Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
![](/morexGenes/blast_net_images/contig_120980_assembly3_WGSMorex_rbca.fasta-MorexXBarke_maploc.png) |
![](/morexGenes/blast_net_images/contig_120980_assembly3_WGSMorex_rbca.fasta-OregonWolfe_maploc.png) |
No map location |
Predicted Genes from contig_120980
Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
---|
MLOC_2359 |
2 |
1502 bp |
AK366021 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_2359
Contig Sequence (3147 bp)
>contig_120980 3147 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGTTTTTGGTCACGCTTGTCAACCTTCTTAAGCGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAGCT
TCATAGTATGGCTCATCAGCTTGATTCCGCGGTAGTTAGTACAACTAATGGGATAAGAGG
ATGCTTTACTTTTCGTTTCAAGTTCTATGATGATATATGATCTACCTTCTGCACTGTAGT
TTTTTTTGTTCTTGCTTATTTTACATTGACCCATATGACCGGTTATGTCCAAATGAAGTT
AAGCACTTCTCATATATCCTTGTTTAGCTTTGCCTTCTGTAACATAAAGCGTTGAGCTTT
TCCTGTGTTCATTCAGGCTGTGGATCGTTTCCGTGAAGGTGAGAACTCTGTTTTGGTCGC
GACTGATGGTTTTGCAAGGGGCATGGACTTTGATAATGTTCGAACTGTTATCCATTATCA
ACTACCACACTCAAGTGATGTAAGTGCTCTTTGTATTTCTCAAACCTATGCTTGCCTAGA
TATAGACCAAGCTGACTAGAGTTATTGAAATTCTTGTTTGTCCCCGTAGGTTTATATCCA
CAGGAGTGGAAGGACAGCGCGTAAATCATTGACTGGCTGCAGTATTGCATTAATCTCCCC
TGCTGACAAAGCCAAGTTTTACTCTCTTTGCAAGTCATTTTCAAAGGTGATTTATTTCAT
ATGTTTTCATACATTAAATATTACTGCATACGCGGCATATTCAATCTCTCATGGCTGGTC
GTAACTGAATATTTTGGCTGCCGTTTTCGTTATATTATTTTCATACTTGTTCTCTTCTAT
TTTGCACCTGTTGCTACAACTGCACTTCCATCGCTCTCAAGTCTCAACCACTCAACGTGG
TGCATAATTTTACAATGGTTCTTTCACGGATTAATCTGACTATAACCATTGATTGAAAAT
CACAGGAGAACCTGCAGCAGTTTCCTGTTGATCAGGCATACATGCCTGCAATAATGAATA
GGCTCTCCCTTGCTCGGCAGATTGACAAGATATCAAGTAAAAATTCAAAGGCAAGGGGTT
TGTTATATTTTCAATCATATTCTTTGGTCATCTCCAACACGTATGGATTAACCACTGGCC
TCTGATTAATGTTAGGTTATGGTTGTCTACGCTCTGATTTTCCTCTGCTTTTCAGGAAAA
TGCTAACAAATCCTGGCTTCAGAGGAATGCTGAATCCATGGGTTTGATATTGGAGGCTAG
TGACAGTGAGGAAGAACGTGTACGGGGCCACAAGCAACGAAAGGCTGCTTCGGCACAACT
CCAGAAACTTCAACAGGTTTGAATGATTAAGATATGATTATATTAGGGTTATATAGCAGG
GTTAAATATTGGTAAACTAATCTATTTGTAGGTGTTCATGATTTTTACAATCTTTACCTA
TCTGGCCCGTATGTAAACATATTTTTCTTTGAATCACAGGATTTGAATGCACTCTTGCAA
CATCCCTTGCAGCCTAAGACATTCTCACGCCGCTATTTGGCTGGGGTTAGTTTTCTGTCA
TGGAGTAAATGTTATGGTCGATTATGGTATCCTAACCTGACTAGTGTCTATTATGTGTTC
ACTCATTTAAATAATCAATTTATTCAGGCGGGTATATCACCATTGCTTCAAAAGCAACTA
GAAGAGTTGTCCAAGAGGAATGTAAACAATAATAGCAGTAATGACGATAATAAAGGGTCG
CGATTTGTTATTATTGGCCAGGATCGTGTGGAACCGTTGCAAGCTCTTCAAGATTCTGGG
CAAGAGGTTAGGTTTCTAGACTATTTACGTTATTCGTAACCAGAATCAAGTTTGCATCTT
GTGTATGTAGTTGATACATGAGTTGCTTTTGTTTGTGTATATGTAGTTCATATATTAATT
GCTTCTGATTTTATTCTGTCAGATTTGTGTGAACATGGACAAGCAAAGGGAGAAGAGAAG
ACTTGCTGAGAATTGGAGGCGAAAGAAACACGAAGAGAAGAAAAGTAAACTTCTATCATC
TTTTTATTGTATTTACTTATTACTTGCAGTCAGATGAATATTGGATGTAACATGTCTCTG
ATTAAGTGTTCTATATTTCAAATATCCCCTTAACTATACTTGTGATGAAAAACAGTACAT
AATCATTGTACAGGCAGAGCACACCCACCTTATAAGTACCGTCTTCTATTTTCAGGTACA
CGAGAACAAAAGAGAAAGGACAGGAGAAGTGCTAAAGAGAGGGACTGAATAATAAATGAA
ATACTGAAAGAGGAGGCATGTATTGTTTTGATATTATTTGTCTCAGGGTTAGGAGGGGTA
AATGTGCTAGGCTGCTTCATCATGAGGCCACTTCAATTACACGATTCCTGTCAAGAATGC
ATGCCTTCACTGATGATTTTGACATGAAAGATGATTGAAGAATGTCAGTTGGAGCAAATG
AGATTGCGGCCATGTATTCCGCGTTTTGCCCTTGAAGATAAGAACTGAGCCCTAGCAGAT
AATGATCGTCGTGCAATTGACTCATCTCTGTAACATGTGTATGTTATCACAGTTTATCTT
GGGTGTGGTGAAATATTTTTGTTGTCCTGAGTGAGTTCACCCAGATGTTATATGTATGTC
TGGTGGAAATTTGTTGACTTGATTAGGTGTTGGTCTATCCAGGTGTGCTCACTGAAACAG
AAGACTGTAACAGTATATCCAATCCAGGTGTGCTAGAGGTACAATTATGTCTTCACTGAC
TTCAACAATCAATTTATTCAGGCAGGTGTTTCACCATTGCTTCAAAAGCAAGTACGTACA
AGAGTTGTCTCAAACGAATATACTTGCTCCGTTCTTAAAATACTCCCACCGTTGCAAAAT
AAATCTTTACCTAATAATAATAAAGCGGCTATTGCTTTTGTCGGAATTTCCATCATGACA
TTTTAAAAAAAAGTCCCTGTCGTTTGGCTGAATAANNNNNNAGTCCAGTAAATAAGTTAA
AAAATGTTTCACACAGCTGCTTCGGGGCGAGTCCATGGCCCGTTGAGACCCAGATGTGGC
CCTGGAAAACCCATCCGAGATTGATCCAGCCAGAACCACGCTCGTCGCCACTTCCCCGAG
CTCCCTCCTACTCCCGACCATGCCGGCCGGACCTCCTCCACCTCGCGTCGCAGTCGGTGA
CCGGACCCTTGCCGGACGAGCAGATGA