Map Locations of contig_121928 (8356 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_121928

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_2470 1 1358 bp MLOC_2470.1 Available Available LOC_Os08g43480.1, FRAME:+1, EVALUE:5e-97, 13108.m04711 protein zinc finger, C3HC4 type family protein, expressed





CDS Structure of MLOC_2470






Contig Sequence (8356 bp)

>contig_121928 8356 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCAGCTGGTTTTGTACGAGACGAGAGGTGCGTCGCTCGAAGGACACAACTCGTAGCGATA
ATACAATAACAATCGAACGGTTAAAAAGTGACTGAGACCATAATTAAAACTCAGCTAACT
GAGTTACAGCAAAACCGTATGAATAAAACTTAGCGCGCACACATTTGAAGCAGAACGTTT
AAAAGTATGACTCGGTCCCAGCCAGATACCTCCTGTTTCAGGTTTTTTAAGAAAAAAGAT
ACCTCCTGTTTAAACCCACGGCAAAACGTTGGCCTCGTCCTCATATAGCTACCGCGTGCG
CGTGCGCCTGAGCTTGATTAACGTTGCCACTATTGAATTTCTGTTTCCTTTTCGTCCTCC
CCTTCTCCTTCTCGTCTCCGATCCCTAACCGCTCCTTCTCTCCCTCCCCCATGGAGGGCC
CCAAGGGAAACGGCGGCGAGAAGCCCAGCGCGGACCAAAACCATAGCCCCAATACTCCCG
CCGCAGCCGGGGCCGGAGGGGACGACGTGTCGGCTGCGGCGGCGGCGGCTGTAGGGAGGC
GGCCGTTCACCGCCTTAAGCCAGGAGGAGGCCGACCTCGCCCTCGCGCGCGTCCTCCAGG
AGCAGGTAAGCGTCCAGATCTAGCGGGGTCGGTTCCGCCGCCTATGCTTCGTGGTTTAAT
TAATCTGGGGTTGGTGCGCTTGGTGCCGCAGGAGCGGGCGTACATGATGCTGAGCGCGCA
CGGCGGGGACGGCAGCGAGTACGATGCCTCGGACGCTGGGAGCTACGACTACTACGACGA
GGAAGAGGAAGGGATCGAAGGCGACAAGGGGAGCGACTACGAGGAGGAGGGGGTACTACC
CAACGATGACGACGAGGAGGTGGGCGACGCGGAGGGGGCCGAATTGGACCCCGCGCGGTA
CGAGGACGACGAGGCGTATGCGCGGGCCCTGCAGGATGCCGAGGAGCGCGAGGTCGCCCA
GCGGCTCATGGCGCTCGCTGGGATCACTGATTGTGAGTGCAAGAGACAGGGCTTTTCCAA
ATTCAGTCACGTTTTCTCCCGCTCCCATTTGGGGATGTTGATTAGTCTCTTTTTTCTTTC
AGTAGGGGAAGAGATGGAGCATGATGAGGAAGATGAGGAAGATGGGGATAGCGCACAGGT
GACCGTGCATTCCGTTATTACGATATACTACTACAATGTTTATTGATTTATGCGTATGCT
TAGGCAACCATGCAGCTTTTCTGTCAAGATTAGAATTTACATATTTTATTCAGGATAGCT
TCAAATTTGTGTTTAACTAAAATCATATGCGCTAGTTTAGTTTGTCGGCCCAGTTTTTCA
ACCTGGATAATAGCTGAATGTTTCAAACACATATCAGTTAATTGCTCATGTTAGGATTTG
CATTTTATCTTCATTATTTCCTTCTACGCATCCTCTATGCATTTTGCAGTGGTCTAGAAT
AAATAATTTTAATGCCATCGAGTAGATTCAGTGCTTGGTACCTTAAACTTAGAACAGCTC
TATATGTGCTAAAATAAATGCGGATTGGGTTAGCACGATCGTATGTTTGCACCTTCATCC
CATTGTTCGCCGTTTGTGACAGAAGGCTGGTATAGAATTTGGAATGTAATTTTCCTGTTT
TTTCAGCAAGGAAGGGAAATCATCCTAGCCTTTGCATCCACAAATGCACACATCCATATC
GTTATTAGAGTTTTGAATGGAATTTTCCTTTCCTCATGATCTTATTCTTGTGAATAAGCA
TATTTTCGCTAGGATCCATGACTGCGTATGTGATGTCAATTTTCTTCTATTTGGGAATTA
CTGAAAGTAGCCTTATGAATCTATTGATTTTTTTTTTGAACGAAAGGGGTTTCTTATGAA
TCTATTGATATCCATCCCATACGACCAATCAGTATGTTTGTCAATGTAATAATATTCTTA
TTTTCTTGTTATAATCAATAAATCATAATCAATCTTCCAAGCATGAAGTTGGTACCTGAC
ATTTTCAAAATTTGTGCTTATGTCGAACCTTAGGATGCATGGGAAGACGTTGATCCAGAC
GAATACTCATATGAGGTAAGTTGTATATTTTGTACTAGAAAAAGGGTGATTATTTGCATT
TATATCTGCATCTGGTGATTTAAGATTCTTTTCTGTTAAACCAGACTGAACTTCAAGATT
TACCATTAGATATTAATTAATGGTTGTGGTGTTCTTAGGAGCTGGTTGCATTGGGTGAAG
TGGTCGGTACAGAAAGCAGAGGCGTTTCTGCAGATACTCTGGCTTCATTACCTTCAGTAA
CTTACCAAGCACAAGATAAGCAAGAGAGCAACATGGAACAGTATACACATGATTTAAACA
TTTTATCTTTTTTTAAATTTGTTTATAGGTATTGAATGTTCTGATATGTGAAGTTTATTT
GCAGATGTGTTATTTGCCGTGTGGAATTTGAGGAAGGTGAATCATTGGTTGCACTTCCTT
GCAAGCACTCGTATCATTCTGACTGCATAAACCAGTGGCTGCAGTTAAACAAGGTATAGC
CACCACCCCCTTTTCCTCCTTCCATAGCCGGAAAATTGTCCACCAAGCTCTTATGAAAGA
AAGCAAGAAAGGACCTATTCTCACACAATATGTTCTCTTAATTCCTCTATCAAAAACGAT
TCCATGAACTTCTTCTCCACCATCAGTCTACATGATGCCAATCCTCATGAAGTTCTGTTT
TGCATAATAAAGCAACCAGAAACAGCGATTTTATACACAGATTGGGTAGTATTAGATATT
GAAGTATGAGCATACTATCCATGTTTCCTCTAATAGCTTAAATTTGTAGAGGGAATTTGT
TATTAATGGTGCATGATGAAACTGAATACTAGAAAACAAGGTGATGAATACCATTGCTAT
GTTGCAGGTATGCCCTATGTGCAGTGCAGAAGTTTCTACCTCGGACAACAACGAGGCATG
ACATTCTGTTGTGGTCGTCATCATGGACGCATGGTAGTGGGAAGAAATAGCGACAGCATA
TATTTTCTGATGCCTGTGAGGTTTAAGCACTAGGAGCTGTTGTATTGTCCAAAGAAACTA
GCAAACAAGCCTCAAGTTTGTCTCCCTGCTTTCTAGCCCAGCAGACTCAGACATATGTAC
TTCTGGACTTTCTTCACACTGATGCTGCTTTGTGATTCATTGATGTAAAATAGTTTAAAT
TTATAGCCATTCTTTGTTAGACGCTCGTTGTCCATTGTGATTTCGTAGATGTAATATACG
TACAATAATTATATTTATAGTCATTCTTTTACACCTGATCGCCTGACTTCAGGCTAGATA
CATGCTTGAGAGATGACAGCGTTGCTGGAAAATTTGAAAAAGGGATGGTGCGTTCGTGCT
TGCCCAAGCTCCGAAACTGTGGTACCAGTTTTCCAGATGCAACAAAAGAACCAATGTGAA
AAAGGGATGCTTAGACTTCAGAGTGATTTGTGGGTTGAAAATTTGAGTCTTGTGCAGTAC
AGGGAACATAATCTAAAAGTTAAACAGTTGAAGAAAAACAAATCTACTCAAACAATCTAA
AAGATGTAGGTATTGCTTTATAATCCATGTAATTCATTTGCAGAAAGAGGAAATAATGTT
GGACGTTGGTTCATGAGAAAAAGTTGTGGTAACTGTCTGTTTTATTTTGACGATATCTCA
GGCATGGCTTATGATTGAGAACTAGGCTAGGTCTGCTTGGCGTATCCGCGGCGAGGTCAC
TCCTCAGAGGGTGGCGAGTACCGAGGTGGTATGAAGGAGGAGGCGGTGATTGTGGTTCAG
CCGACTCAAACTGCTTTCATTATTGGGCGACATATTCCACACAGTGTGGTTGTGCTGCAT
GAAACTCGGCATGGAAGTAATCAGTAGCGAAGTCGATAGACAACAAAATGAATCTCTTAT
TCCTCTTTCATTGATGAATATGCTTATATATGAATGCAACAAGGGATGCGTCCGTACCCG
AAGGGGTGCGTCTGTTACATGAGAGAGCGAATAGATGAGATGGTTGACATGACAGTAACC
ACCCATTGGTTGGTTAAGTGGAGATTATATCCATAATTATCATGTGATAATTAAGTCTCA
ACACTCCCCTTAATCTACGATTATCAAAGTAGTATCATCATCTTGAAAAAGACTCTTTTA
AAAACCCTGTGGGAAAAAAATGTGAGTATAGTATTTGATATGTTGCTAAAACTCCTTCAA
ACCCAATGGGAAAAATAAGGATAGCATACCGCAACATATGATGGTTATTGTCTCCTTAAA
CTCAATATGAGCAAAATTCATAGAATTAGAAGGACAATAAATATGCCGTATATACTTTCT
TAAAAACCCCGGTGGTAAAAACAGAAAAACTCAATAAGGGAAAAAGAGTATAATATGATG
CATCGAACGGGAGTAATCCAGGAGGATACCCCCTGGTTCTTGCATATCTCAAAGCCGTCA
AATACCAATTGCAGGAACATTTTCTAGATGTTGAAGTTGGTAGAGACTTTGTGAACAAAC
AAACAAGTTTGTTTGCATGATTTGACTTGCAAGATGGGTAATATAGTGATATTGCTTACT
ATGTAACCTGTTTGCATCCGGAAACACAAGAAACATTATCTTTGAGATCATGGTTGGTGG
ATGTAGCCACGAGTTCTGTTTCGAAGACTCTCGTGAGATGGCTACCACACCTAGCAGGAA
CATAAACCTTGTCTACGATCTGACATAACAGGGATCTGATTGATGTATCCAATGATATTG
GTGTTCAGATTTCTCTAAAACTGAAAGATTAGGACAAAATGTTTGATGCCTTTGGAGATA
TCGATAGATATTCTTGAGTCCCAACCAATTGTTTTTGGTGCATCCAGTGGCATTATGGAA
CGTTGAGTTCAAATATCTCATTTCCATCATCTCTTGATCTAAACATATCTTCCTCTACGT
CTAGAGGATGAACTACAATGAGATTTATGGATGGATAAGATTTGTCCACAATGAATTTCT
CCAATATATTTTGGATATAGACAACATAGTAAACCATAATGTATGAATGAAGGTGCTCAA
GTTGTAGTAACGAACGGTATTTTGGTTTACCCAAATCCTTCATTTTGAACTCTCTCATTT
AGATGATTACATGCGTCATCATTGAAGACACACACATGGATAATCACCATTGTATGAGTA
ATCCTTGTGCATAAGGAACTCACTATGTCGGTTGTACCAAATATACCAACGATAATAATA
AGTCACATGGTGACTTATTGATTTTACACAATGTATGTTTTTTTTTGCATTTCGATTCAG
AAGTGAGATTCCATCGGGAACCATCTATATGTGAACCTAGTGATCCACATGGATATGTAA
TCACTACATCTATCAACCGCAGAGATAGATGATTTTGTACTGTCAAAGATATAAGTTATC
GAAATGAGATTCCACCTCTAGAGAATAGTTGGGTATCTGCGTGAACCCTTGTGCTACACT
ACTTGCTCCTTGTTTTACCACCTCGTTGTTCTCAATTCTGTTTCCAGAAGAAAAGTGATG
TAGGTATTGCTTATGTGAATACCTTCAATTTAGTGAGCAAGATTATTTCTACCTAGATTA
TACCCTTTGCTTGAGTTCAGTCCGAGTGTTGTTCACACTTTGCCATGGCCATGGTCTTCG
GATCTCAATCATTTGAAAGGTTTTTTCAATCTAGTTGAGAAATAGATGTCGAAAATTATA
GACTTCCGGTTATATGTTTCTCCAGAATCTATATATGAACATAAACTGGATGAAAATATC
GTTATCCATGCTGACCGCTCGCGATTTCCCAATGCGATTGAGTCGGGTATTCCGATGTCC
CGGTCATTGTGTGCACTATGACCAGGGTTGGTGGAGTTTGCCCATCCACTGGGTGTATAC
TACCTATTAGGTGTCTGTCAATGAGAAGTTGACTTGCATAAAATGATTTAGAGGCCTTGA
TATCCTTGCTTGCGAGAAGCTGAATCATGATGTACTTTTGCCATACATCTCCCCCTGTTG
CATCGAACGGGGAGTGGAGTGGTTCTTGCTGATAACGTATTAGAAGTAATCAACAACGAA
GCCGATAGACAACAAAATGAATCTCTTATTCCTCTTTCATTGATGAATATGCTTATATAT
GAATGCAACAAAGGATGCGTCTGTTCCCGAAGGGGTGCATCTGTTACATGTGAGAGGGCG
AATAGATGTGATGGTTGGCATGACGGTAACCACCCATCGCTTGGTTAAGTGCACATTATA
TCCTTAATTATCATGTGCTAATTAAGTCTCAACAGAATTCACTCGAAGAAACTTGATGGA
GTTCAACTCAAAAAAACTTGATGGGGTTGTCTTTAAAGTAGATTTCGAGAAGGCTTACGA
TAAAGTTAAGTGGCCATTTCTGCAACAAGCTTTGCGTATGAGGGGGATGCGGCCTGGAGA
AAGTAGGTCGAATCCTTTGTACAAGTGGGCAGTGTCGGGATCAAGGTTAGTCATGATATA
TGTCATTATTTTATATGCAAAAGGGACTGAGACAGGGGGATCCGATATCTCCTACCCCGT
TCCATGTCGTTGTTGATATGTTGGCGATCCTCATTGGCAGACCCAAGGAGGATAGTCAAC
TAGGAGGGATCATTCCACATCTTATGGATGGGAGGTGTCCATACTACAATATGCTGATGA
TATGATTATTTTCGTGGAACGTGACATGGAAGAAGCTAGAAACATGAAGTTGGTTTTATG
TCTCATCGAACAGTTATCCGGATAGAAAATAAATTTTCATAAGAGTGAACTTTTATGCTT
TGTGCGTGCTAAGGAGGAACAGGAAAACTCTAAACATTTGTTCTGATGTGGACTTGGATC
CCTACCTTTTAATTATCTAGGGATCCCAATACATCATCGAAAATTGTCCAACAAAGAATG
GATGTGAACTGAGTCAAATTGATAAAAAACCCTAAGTTGCTGGAAGGGAAAGCTTATGTA
TCATGGGAGTCGGTTAATTCCTATTAACTATGTTCTTAGAACATGTCGATGTTCCTGTTA
TCCTTCTTTGAGGTACCGACACGGTACAAAAAAGGTTGACTTGTATCAATTGCATTTTTT
TACAAAGTGAGGAGAATAGATCTAAATACAGACTAGCTAAGTGGGACATATTTTGTAGAC
CATAGGACCAAGGGGTTTTGGTATTGAGAACCTATAAATAAAGAACAAGTGCCTAATTAG
CAAATGGTTATATTGCGTGTCTCTAGTGGAGGATGGGAGCATGGATAGAGTTATTGCTAG
CAAATATTTGCATTTCAAAACTCTGTCACGAGTTATGGCACAACGAATGATTCCTTTTTT
GTAAGGGGTTGATGAGGACATATGTTGCTTTAATTAATAGGAGTAAATTTATAGGTGGGA
ATGGTCGCATTACTAGATTCTGGGAGGGTACTTGGATGAGGGAGACGCCTTTTGCCTTGC
AGTATCCAACACTTTATAACAGTGTACAACGTAAAGACGCAGTCAAAGTACACTACTAGG
TTATGTTCCCTTAAACATTTAGTTCATGTGGGTATTAGTGGGAGAATGTTGGGATAGATG
GTTACATTTAGTGCGTAGGTTGATGGAGCTCAACCTATCTAATGTGTCACATACACTCCA
TTGGAAACTTTTGGTTTCGAGTGATTTCTTAGTCAAATATTTGTACGTTCACTTGATTAA
CCTTGGACCAATCCCAAGGTTGATTCATATTTGAAAAATTAAGGTGCCTTGGATGAAGTT
GAATGGTCAAAGCAAATGGATCCTTCATTGCCAAATTTGTCAGGACCGCCATGGACAATG
AATATGAATACGATGATCCAACAAAATAAAAGGTTGTTCTGGTCATAAATGCTTGGAGCC
GAGGGTGGAAGTGGGATGTGGAGAAGGAAATGTGAGAAGGGGCATCAACCATGATGAGGG
AGAAGTTCCAAGACATTATTGACAATAAGGAGGAGGGATGTGCCAAGAGCTATGAGGTCA
AATGATAAAGAAGGTAAAGAGGTTTTGAAAGGACGTGGATGTCGCCTAGAGGGGGGAGGG
TGAATAGGTGCTTTAAAATAATTACAGTTTATGCTTGAAAAAATGCGTAATAAAACTAGC
ATTTAATTCGTCAAGCACAAAACCTAAAACAACTAGGCTAACTTATGTGCACCAACAACT
TATGCTAAGCAAGACAAGCAACTAAGTGATAGCAAGATATATGTTATGAAACACTATCAC
AAAGAAAAGTGCATAAGTAAAGGGCTCGTGTAAGAGATAACCGAGGCACGTGGAGATGAT
GATGTATCCCGANNNNCACACCCTTGCGAATGCTAATCTCCATTTGAATTGGTGTGAAGG
CACAATGCTCCCGAAG