| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_123199
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_2595 |
2 |
1291 bp |
MLOC_2595.1 |
Available |
Available |
LOC_Os08g22864.2, FRAME:-1, EVALUE:8e-63, 13108.m02337 protein sec8 exocyst complex component specific domain containing protein, expressed |
CDS Structure of MLOC_2595
Contig Sequence (4969 bp)
>contig_123199 4969 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGGGTGGCGTTCCTTTCGAGCGTCTCTTTGATCGTTCTCCCGATTATTCGGCGCTTCGTT
TGTTTGGTTGTGTTTGCTATGTTCTTCTTGCCCCCCTCCCCCCATGAACGCACCAAACTA
TCCGCTCGGTCAGTTGAGTGTGTCTTCTTAGGTTATAGAGATGAGCATAAGGGCTATCGA
TGTTAGGATCCTGTCGGTCGTCAGATGCGTATTTCTTGGGATGTGACTTTTGATGAGTCT
CGTCCCTTCTACCCACGTCCATCTTCCTCGATCTTTGCAGTGTAGGATATATCTTTCCTC
ACTTTTCCTGACACACTGCTCCCTCCCGTTGAGCCCTTGCACGTCCGTCCTACTGCCCCT
GCTTCTCCACTTGTTGCAGATTCAACGCCATCATCTCCCATGGTTTCCTCACCTCACTTG
TCACAGGATTCTGCACCTTCATCCCCGGTGTCTTCTTCGTCACCTTCGTCTATTCCAGAG
ATCCCTCCTCGTATTCTTCCCTCTTTTCCTCGGTATTATACTCATCGTCCACGTGTTGTG
GATTTCTCTACTGATGTGCCATCTTCCTCGTCTCAGCCTAGTTATGGCTTGCGTCCTCTT
CCACTTCCGCCCGTTGATCGCCTTGGTTTTCCGGAATCGTCATTGGTTCTGTTGTTCTTG
AGCCAACGTCTTATCATCAAGTTGTTTTTCATCCCGAATGGCAGTTTACGATGGCCGAGA
AACTTGCAGCTCTTGAGCGCCCGTCACGTAGTATCTTGTTTCTCTTCCTCCCGGTGTTCG
TCCCATCACTTGTGGGTCTAAAAGGTTAAGGCCCACGCTGATGGTTCTATTGAGCGTTAC
AAAGCTCGTCTTCTGGCTCGTGGCTTTCAGCAGGAGCATGGTCGTGATTATGACAACTGT
TCGCACACTTCTTGTCGTGGCCTCCGTTCACCACTGGTCTGTGTCTCAGCTTGACGTTAA
GAATGTCTTTCCTAATGGTGAGCTGCATGAGGAGGTTTACATGCAGCCCACACCCGGGTA
CTTTGTTCCTGATGGTATGGTATGTCGTCTTCATTGCCTATACATGAGAGGTTTCCTGCA
TATTTACCACCTATACATGTATATATATATTGGCCATTGGCCCTCAGGAAATACAAGTTG
CATATTCCTAACAGGTGCATGACAATATTATTTTAGTTATCTTGTTGATCCCATGTGTAC
AACTATTGCTTTATGCACGGAGGTACTATCCTGTTGACTTCGATTATCCCAATTGTGATG
GATATTTAGCTACATACAAAGGGCAAAAGTACCATGCATCGGAATTTCGCTAAGGTCACC
ATCAATGGGAAAAAAGAATGATTTAACTTTGCACATTCATCTCTACACAACGTTATTGAG
CGTGCATTTGGTGTGTTCAAGATGAAATGGCATATTTAACTGAAAATGCCAAGTTACCTA
TGTGAGAAGCAAGTTTGGATCATTATTGCATGTATGGCACTTCATAATTGCATTAGAGAA
ATCCATTTGAGAGACTCAGAGTTTGATAAATGTGGTCGTGACGAGAAGTACACGCCAAGC
AATTTACATCTCCAACCCATAGGCCATGTTTCCAACATTGTGGTTGGCGATGATGCAACC
ATGCAAGCAACACGTGAGGCGATTGCTAATGTATTGTTGGCGGATCAAGTATAGTTTCAC
ATATTACTTCATGAGATTACGATGATAAGTATGTATTTTGGATGATATGTGTACTAAATA
AGACCGATGCTTGGTGCATATTTTGGATGATATATTTCGTATGTAAAGACTAACGGCTGT
TGCTTATTTTGGATGCTATGTGCTATATTCATTTTTTTGGCTAATTTTTACTTTATTGAG
TCAAAACAGGTAACATGTGCTTTAATCTGCATATAAACATCATAGTAAGCACTCCGGGAC
GTTACTGACATTTCATAACGCCCATAACTCCTACAGCTGAGCAACAACAGGGTAAACAAA
CAGCCAGATTCTGATTCTCAGGAATCCAGAGCCACTGCTGATTCTCAAGAATCCAAAGCC
AGAGGATTCTCAGGAATCTGTAGCCCAAACAAAGGGAGCATTAGGGCATTGCATGTTTGC
TATATAGCCTAGGATATACACATATGGCCCTAGTTAACCTCTCGATAAATGGGTTATCGA
TAAATTCAGTTAAATGGTCGTTTCGCCAATTAATCCCTAGCATCCGACCGGTACGGTACC
AGTCACCGGTATGCTGAACATTGTTATGACTATTTGAGCGCAAATTCCTGTCAATACCAC
GGTTCTATTTATGAAGAACGTCTTATCAGCTGATCTAACTAGAGGCAAAGAACAAATAAA
CAATATGCATTCCTATGGCTTGCTTGTTGGCAAATTTGGACTTGCCCCTTCGTCATGTCT
ACGCTGTTGAATTTAGCTTTTTGCAAGTTGCAGGGCTAAACTGATCCCACCAGCTAAGTC
CACAGGTTCCTAGTGCAATTTACTCTCTTATATACAATTTGGCATTGTGGTAACTTTTCA
CAGGTGCTTACTTATTTCCATTTGGATATAACAGTTAGTTGAACATTGATTTACTTAAAT
TGGTACATACTCCCCTATGTAATAAGATTCTACAGTACGTCAGTAATAACAATCATAGGT
TGGCCCTAAAGAACTGTAAAGTTGTACTCATACTAACATGGGCTGGCCTACCTGAGTTGT
AAGTGAGATGATGAAGTCATCAGGATCTTCAGCATCTTGATCTTCTACATATTCTCTTTT
TGTCATTTCCTGTTCTCATATGTTTGCATGAAAACTATTGACATGACATAAATCCATCAA
TAACAACAGAGTAATACCATCAGAAACTTGATTACTATTACCTGCATGTGATATATTGTC
TCCAACTGCATTTCCAATCTCAAGACTCTAACACAATCGACTGCTAGCCTTCTGTACTCA
TTAGCAAGAGATGCAAGGCTTTTCGGAATTGCGCTAGTTGTGCGAGTATGGTGACTTTGG
TGTATGTCAGTTTTGTTTTCTGAGATGGTAGATGGACTTATAAATGACTCGCCAAGCCTG
AAAATTCAAAGGAGGCAAAACCATAAGCATGCACAAGAATTCTCGCAATGACAGATCATA
AGCGATGATACAACCAAGAAGATCAGCACAGAAAAAAGGATCAAGTATATGATTGCTAAC
TATCCTTTAATAGGTTGTGACAAGAATCAGATGTATACTTTAGCTGGAATGTGTTGATAC
TTTCATATTCACACAATGTTCTAGTGCACTAACTGAATCTACCTTATTTGCCCTTCTGGT
GGATATCAGTGGAACAGTACTGTAGTTCAACAAGATGGCTAGCTAAACGAGTGAAATAAT
AGGTTTACCTTTCAACTGAATCTGCTAAATATTCCAAGGAGTCGCTAAGAGATGCCAGCA
ATATCAATTTCTGGTCATCATGGATCAAATTTTCCTGCATACCAAGATAACAGTTAACAA
TTAGCATGAAGATATTGTCATCATATACTACCCAATGTCTCTCACATTTCAAGACTATAA
TGATGCCTCTTGAAATAAAAAAAGTTCAGATTAATCTTTCCATAGTACTCCCTCCGTTCC
TAAATATAAGTCTTTTAAGATATTTCAATAAGGACTAGATACGATGTAAAATGGGTGAAT
CTACACTCTAAAATATGTATATATACATCAGTATGTAGTCCGTTAGTGGAACCTCTAAAA
AGACTTANNTTTAGGAACGGAGGGAGTAAATATTATGTATAAGTATGTAACTTATTTCTT
ATATGATACTGTATTTAATGCATGTGCTTGAGCTCCTCAGCCACAGGAGTGCTTAGGTTA
TATGCAGAGATCTTTGGAACCGAGTAGAGAAGGTAAACATCAAATCAAATCAACGTGTGA
AGTTGGTCATCTCCGACTATCTTTCAGTCACTACAATGCATAGAACTAGTGTACATCAGC
ACGAATGATGAGAAGGCAATGACGTGTAGGTTCATAGAATCTTGACCCCACATGTAATTG
GCAGAGAAGAGTACATCTTGATTATATAATATCAGACAAGACACGTGGGTCTGTATAACC
AGTTAAAAACAAAACACTGCATGCATATTCCTCTCTTTTCTCCTGTTCTATTCTATTCCA
TCTACCATTCATTCAAATCCAGAATTCCTCTCTCATTTGTTTGACCCTCACTCCAGGACA
TGTTCGCTGCTGGTATGCTCCTTCTCCACATTCTACAAGAGGCAATTGCCTAGAAAGGCA
GGCCATGTGAAGTGGCTATTGGGCCAAAGTGGGCTTTCTAGATTAGCAGCAATTTTGGTT
TTCTATTTAAGAGAAAATGTCTCGTCACTTTTACAACTTGTAAAATGTAACGAATCGGCC
TACCAAATGGGTAGCTAGTGAATCAGAGTAATCTGATTCATGGATCGGTTATCAGATTCG
CGAACCAGAGATGTATAGTTTTTTTTTTTTTGAGAAAACTCCGCCTATGTTGAAAAGATA
ACTCCACCTATAAAGAGATTCTTGTGTTTCTTTGTATTGAAAAGATAACTTCGCCTATGT
TGTCTCAACATAGCCGGTCCCAAGCCCGTGTAAAGGAGGAGGGTTGTGATAGGCCTGGCG
AGCCAACGTCAACACTCAGCCACTCTTATGGAGATGAAAGCCAAAAGATTTTCGTTGGGG
CGTAACCCTCTCAGCGACGCGCCACATCGTCAAACCCAAAAAAAAATCGTTGGGGCGTAA
CCTTCTCAGCGACGCGCCACATCGAAACCCGGGTGTGGTGGAAAATGGGCAAGGGTCGGG
CCGTCACCCCCAGGTGGCGTGCCGTATCATGATCTGGATACGGTGGCAAGTGAGCGAGGA
TCAAGTCGTCGCATCCTTAGTGGCGCGCTACATCGGCGCCCGGGTGTAGTGGAAAATGAG
CAAGGGTCTTCGCATTTGACTCGACAAGTGTGAAGGGTAAGGAAGCTAG
