3080






CDS Structure of MLOC_3081






Contig Sequence (3296 bp)

>contig_127690 3296 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCAAGAAAGTTTGTATGTGCTATGTATAGTTTGGAAAGATTATGCATATTTCACATGAA
TCTATTATCTTTGGTTTGTTTGTATATATTTTCTCCCTCTGTTGACTCTTCAGGTTACAT
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CTATACTAGTGCTGCTGCATCAAGCTAAACGGCGCAAGGTTTTGCCCCTCAATATGGATA
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TACCACAACAACTGCCATTCCTGCTCCTGCTAATAGTGCCCCCCCAAACAAAAAAAACCT
CTCTGAATTAAGCTATCTGCTCCTGCTTCAGCTGCATTCTGGTTTCCTTGGTGCAGCCAC
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TTATGTGCTTGATATTGACACCCTCCTTCGACATTCTTAATATCCCTCCTTTCTAAACAT
GTAGTGGTGAGAGATAAACTTGGGTCATATGTGCAAGTTTAATAGTAATGCTTAGTCATG
CTAGTCGCATAAATCATAAGACTTGGGAAGAATCTTTGTTACTCATAAAAGTTATACAGA
AACCTAAGGGTGTCACTAATGCCCATGGGATGATTCTGAAAATATGGTTTTACAAAATGA
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GTGGATTATAAAATTTATGTCTAGTAAATGAGCATGGTGGTTACCATATTGGTGAATACA
TGGATCTTTAATAAACATAAAGCAATTTGGATTTAGTTAGGCAATTGTGATCTTGAACCA
AATTTCATGGTGAATTACGAGATTTTGATACATTTATTTCGTTCATTGTGATCTTGAGGA
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GCTTACATCAAATTTCATGATGGATTATAAGATTTTGGTTGAATTTAGTTAGGTGATTGT
GATCTTGACGAGCTAGTAAAAGACAACACACATAGCAACCCACCACCAGGCAACGGATAC
ACATCCGGATTTCCAAGGAGCGGAGGCGGACAGAACAGCGGATGTTGAGCCCCATA