Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_117427 (2921 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_117427

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_1954 1 883 bp MLOC_1954.1 Available Available LOC_Os04g31820.1, FRAME:+2, EVALUE:4e-23, 13104.m03041 protein hypothetical protein





CDS Structure of MLOC_1954






Contig Sequence (2921 bp)

>contig_117427 2921 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTCATCAAGGCCTCAACATCTAAAGGTTCGGTCAATAGGGGTTAAAGGTGTACGTTACTG
ATAACGTATGTATGTAATTAATGCTATTCATGAACATCAGCTGAACGCTCGCTCGTTGGC
CTCCCTGAAGGTGGCTTCTGGTCTTATGTGTCGACTGGTGTCTTCCGAGTGGAAGTTGGT
TATCGAGTGAAGGAGAATATCTTCCGAGTGACTTTAGACGTCATGGTTATGCAGTTGAAA
TCTTCTTTGTAACCTTACAACTAATAATGAGGTATCCTTAGGTAGGACACTTAGATCAGG
CATGTGACCCTATCCTAAATACATATCCCCATCAGTCAGCACCGTAAACTGAAAATTGAA
GAGCTTACCGTCAGGGTAGCTGCAGTAGCCTCTTATACCTTACCGCCACGGTCCGCGGCG
GTAGGGCACTTATACACGTCAGTAGCCGAGACGACCCGGTCTGACCTAACGGGACCTTAC
CGCCGAAGGTCCTCATGGTAGCCTATGTAAACCTATCGTTGTAGCTTCTCGCGATTGCAA
AAGGGTAAGATTCTCGAAAAAATGGACCAGATCCGAGCTGAACTTTTGAAAAAGGGTGAA
AACAACGAATTTGGTATCCAGGACAACCTTCGACCCACATGTCACCGGCACATCAAGCGG
CATGGGAGCTGAGCTGGCGGCCACCTACTCTCCCCACTTTGCGAGCAAAGCTGGAGAGGC
GCACATTAATGCGTGACCTCCCCCGTCTCAGCCGCACTGCACACACACACACATCCCGGA
GAGTTCCCAAAGAATCCAGAAGCTCGCACAAGATTTGGGGTTTTTAGATAGATCGGAGGG
GAGAGGGGAGATGGCGGACTGGGGTCCGGTGATTGTCGCGACGGTGCTGTTCGTGCTACT
GACGCCGGGGCTGCTGTGCACGCTGCCGGGGCGCGGGCGGGTGGCGGAGTTCGGTAGCAT
GCACACCAGCGGCCTCTCCATCCTCATCCACGCCGTCCTCTACTTCGCGCTCGTCACCAT
CTTCATCATCGCCGTCGGCGTCCACGTCTACACCGGCTAGCCGAGCGCGCCCGCCGCCAG
CATCGATCGGTCCGAGCTCCTCCGCTGGATTTAGTTCAAGATCTGTCCGTCTGCAGAGCT
ATCGGCTAATGGTTGTGGGGTCTTGTAATCCGATTTGGTGGTATGTTCTTAAATTTTCGT
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GTCGATTGAAAATTCGAGTACGATTCAATTGGTCGTTTGTTTTGCGTTCGAGTTGTTCAG
GTGTTGGTTCAGTATATCCGATTGCACTTCAACGAGGAATTTCAGAATATGTATAACATT
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TTGAAGGCCAGATTATATAAACTGTAATAAAGGTTTTACATTGCATAATGACCTGTCTGT
CCTCTGTTTTTTCTTTTGAAAAAAGAAAAGGATGGCGGTGGTAGGAATGTAATTATCTTC
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CTGTTTGGAAACATAATAGATNNNNNNNNNNNNNNTATATAATCTGGGTGGTTCCAAACA
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GCTTGTGTGGACTTGATTGTCTACTTATTGATCACATTTTCTATGTGCATAGTTTTGTAT
GGATTTAAGGTGTTGGGTATGAAAGGCGTGGTTGTCTCCATGGACAACTGGGATTATAGG
TTCCTTCCTACGACTAGTAGAAGGCCCGTGCGTTGCCACGAGCTTTTAATTTATTTCTTG
GTTACATAGGCTAAGACAACCTTTTGAACTTAATACTTGCCATTTACTCCATCGCTATGA
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TTGTTAATTCATTGCTAGACTTGAAATGGGCACCATGGCAATAGTTCTGATACTTATTCC
TTCCTATATTATCATTTAAGGAAAAGTTAACTAACTGCCAATCATTGCAAAAGGGGTGGC
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AAAAACTAAAATTTCCTTCTCTGACAGAAATCGCCATGTCATTCTGAAGAAACTATCATC
CCCTCTAACTGAAAATGACAATGAAATCGTTCGCAAATGCCACCTCCTCCTGGCGACCGT
TCTTCAACAAAGCGGGTCCATAATTTATGTAGAAAACAAGTCAAATAGACACTAAAATGA
ATACAAAAGGATGTATGACAAGAGCTACAACATAATTTTTGTTGCAATCAAATAACAATT
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TCCCCTCATAACCCGCCTCCCGGTACCGAATCTTTTTCAAT