Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_126228 (1386 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_126228

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_2927 3 570 bp MLOC_2927.2 Available Available None
MLOC_2926 1 272 bp MLOC_2926.1 Available Available LOC_Os10g08550.3, FRAME:+2, EVALUE:3e-32, 13110.m00738 protein enolase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_2927






CDS Structure of MLOC_2926






Contig Sequence (1386 bp)

>contig_126228 1386 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGTTCCTGCAGAGCACAGCGCATGGCTTCTACCCCTTCCGCCCAGAGTCTCGAGGGGTT
TTCCTGTGGTTGAGCCAGAAGTGTAAGGTTGCTAACTTTGTTGCTGCTATTGTGCGTCAG
GTCGATGTGTGCTGCTCCGATGGAACGTTCGCCAGGGCCGCCGTTCCCAGCGGTGCATCG
ACTGGTGGGTGTTCCTTTCCATTCCTATAAAATCCCACTTTGTGCCCAACTTGGTGAATC
TTTGAATGTGAAATCCTGTTGCCGTCGCTGTTGACAGGCTGTGTGTTCTTTTCGTTGAAG
CTAATGTTGTCTGAATCGTCCCTCTTGTGTAGATGTTTATGAAGCTCTGGAACTGAGGGA
CGGCGGGTCTGACTACTTGGGCAGGGGGTTTTCCAAGGATTCCATCCATTCCATTGAACA
TTATCGTCACATTGTTTAAATCTATGTCACATTTCCAAGGTTTGCATCCATTTTGAGCGA
ATTTTATCTTAACATGCTTTAAATCTGTGTCATGGTTCTTTGTGATTTGATATGACTGCT
TGTTATATTTTGTGGCCTTAATTCTACGCTCCTGTTACATTAACAATACTTTCATCAACT
TTCACATTAACTACGTGCTTAGCTTGATAACTTGTCCTCCCATACTTATTATGTGTACCA
AACAAGTGATAGTGTAGCTTCTGAATTATCCTGTTTTGGCACGATATGTTATTGTGCCAT
GCTGGTTTCTGCATTGCATTTCTTTTAATATACCCTGCGATTGATCTGTTTTTTCATCAC
CTATTATTTCCTTAATAATAAACCGAATTGCTGAAGACTGCCATAAAACGAGCAGCTGAT
GATCATTTAGTGGACGTTTTGTTAACTGCATATTAAACCTGATGTTTAACTAAATAGTAA
ATATTCCGGTGATTACTATTGTAGGTGGCACTTAACTGTATATTCCCATTTGCATCTACA
GTTTAGTTCTTGTAATATTCACATGTTTTTGCTGTTCTGCTACAGGCTGTTAGCAATGTG
AACTCCATTATTGCGCCCGCTTTGATCGGCAAGGTTAGTATTGTCTTTGCCCCCTCTTTC
TCTTTTCATGAGATTTGAATGCATAATTTATTCAGTGATGTATTTCCTTCTACAGGACCC
TACCGCTCAAACTGAGCTCGACAACTTTATGGTTACTGTGATACATACTGTGTTTTGGAT
AGATAGTTGGCCAAATTGTAGCATGTTCATGCCCACGCAACCTGCTACTAGGGGTTGGTG
TTCTTAGTTTTCTACTGGTAATAGGTGGGTGATATTTAAAATGCCAACAACATCAAATCT
TCTCCTAGTTACTTGCATTTTTTTCTTTTTGTCTAGGTGTGTGGACAGTGATACCCTATT
ATGTTT