Map Locations of contig_118414 (8609 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_118414

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_2075 2 2048 bp MLOC_2075.1 Available Available LOC_Os04g32950.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13104.m03171 protein calreticulin precursor protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_2075






Contig Sequence (8609 bp)

>contig_118414 8609 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGTTGGATATCCTTGGGACGGTTCTACCTCATGGATATTCAATATTATTTTTTATAAGCC
CTTTATGAGGTGTCGCTAACACGCCCGACTGTGGCATTGTTTTTATTATTTCTTATAAGC
CCTTTATGAGGTGTCACTGAGATGCTCAACTGTGGCATTGTTTTTATTATTTCTTATAAG
CCCTTTATGAGGTGTCGCTAAGACGCCCGACTGCGGCACGTTGTTTTATTTTATTCATGC
CCGTACTATGGTGTCGCAGAGACGCCCGTTCGAGGCTTATTATTTATTTCATTTATGTAT
GCCCTGTGTGTGGTGTCGCTCAGACGCCCGACGATGGTTGATTTTATTTTCCGTTACGGA
TATCTCGGGAGGACTACCACCTGATTTATCCACTAATTTATTTACTTTGTGCACTTATAT
TGTGGATACAACTTGACTCTAACCATGCATAATAAAATCAACTCCATGCATCTCATCTTT
TATGCAAGGTGTTTGCGAGTACTTCTCAGAGTACTCACTGGTTGTTGTTGTGGCCAGATA
TGGATGAAGGAGACCTGATGGATGAAGAGTTTGATAGCGAGTTTGATGTCTACAGGAGTC
CCAGCTAGTCTTGCGTTCCTGGAGTCCGTCACTGTTTTTTTTTTCCACCGCTTCCGCCAC
CTCGAATAAATCGTTGAGCTTCACTCTGAGGCTTAAAGCGTAGTAGTACTTGTCATGTCA
CATTACTCTGATGTGACGTGCCCTCTTTATTTTCGCGAGCAGTAGATTCACCCCAAGACA
AATGTAACATTTCCATCTATCCTAAGACTTAAATATGTTGTAATAATTTGTAAAGCAACC
CTCGCTCTACCTGTATAATATTAAGTACTACTGATTTTTTACATCAAGTTGAGTCTGTTA
ATGGGAAATATTTTCTTCACTAAGGACGCACATGGCTGATTTCCAATTAAATCATTTATT
TAGAAACGGTCGTGACATCAAGTCCTTGCCAATATAAAGAGTAAGTGACATGCAAAGGCT
CTTGCAGTTCTCACAAAATATATTATAGTTAATTGGTTGACATTAAAAAGGAGAGGTGTT
GAACAGACCACCTCTTTTGCGTGCAAAATGTGCACTGCTAAATTTCCTGCCAAATTGGCA
ATGTACACTGCTACGTTTCACTTAAGAAAAAAGAAAAGCTATATAACTTTATAAAGGAAA
TACAAGCTTAGTTTTGTTGCATCAGAACATATCCAAAGCATGTTGGCACTTTCGGTTGAT
GGGGTGTATGCGCAAGATGATGGATCGGCAGCTGTTGGAATGATTTTGAGAAGACGGGAT
GGCTCGGTGGGTTCTGCTACATATTGGTACATATTCCCTCCGTTCCTAAATATAAGTCTT
TTAAATGATTTTACTATATGTCTACATACGTAGCAAAATGACTGAATGTATATTCTAAAA
TATGTCTATATACATCCGTATGTGGTCCATCAGTGAAATCTTTACAAAGACTTATATTNA
GGAACGGAGGGAGTATTTGATTGCAAACAAGCTCTTGAAGGCTCATTCTATCCTTTCTAC
TACCTTCGTCCAAGTGTATATGGCATGCACGTAGTTCTAGGTTGTTAATTTAACTAGCTA
AATATATATCATATGCCATAAAAATTACATATTCAAAAACTACATCCCCGCATGAATCTA
ATGATATATTATTTATTACATATATTATATATTTAAATAGTTAAATTAACGACCTAGAAC
TACGCGCATGCCTTATACACCTGGACGGAGAGAGTAGTAATAGTTTGGATCACTCTGCTT
AAGGACAGATGGTTTCGGAGATTAAGTTTATATTGATCGGTAGGGATTTTATTCCTCAGA
AAATTCATAGAGATCAAAACATGGCATGCAGATTGCCTAGCTAGGTATAGTCGAACTAAA
TGCATCATGACTGTGTGGTTGCATCAAGGTCCTCCATGTATAGAGGAAATTTGGCCTTCA
GATTGTAACCCTGTTACTATGGAATAAAATTTCTATTGAACCCACAAAGAATTAAATAAC
AAATCAAAAGGAGTTTATTAACATATAAATTTGAAAAACTTTTGTGGGCCCGTGACCCCG
AACATGCAATCTCGCAAGAGGTCCAGCCCAGCGCAAATGAAAACACATAGACACACAGAG
AGAGGTGGATTTAGGCCCCAAGCAGCTCGGACAACTGCCTGAGATGTGTAGGCAGTTTCC
TTCTACCGACCGCGAGAGCGCACAACAAGGTGAGGAAACGCCTTGCCATCGCCGTTTGCC
GACCGGGCCTAGCCCGCTGGCTTCCTCCAACGACGAGAGAAGAGGAAGCAGAGGAAGGGG
GTGGCGACAGCTGCGGCTAGGGTTCCGCCCAAACCGCCGGCAGGGGCGACGCGGACGCTA
TTATATTAAAACCATGACATTTTATGCTTACATGTTAAATTCATTACTGTAATTTTGAAT
ACTTTGTTTTTTTATAATACTTTGCTACCGAACAAGACCTTAGAGATGAGAGAGTGTTGC
TTGGACTCCCCGTGGTTTTCTGGTCAGGAGCCTGATGGTTGACGGTGCATCTAAAGTGCG
AAAACCCACATTTAACACGCTATTTCATACTCACTCCATTTAAAATTACTTGTAAAATAA
TAAATTTACCTAAATGATATTAATTTTAAGTACATTCATTTTATCATTTTACGCCTTATT
CTAGACGGGGAGTATGAATAAAGCTTTTTAGTCCTGAAAAAGAAAACTCACGTTTGAACA
GAAAAGAAGGTCACTCGAGTCTCGAGGAAGATCTGACAAAGTCAGTGAGAGGAAAAAAAC
CCGCCCAAAGCTTCCACGTGGAGCCCCCGGTGGGTCCAGGCGTCACCATGCGTACGTGGC
ACCATTCCGTTGGCTAACATCCCGTCTAAGCAGCCCCTGATTGGCCGGAACGACTCACGC
CACGTATCGCGACACAACCTCCCCGTCCAGCACATCTCGGCCGTCGCATCCTCCACCCCG
CCTCATCCCAGCCGTCCAACGTTCCTTGTCGCCCCTTCAATTACACCCGTCTCCTCCCCC
GGCATCGGTCGCTTCGAAGATCGACACCAGTGGAAGTTTCTTCCGGTCCCAGAGAGATCG
CGGAGGGGAGGAGGATGACGGGAGGGCGCGCGGTGCTCCTGCTGCCGCTGCTGGTGATCT
CGGCGCTGTTCGCGCAGATCAGCGCGTCGGATCCGGTAATTCATCTCCCCGGCTTCGTGT
CGCTGCTTCCGGTTCTTTTTTCCGCTCAATTTTGGGTGAGATTTGTGATGTTCTGCGTGG
GGTTTCGCAGCTGTTCCACGAGTCCTTCGACGAGAGCTTCGACGGGAGCTGGATCGTGTC
CGGCAAGGATGAGTACAAAGGTGATTCTCCCGCCTTTCCGTTGCGTGTTATTCGATCTGT
GAGAGATCCGTGCTTGGGTTTAGCGGCAGGTGGCTGGGTTTCTGATCCGTTCTGTGGGAT
TCTCTACTGACTTCCGAGGTGCTGAATCTGATCTGCTAACGTTGTGAGGCGATTTTATGT
GGAGTTCGATTCAATTGTTTAGTTGAGGTAGCGATGAGTTATCGGGAGCGATACGTTTGG
CGACCGTGAGATTCAGAATATGTTTGCAGATTGTTGCCTTTGTTCCTACATATGGTGATG
CGTTAGTTCAGATCCGCTACGCATCCACTGCCATGGTCTTGTTGGTGACAATAAGCGCTC
CACAGTTGTTAGATTATTTGTAGTCACTAGTCAGTATATGATAGAACAATGCGGAGGAAC
GAAGAGTACATGCAATGTGTTTTGAGAGGTGAATTGGCTATGATGTATAGTCTTGTTCCT
GCCTTTCTGCGTGATGACAGTTTAATTTGTGTAGATGAGCTGCATTTGAAACGTCGAGAA
AATGCAGCAATTGTCTGCATTGTGGTAGTTGTCTTTATAATTATATCAATATCCCCATCG
AGTTAATTAAAATTGTTGCTCTATGTATTGTTTCCCTGCTAGCATGTCATATGATCGATG
CAAAGTGCAGCACCTCGCTCTTAACAGTGTAACATTACTAGGTGAATTATGATGGCTTGG
CAACCTTGTGACCTAATTGTTTTTTGATAGGGATTCTGATGGTACAAATGGAATGGTGAT
TTGTGAGTATTGCGATTAGTAGATGGCTAGCTGTAAAATGATGTTCTTTGCAACTCTTGT
CATACAGTTAATTCATGTTCATGCCCTGTTTTTCTCACTAAGAATTGGCATTTCTGCGTT
AAACTTATGCCTCTTGTTCTTTGATTATCTGCCTTGTTTCCCATGTCTTTTCTAATGTAG
GTTTTGCCTGTCTGGCAGTTGTTCATTCGACTCCATTTCCTGTCAAAATTTGTTGTTCCA
CTAATACTTTTAGTACTGCACTCATGTATTGTGTTAATATAATGTGCCATACAGGTGCAT
GGAAGCACTCGAAGAGTGATGGCCATGAAGACTATGGCCTCCTTGTTAGTGAGCCAGCCA
GGAAATATGCCATAATCAAAGAGCTTGATTACCCTGTTACTTTGAAGGACAAGACAGTTG
TCCTGCAGTTTGAAGTGAGGCTTCAGAATGGCCTTGAGTGTGGAGGTGCTTATATCAAGT
ACATCCGTCCTCAGGCTGTGGGATGGAACGCCAAGGACTTTGACAATGATACTCCATACA
CAATTATGTTTGGTCCTGACAAGTGCGGTTCAACAAACAAGGTTCACTTCATCCTGAAGC
ACAAGAACCCTAAGACTGGCAAATATGTTGAACATCACCTCAAGTCCCCGCCCTCTGTCC
CATATGACAAGCTCTCTCATGTCTACACGGCTATCTTGAAGCCGGATAACGAGGTCAGAA
TTTTGGTTGATGGGGTGGAGAAGAGCAAAGCAAACTTCCTGTCTGCTGATGATTTTGAGC
CAGCACTTATTCCATCAAAGACTATTCCTGATCCCGACGACAAGAAGCCAGAGGACTGGG
ATGAGAGAGCTAAAATCCCTGATCCAGATGCCGTGAAGCCTGATGACTGGGATGAGGATG
CCCCAATGGAAATTGTGGATGAGGAGGCCACCAAGCCTGAAGGATGGTTGGATGATGAGC
CTGAGGAAATTGATGATCCAGAGGCTGCTAAGCCTGAGGACTGGGATGATGAGGAGGATG
GCGAATGGGAGGCACCGAAGATGGACAACCCCAAGTGCGAAGAGGCACCTGGATGTGGTG
AATGGAAGAAGCCAATGAAGGATAACCCTGCCTACAAGGGCAAGTGGCATGCACCCCTGA
TTGACAACCCCAACTACAAGGGAATCTGGAAGCCCCAAGAAATCCCCAACCCTGAGTACT
TTGAGCTTGACAAGCCTGACTTTGACCCAATTGCTGCTATTGGAATTGAGATCTGGACAA
TGCAGGATGGCATCCTGTTTGACAACATTCTTATTGCCGATAATGAGAAGGTAGCCACCT
CTGTCCTGGAGAAGACATGGAAGCCCAAGTTTGATGTTGAGAAGGAAAAGCAGAAGGCTG
AGGAGGCTGCAGCAGGTGCATCAGAGGGCCTTTCTGAGTTCCAGGTAATTCATTCTTCTG
GTGTTTTCCAGACATTATGTTCGACATTCCTTCAGTGAAGCAAAGAACTTTCTTGACATT
GTCAAACTCATGTTTTGATCCATATCTCCAGCAACTTATTGTATTGATTCCTTCTTCATA
TCACTGCTTGCATGTTATCGCTGACTGATTTGGTATGCACACTGCAGAAGAAGATCTTCG
ACATTTTGTACAAGGTCGCAGACATCCCGTTCTTGGAACCATACAAGACCAAGATCATTG
TAGGGCTCAAGATCCTTTTCTTATATCCTGTGTTCAAACAGTTTGGTATCTTCTCTGAAA
TGACATATGATTTCTCTATGTTTCACAGGAAGTGATTGAGAAGGGAGAGACGCAGCCGAA
CATTACAATTTCGATTCTGGCCTCCGTCGTTGTCGTCATTGTGACTGTACTCTTCAGAAC
CTTGTTTGGTGGCAAGAAGCCAGTGGTATGAAATTCCTTCAGACACCTGCCATCGCTGTA
TACTGCTTAAAAACCTGAACCAAACGACTGATTGTAACTTCTGCTTCTATCAGGCACCTG
TGAAGCCCGCTGCTGAGACCAAGAAGCCCAGTGCTGTTGTTCCTGATGCCACCGCTGGAA
GCAGCGGCGACAAGGAGGAGAAAGAGGACGACAAGGATGCGCCACGCCGAAGGTCGCGAA
GAGACGCATAAACTAACTCTTGGTGCCTTCGCATTTTGAAGGACTCGGCTCTAGCCTTTT
TGAGAACGCCTCGAGTGTATAATCGAACCCTCTGCTGCTAGTAGCAACCTCTAGTTTTTA
AGTCGCTAGAAATTTACGAGCCGGCGAAGCTCGTGTTGATCGGTTGTTTGTGTGCTGTTC
TGAATCAGCTAGAAGAGACTGTTTTATTTTTCCTTTTCTTTTGTTTTATATCAGATGAAA
CATGAAGCTTGTGTTTGGTTGTTTGTGTGCTGTGCTAAATCAGGTAGTCCCTCCGATCCA
AATTAGCTGATTCCGTAGAAACCATTTACTATTGTTTTTATTCACTTGACCTGGTTAAAT
CAGAAGCGAGCTTTTTGGTTCCTGCTCTAGGAGTTCAAGGTGTCTCGGTTGATCGGTCTT
TGTTAGCTTTGCTTGATTGCAGCTATCTGCTTTCATTGGGCAATTGTCTCAAATTTTGTC
ATGAAACTCTCGTAAAATGAGGAAGGCAGCATACCTGTAAAGTCTATTTTATGGTGGGAC
ATTTGGTTTGCCAGTGAGTATTTGTAAAACTATTACAAGTGATGAGTGCAGTTCAGTGAT
CATCAAGTGGAGCCAATTCCCTTCCAGATGATATCTAGGCGAACGAATTTTACTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGGCTGTGATTTCGTGCCCTTGTTTGATTTCATTTATA
ATGGTTTGCCCCCTCACGACTCGAGAACTGTCAGCAACGTTCATCTGTAACTCTGTTGTG
AGCTCTTTAGTTCATCTGGTTTGCTTCCCCACCCCCATGGTGTGAAGCCTCGATTCAGTT
TGTCGTGTCTCACATGGCCCAGGCAAAATACAGCGAGACTTTGGGAAGACGCACAAATAA
AATAGCATAGATACATACGGGCAAGCGCCAGTTTCATTAGATTTCCGGCAAGCATACGCA
TGCAATCCCCACACTGTCAAACACATATAGGCTCGCTCTACATAGATTAAAATTAAATAA
TGTCACCCATTTACTTTTAGATATAAACGGCTCAGATTTTAAATTGTAAACATTACATAC
AGATATTAGATATGCATTTTTTCACACATATAAAATCTGTCCCGTGCAACCACTGTCACG
TACTCCCTCTGTAAGCTAATATAAAAGCGTTTAATACACTAAATTAATGCTAAACGCTTT
TATATTAATTTACAGAGGAAGTACATGTGAAAGACATCACATTGTGGTGTATGTGAAAAA
AAAGTAATCAATTTCAGTTAGGATTGTATAATCGGATAGAAGAAGAAAAAAAGGCAGGCA
CGTTAGACATAACATGAGAAGGACATTACATTGTGGTAATGTGGAAAGAAAAATACATAT
TCAATTTCAGTTAGGATTGTACTAGGAAAATGGCCCGTACGTTGCAACGGGAGAAAATCT
CATCGCACTCTTGCATTTTATGTACTCCCTCCGTTCCTAAATATTTCTTTCTACAAAGAT
TCAACTACGGACTACATACGAAGCAAAATGAATGAACTTACACTCTAAAATATGTCTATA
TACATCCGTATGCAATCCATAGTGAAATCTCTAAAAAAACAAATATTTAGAAACAGAGGC
AGTATGTTTCTTCTTTAATTTTGCATGTATGTCTTAGATATCAGTTTAATTATCCCACCA
ATCCATAGTGAAATCTCTAAAAAGGCAATATTTAGAAACAGCGGGAGTATGTTTCTTCTT
TAATTTTGCATGCATGTCTTAGATATCAGTTTAATTATCCCACCATATAGAAGGTTAATT
ACCCAATCATATATATAGGGAGGCGTGCTCTCTCCTCCTTCGTCGGTTTGGGCTTCCATC
ACATTTTTCTTTAGTTTTAGGAAATCTGCTAGTGATACTGCAAATTAGCATCAGTCGTAA
AAAAATTACATACAGACCTAAAAACAAAATAGAACCAAAACAAAACATATTTTTATGAAT
CACACATTTTTGGGCCGCTATTTCTAAGTGTTTTTAGGTCTCCTTTTCAAATTCAGGCTC
AACATTTTTCAAAACATATTTTTATGAATCACACATTTTTGGGCCGCTATTTCTAAGTGT
TTTTAGGTCTCTTTTTCAAATTCATGGTCAACATTTTTCAAAACATATTTATTTTTTATT
TCTACTTTTTATACACATTCTACATTTTTGGTATAAGTCAAGATTTTTTTAATGTACGTT
TAACATTTTCTAAATACATGAGTATCATTTTTTTCATATTAATTTGTTATGTCTGATTTG
TCCCGTAGATATTGTATTTTTGTGTGTACATTTTTCTTATACATTGGAAACATTTTCTTA
TGTACATTTCATATTTTTTAAATGCCTGA