Map Locations of contig_122497 (6090 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_122497

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_2518 1 1013 bp None Available Available None
MLOC_2519 2 725 bp None Not available Available None
MLOC_2520 1 219 bp None Available Available None
MLOC_2517 10 2717 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_2518






CDS Structure of MLOC_2519






CDS Structure of MLOC_2520






CDS Structure of MLOC_2517






Contig Sequence (6090 bp)

>contig_122497 6090 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCTCTAAAGTTGGTTATCATTGTACTCATCAAGGTCACCTCCTCATACCTATTTTCTTGC
TTTCTTCACCAGGGATATTATCTTTTTCAGCAAAGGCAAAGACCCGACTGTTTTTGTGTG
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TGCACGTGCATGCTAAGTAGTGTAAAAAAAAACACAAACCAGCACGCAGAAGCCACTCAA
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GCCGTATTTGAATTTATCATTTTTTGTTTTTTAACAGCCACTGTTCATCGTCGATTCGAT
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GTACATACTTTAGCGCAGTTAACAATTAATTCTGCTTTTTCGGTGGTAATTATTGTAAAA
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AAAAACTATAAGTTATTCATATTTCTTACTGTTCCCATGTTCATATTGTTCCAGTCAAAT
CAATTGTGTAAATCTTTCCATGTACATTGGCTTTGTCAGGAAAGGAAGCAGATTGCTTGG
GAGTCTTCTTCCAAATTCATCGATATGTTTATGGCACTGTCCAATAGCCTACAGTGGTAT
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TCTTGCTGAATTTGAACAAATGTTGAATGAACCATGTTTGGCTGTTTTGTGAGTGCCAGT
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TGGACATCATGCTATTTTCTAATATATGTTTGATCTAACAGTTTTTACTTGCATGGCCTG
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TTAAACTATTGTGTAAAAGCTACAGTGATGACACCTATGGACCAACAGCGTGGAGCACCA
GCACATTTCCTATGCACTTTTAGACGGCAGTCTCATCAACAAGTTTCCCTACATAGTGGT
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GACCTGCATGAAACTTCTAGATAGACAAAAACTTATGCTAGCTCAACTTCTCTCCTGATT
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TTGTGCTTCTCATCCAATCTTTGTAGAACTCTCTTGATGTGCGATTGTGCACTTGTTGGA
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TGTACTTTATTTAATGGGCCTATCCTGAGATATGCGTGCTTCTGGCAAAATAATGCATCA
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TGACGACCAACTGTTGACCTTATAAATTTGGTCAAAAAGGTCAATAAACGACAACAATGA
CGAATCAATGACCAATATAGAGAGTCGTAATTGACCTTATTTCTTGTAGTGTCGTTCCAC
CTTCGTTGGCCTTTGAGCGGACGTGCTTAGTAGCCAATAAGGCTCCTTCGTTTGTCATAG
CTCCAGTGTCAACTTGGCCACTGAATAGGGTTGCATGGCTGCGGTGGCGACAACGTCTCG
GTTGGCGCGCCCTTGGCACAACTTCATTGCATAAAGCATCCAAACTACGGTGAAGCTCCG
CCGGGATCATGGTTGGGTTGACTAACATAAAGGCTGGGGCAGATCTCAGGGATCCATAGG
TCTCCCAACCAATATGGGCTGGTTGCTGGAGGCGGTTGCAGCTTCACTACTTGCCAATGT
CGGGCGAGCAATTGACGTGCGGTTCATGACCAGGTCAGAGGTGATCTGATCGATGAGTAC
CTCCTGCGCTCTCAAATAGCGCACAACTTGCACCAAGGCAGGGTCTGCCTATAGGTCTTC
GTTGGCAACTTAGGTTGGACTACCATAGCCTTCACGACTANNATAGTAGCAGAACGGTCG
GCTATTCATCCATGGCAACAAATGTCGCAGCTGGACTATAGCTTCTCGGGCTGCAAGCTG
ATGGGCTTGGGCTTCGCTGGTGGGTGCTCTACCAGTGAAATGGTAAGGACACTCCAACGA
GCAACTTCCTACATAGATGTGCACCCAGGCCGAAAAGTGACGAATAACCGCACTCGCAGG
CTCCTCATGCACCACATAGATTGGAGGATCTTCTATGCCGAAAACTTGGCGGTTGAGGTC
GGCGAGGATGGCTACGAAGTCTCGGTCTCGGACACGGCGGTCTCGTTGCAAAGAACGCGG
CCAAGCATCTAGCAGGTATGTGGTTACTTGGGTGGTGGTCTCAAAACCGCGGTCTGCTGG
GGTTGAGGCAAGGCCTTACTATATAGGCTAGGGAGTCTTCCATAGCATGCTAGGGGATGC
AACAACTCCGGTGTCAGTCATAGACACAGAGCTTAAACGCTGGTCTAACAGGTTGGGCAT
CGACTGCCAAAAATATGTCGGATGGTCACTGTGGTTGGCTATGGGATAGGCTAAGCTGGG
TTGCGAATATATAAATATCCAGGCTAGGGATAGCGACCTGGCTAAGATAGGTTTAGCCAA
TGGTCAGGCTGGCTCTGATACCAAGGTTGTAGTGACCGATTTTTCATAAAACAATTTCCA
GAAAACAGACCCTTATGTTCACCAGCCCGAGGACTATTGTTAGCTTGTGAACACTCACTT
GGTACAGAAATCGCAAGCAAAATACAAGGTTTGGGTTACAAGACCATAAAGGTCCACTCG
GTTGAATAAAGTTTGAGGCTGACGACGGAAGCGACTCGAGGAATCTCCTAGCCCATGGAC
TCCATTTCCATAGAAACATCTGACATGGATAAATTCTGATGTCACAAGGCTGCTATCCTC
GATTCCTAGATCTACGTGTTGATGACATCGTGCTCCTATCTAATGCAGTCTCGCCAACAC
AATCGCCAGGGACAAGCCAGTGAGTATTTTGAATGTACTCGCAAACATCAAGAAAACTCA
TATGTTAAAACATCTGAGATGCATGCGGAAATCATTCAATAGCTTGGTCATGCCACAAAA
TCAATTCACATACACATTCATACAATAAATTCACTCTTACCAATCATTTATAAGCCAGCA
ACACAAGATATAATCAATTATGAGCTTCTCGATCGAGTGTCTGAGGTGATACCTCAGAAG
GATAAGCAATACAAGCCACAATTGGGCGTCTAAGCGACACCATAGAAAGATATATGAAAG
TAATAACAATTGCCACCGTCGGGCGTCTAAGTGACACCACATAATGGGCATAATAAAAAT
AAATACTTGCCACAGTCGGGCATCTCAGCGACACCACAGAGAGGGCATAATAAAAATAAA
TACTCACCACAGTCGGGCGTCTTAGCGACACCACAGAAAGGGCATTATAAAAATAAATAT
TTGCCATAGTCGGCGTCTGAGCGACACCATATAAAGGGCTTATATGAAAGTAATAATAGT
AACGATGAATATCCAGGAGGTAGAACCNNNNNNNGGATATTCAACAATCATAATCATAAG
TGTTCGTCCACAGTAAAATAATAATCATAATCATTCAACATATACCATAATGATTAGTCC
ACCTCAACATTACATAATAATAATAGAGGTTATCATCCGGTTTTAATTTAATTCCTCCGA
AGACCAACACTCAGACCGACACTTGATTAGTCAACCAGTCGTCCTTGACCGTGGACGTGG
CTACTCGAATAGATTTGACTCTACAGAGGG