Map Locations of contig_123519 (8939 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_123519

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_2633 1 787 bp MLOC_2633.1 Available Available LOC_Os01g13950.1, FRAME:+1, EVALUE:8e-20, 13101.m01535 protein OsGrx_A1 - glutaredoxin subgroup III, expressed





CDS Structure of MLOC_2633






Contig Sequence (8939 bp)

>contig_123519 8939 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AACAAGAGGATCACCAAGGTGGTGTCGGCGACGATACGGTTAGGGCGATTGACGGTGGTT
AGGACGGGGACGGAAAGGCACTAAGTAAACCACACCTACACATATGCAAACTAAGAAGTC
AATTTGAGCTCAAATTGCATATAAATAAAATAAACTCCCACATAATTACTCTAAAACTAA
AATCCACAAATCACTATTATTATAGAGCATTGCACGATCTAATCTAGCAATGANNNNNNN
NNNNNNNNNNTTGCTAACCTTTGTGAACACTTGGATGGATGGTGTGATTCAAATCTTGAC
AAATCTAGGAGGAAATTGAGGATGAACTCGAGAAAGGGAAGAGAACACACGAGAGAAAGG
AGAAAACAGAGAGCTTCGACTCGGGCTGGATGAAGCAATACTTATAGTCATACTTTTAGT
CCCAGTTGGTGATACAAACCGAGACTAAAGATATTTTCTAGTCTCGGTTTGGATTACCAA
CCGGGACTAATGGACCTCGCAGGGGCCCCAGCCTGACGAAACACTGCCACCACCCCTTTA
GTCCCGGNNNGTAACACCAACCGGGACTAGAGGTTCCTAACAAACCGGGACATAAAGCAT
GCATGATGAACCGGGACTAGTGGCACCATTAGTCCCAGTTCAAAAGCAAACGGGACTAAT
GCTTCAAACCAAAGCCTTGTTTTCTAATAGTGTACCATATGCTCTATCTATCACACGAGG
TTACCTCGATAATTAAGATTATAATACTCATACAAGAGCTTTGGAGTTTTAGTGACTACA
CCTCGAGAATACCCAACAATTGGATTCCTATTATCGTACTAAACTTTTATATCACTAATA
TTCAGAATAATACTTCACCTTCTCCTTGCTCCTAGCCTCACCATGACTCGTTCTCCATGA
TCCTGGGTACGTGCACGTATAAAAACGAGGACAAGATAGGAGACATCTATGAAACAATTT
TATGTCATGCATGCATGACGTTCATTCAAAGCTCTTCCATTGATCCTCACAACATATATA
GGGTTGCAAGGCTTTTACCTCAACCCAAACCTTATCGAACTATTCACACATGAAGATGGT
GGCTATGGAGATGAGATGTCAACGACTAGGGTTGAGGAAGGGGATGATTATAACTCTGTT
GTGTAAGACTTCCACTATGCTATATGTTCTGTTGATATTTTTGTTTGGTCCCCTTCATAA
GAGTTGTTCGAGTGGATGATCTACCTCGGTTTCCATGGCATACGTCCCCTCATACAATTG
ATTGCGATCGCATGGAATGTCGTCTTTGGCTCTGGCACCTCTGGTGAGTCTCTTGTTGAT
CTCCTCTATCTTCTCCTTTATTTCTTTCCAGGTATTGACTTTATTTTGTCCATTTGTAGT
CTATTTCTTCTAGATTAGAATAAAAAAGGATTTAAGGGATCCTTTTCCTTCATTAGTCAT
TATTACCAATATTCGAGTGATTATCTTGATTTGGAGAAATATCTCGGTTTCAAAAAAGGT
GGACCACTCATCACTCACTGTCGCCATCGTGCATGGTTGGGCAAAGCTTGGCTAGGGATG
ACGGCAGTATGATGGTCTCTTCTCCTTCCATACAGAGCTGATGCGCGGAAGCACTCATTG
GGAAAGTTTCCAAGTGAAAGTTTTATGTTTCTGGCGCCTACGATGGAGGCACCCATGAGC
GTCGCTTGCTTCCCGAAGACATCGTCATGGGTCTCATCCTTGTTCAACGTTTCCAACTGA
AAATGCTTATCTGTTTGTTTATACTTGGTAGCAACGATGCTTCGCATCATCACACTCTTG
CGGGCGTTGTCATGGAGCTTGGGATCATGTTTGTCTTTTCATATACTTTGTTAGAGGATC
TAGCCATCACATTGTATCATTTAGCCGTGTAGTTTACCATGTTGTTGCTTTATATATAAG
CGGGGGATAAATCCTCTTTCGAGTGCAAATCTCTAATACCCAATTTTTCAGCGGTCGATG
TGCCTAAACTGTTGAATTTTCATCCAATGTCAACCATGCATTTTTCTTCCTTCAGCACTC
CAATTGACATGCCCCATCTTGTGCCGCCTGAAGTCCGCACTCATCCCTGGGAGCGCTTTC
TGTGTGCAACTTGTTGCCATGTCCTATCCTCGCCGCCACCTCTGTCATGTTGTCACTGTG
ACACCCTACCCTCTAGGCCTCGTTCTTCTACAACTCCAACAACCAGCCCCCACCCTGCAC
ACATATAGTCAACCTCTTCCCTTCCTCTCCTGTGTCAACAGTGCCGCGGGAAGCCGTGTC
TCCTCTTCCTAACATCCGACTTGTTACCGTGTTGTAACAATCATGGACACCTCCTAATTA
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CAACCCCGGTTTTATCCATTTATGGCAATCACCATGCAACTCACATGCTCTAGGTGCGAA
AAGTGGGCCACGCACGGCTTCCTACCGCGGTATGACAAACATCGACATTGGTCTCTAATA
TTCTCCCTCTTGTTTAACCAATGGTGGCTCCCAGCGCAGAAACTTAACCCACATGATGTT
TTTGACCGTGTCACGAGAAACATCCATACCTATCTCCCTATTTAGCCTCCTCTGTTAACC
AATATTGGCTTTCAGTGTGAAAATCCACATGCAGGTTGCGACCGGATAACGACAAAAATC
ACTGTCAACCCTTGTTTTACTCGTCTCTAGTAACCAACATGCAACTCCCATAGCTCTAGG
CGCGAAAATAGCGAACCACATGTAAATTTCAACCACGTCGCGACAAAAATCCACGTTGGT
CTCCCACATTATCCCTCTCAAGTAATAAATATTCACTCCCAATGCACAGACGTAACACAC
ATGCGGTTTTTGACCACGTCGCGACAAACATCAACGTCAGTCTCCTGAAATAGCCCTCTT
TGGTAACCAATATTGGGTTTTAGCATGTAAACACAACGGACATGTGGTTTTCAATCGAGT
CACGACAAACATCAATATGATTCCATGCTTTATCCATTTCTTGCAACCAACATGCAACTC
ACAAGGCTCTAGGCACGAAAAAGGGACCCATATGCGGCTTTCTACTGCGTCATGACAAAC
ATCAACGTCGGTCTACGGCGTTATCCCCTTTCAATATCCAATATTGGCTCCCAGCATGAA
AACGTAACCCACATGTGGGTTTCAACTGCGTCACGAAAAATACCGACATCAGTCTCTCGT
TGTATCCCTCTTTGGTAACCAATATTGCCTATTAGTATAATAACTTGACCATCTTGTGGT
TTCAACCGTTTCGCAACAAGCATCAATGCCGGTCTCCCTCTTTATCGTCATCCTCTGATA
TCAATATGCAACTGATATGCCTCTCGACATGAAGACAAAGCATACATGTAGGTTTCGATG
ATGTCAGGCGGAACATCGACATCAATTTCCCGTTTTATCCGTCTTGGGTAACTCATGTCG
GCTCTTAACGTGAAAACATAACCCACGTGTATTTTTCGTCTTTCGTCCGTGGTGTGACAA
ACAACACGTCAATCTCCCACTTTATCCTTCTTTGGTAACTAATATGCAAGTCCTATGATT
CTCCACACACCAACGGAGAAATTATCATGTACTCGGGGTTGTTAGCATGAGTTTGCACCA
AGAAAGGTATTTTATTTGCATGCATAGGAATATGATGGATTGCAGATAAACCAACATCGT
AACCAACTGCTCTGCTTCTAAAATAAGAAAGTAAGAACAAATTACCACAGAACATTATGT
TAACATTACGATGAGCAATAATCTTGCTAAATGCCCTTTGGCAGCACAAAAGTGTGGTAG
ATTGTTCGGTACCTTTGGATCAACACTCCAAGTAAACTGAAAGTAAGATGATTTGTCAAG
AAAATTAATAGTTAGAGCCAGAAGGCTAAGAACCCGTTTCTTTGTATAGCTGGCGCCCAT
TAGTTAGAGCAATAGGAGCACACGATGTAAACGGCGACAGCATCCTGGTTTTCAAGTGAT
CATGATGGCAGTGTCGTCCGCTAGTTAACTTGTAGTACGTGATATACGTGACGGAAACAG
TCTGCTGGCCTTATGCTAGTACTGGATCGCATGGGTGTTTCTTTTCTTTTAAGAAACGAT
ATGACACGTTCACTCACTTGGTGATCAAAAAAATTATGGCTGGTTCCGAAGATTGGATGT
TTCGCATTTGTATCTTGTTTCTTTGACAGATGTTTCTTTCTTTTGTATTGGAAAGACAAT
GGTCTAGTAATTTCCCAAAATATATATCAATTTTTAAGATGCATGACTATGAGCCACAAA
TGGTTAAAACTAAGAAGAATCAGAATCACGTGAGTGGGCATGTGGTACTCCTGCCCTGTC
CCTCAGGATATCTGTATCAAACTACGGATTTGACGTCATGTGTGTGTGCATGCCATAGAC
GTCTCTATCAGCAAGGAAACGCTGACATGTGTCTTTGATTTAACTTGTAGTGAGTGTGTA
TGAATGACAGTGTGTATTTGCTTGCGTACAAGCATTATATATCCGATATTCCCAATATTT
TTTATGATTAATACGTGCAATTAAGGAGTAAAGCTCCATGCATACGACATGTGGCACGCC
AGGACAAGGAAGCTGACCTAACGTTGCATTGCTCTATGCACCCCCAAACCCACATCTCTC
CCCCACAAGTACACACACCCCTCACCTCAGTCGACAGTACTGCTCGTCAAACTCGAACGC
TAAGTTAAGTACCATGGCCAGCAGCACCAACGACGTGCGGAGGACAGTGCGGGAGAGACC
GGTGGTGGTGGTGGGGCGGCCGGGGTGCTGCTTGGCTCTCGTGGCCCAGCACCTGCTCCT
GCGTCAGGGCGTGAACCCGGCGGTGCTGGAGGTCAGCTACGACGCCGACCCGGCGGCGCT
CATCTTCGCGCTCCGTTCCAAGGACGACAACACCAAGTTGATCACCGACGTCGCCTTCCC
GTTGGTGTTCATCGGGGGCAGGCTGTTGGGTGGGCTGGACCGACTCATTGAAATGCACAT
CGCCGAGGAGCTCGTGCCGCTCTTGAGGCAGGCAGGAGCCCTCTGGGTCTGAACCGACCT
TGCTTCATGACCCGCTGCCAGTTAATGCATGCCAGCCTGATCGGTTATAGTTAAGCTTCC
ATTCCATGTGTGCGAGTGATTTGTTTCCTGCTTTTTTCTTCACTGTATATATGTCCGCAT
GTCATATACTCCATCTGGTATTGTAAGCTCCCTTTGTCCTTCAAGAAATGGCAAATAAAC
CCATCGAGTTTGTTCACAAGATCGACCTGTGAAAAAGGTATTGTAATCATTATACCGAGT
TTCATTTCGTTTTATTTCATTTTTGCGAGGAGACTTTCAGATTGTTTTTTTTCCTTCCAC
AAAAGCTTTCAGTTTGTAGAATAGGCTCGAGGAAGTCATGAATTTTGTGAGCTCTTATCT
TTTGCAGGCTCGTGTCATGACTGCTAGGTAAAGGTTTGTTGAGGCCATGTGTGCGTGGAC
CGAAGAAGACCAATAATTTACTACTGTCACGGTCACTTTTTACGTCGGATATAAGATTTG
TCTGAAGTTATACTTTGTAAACTTTAATAATACATTTATAATACTAAAGTTATACGATAT
GAAATCAAATTCATGATGCATTTAATGATATTGATTTCATATTGTGCATAATAAATTATT
CTATATGGTTGTTTAACTTTACGAAATTTAACTTCAGCCAAATCATATATACAAAGCAAA
AATGACCGGACGAAGGAGCAAAAAAGACAATAGTTACAGAAAAGGTTTTTTTTTTATCCG
CCGAAACATTTTGTAAAGAAAGATACTAACTCTAAAATACTAAGGTTATACAATAGGAAA
ATTAAATTCATGATGCATCTAATGGTATCAATTTTATATTGTGAATGTTAATATACATTT
TTATATAGTTGATAAACCTTACAAAGTTTGGTTCCAGACAAATCTTATGTGCGAAACAAA
AATGACGGAGGGAGTTACAAAACAAAGAACAAACTGCACCGTTTCCAGCAAAATTCGGTT
GTTGAAGCGAGATAATAGTTACGAAAAGGTCTATTTCTAACCGGCGAAACATTTCAAAAA
GGAAGAGAGTTCAGGAGTTTGACCCCATTACCTGTGGCGGGTCGTTTTGGGGACAATTAG
GAGCCTTGGCCTCCCTTTCCTAGAAGAAAATTTGCCAACTAAGTCTATTTTTCGGCTAAT
TGCTCTATTAATTCTCCGGGCTTTCTGATGGCCCTAGCCATTTCTATGCCATATTCAATC
ATTTGGTCCATCCTAATATTTGGTTCACGCTCCGTCACTACCCATTACCGACGTTGTTTA
ATGCTAGTTTGGACGTGCGCGTTGAAATAACTATTCAAAATATTATGTTGGTCGGCAAAA
ATAACTAACATTATGTTATTATATTGGTATCTTATATAACAAAATTCGGTAAAGGGTAGA
CTACATTATATTAGCTTGAAATAAAGTATCAAGGAGATACACACGGCTAACACCAAGAGA
CATAAATATCCCATAACTAAGTTACAAAGTCAAATAAGACCGAAATTATTTCTTAATGGA
ATAAAAAGAATAGAAAAAACACCCAAGCATTGAAAGCAATGATCAACAATAATTAGTGCA
AAAAACGCTAGTCCCGGCGTTCTAATAATTACATTTTTAGAGTGAAAAATCGTCATCACC
AATATAACGCCATTCTTAACAAATACCGATGACGTCTAGATCCTACACCATCATGTAAAA
TAGCAGTGGCATCACATATGTTACCATGCTACCACTATACCGGTACTACTAGTGAGCTGC
ACACTCGCTCACACACCACCACTAAAAACTTCTGAAAACAAAAAAGGGTTTGAAATGATT
ACGAATTTCACTATATATACACTGCTGAGATCCACAAATCGAAAAGCGTATTACAAAGTA
TGACTTAATGCGTCAGCCACACATTCCAAAATGCTTATCGAGCGTGTGGAGCTTCAATGG
CATCCAGCGGTCAAGGAGCAGCAGCTCGACCAGTTGTAACCGAGAAATAACTTCTCATTA
ATGAAAAACGAGGCTATAGTCCGGGTTGGTAAGGATCTATAGCTACGGTTTATCAATCAG
GACTATTACCTTGGGACTAAAGACCCCTCTCCCCTTTAGACCGGGTTTGCTACGAACCGG
GACTAATACCTTTTCACGTGGTTGGATGCGTGCGTGTCGTGGCCGGGATCTTTAGTCCCG
ATTGGTAACACCAATCGGGACTACAAGCTTTGATTATTTTGGTTTTTGGCGTTTTGTGGT
TTTGGGGTTTATTGTTTATTTTTTGCTTTTCATTTTCTGTTTTTCATTTAATTTTTTTTC
ATGTAAAACATATCTTACGCTAGTACATACCATACACGTTAGCATATACAATAGGATATC
TCGTAGGACCAATCATATATCAAAGAATTTCGAGAGGGACCATATATATGCATGCGCATA
TTATAACACACAAAAACACACACACATATATACATACATATATATATANNNNNNNNNNNA
TATATATATATATATATACACAATTTGGTATATACAATTTCTCCTACAATTTCCGGATCA
ATTACACGCATACATTAATAGGTGAAGTGGAATTCTCCTTTGGAATCCTGAAATTTCTCG
TATGTGTTCAGTTCGGAGGATTTCTTCCCGCTTCTCCAACATCTTTTAAAGAAGAAGACC
AATATGAATATTTTATACGTGCGTATATATATTAGACCATGATATAAAAATTATGAATAT
TGTTTACGTACCTCAAGAGTTCCTGGATTTTTGATCAGTCGTTCAATTATAAAGCGAATG
GTCTCGCAAACATAGTATGCACATAGATTAATTATTCCCCGATTGCTGCCGCATGCAATG
CTTTATGAGAATAGAATTTAGTCAGATAATAATCAAGCATTATAATGATACTGAAACTAG
AACTAAAGATATGCGTGGACGTAGCTAGTACTACTTAATTATCCTGGACGTTGTCCACCG
TAGCTTTGGTTCCCATTCACCACGAACATTCTTGATGAACGGGCTCCAAAACCTGCCCGG
CAAAGAAAAAGAATAAAAGGAGTCATTGATTAATTGATATGAGGAAATGAACTAAAGAGG
CCGACATAGTGCGATGATGATTGAAATTACCGGTCGAGGATGAGCTTCAGGGACATGTAC
TCGTCCTCGTCTTTTCTTAGTGAGTCCATTACGTGAACGGTTCCCTTGTCAACCGTAATT
ATTAGGAGGATCCAGTGGAATCTGTGTTTTATAAGCAGGCATGCATGCATGCAACTCATC
AAGCACTATACATAAACTTACATCGATCGGGTAAGCAAAATATAATTTATAGTACAAGAG
AGTAACAGTTACCTGAAGTTGTAAGCAAATAATATTTTTTTCATGTGACTTAGTATCTCC
AAAAACAGGAACAAGTGATCCTTTGTATCTTTTGGGAATTCTAGTATCGCCTTGTCATAA
ATGCAATTTGGATCAATGAAGCCAATGCCATATGCTCCATCTTTTTTCATTTCAAACATC
TTCATTCTACATAACACCACACACAAAAGAATATAGTGAGGATAATTACAGGCAAATGAA
CGAGAAGATGAGCTAGGGACTTGAATTACACAAAGAAATCACTTACAAACAATATCAACT
GATGATAGATTTGTCGAGTGCATCTTAATTGTATAGCTGCTATAATTCTGGAAAGTCAAA
CCACAAATATTTTGCAGTGAAGACATACTCTTCCTTGACTTTCACCATCAGGGATGTACC
CCCGAGTTCTGCTTCCTTCATGTACCAGGTATGGAGTCTGTACATTTGCGTTGATAGTTG
CTTGACAAGCTCAAGCCTCACGAGAGGTTTCTTGGGTTGAAATGTCCATACTAGTTGGT