Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_113713 (4693 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_113713

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_1553 4 1828 bp AK376609 Available Available None





CDS Structure of MLOC_1553






Contig Sequence (4693 bp)

>contig_113713 4693 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGTTAAGGACGGTCGTTTGACAGGTCAAGTGTCGGTCTTAGAGTCGGTCCTTAGAGTACA
AGTTGGTTGAACAATAATGGTTGTGGATATCTAACGGTATTGTGGAAAAAAAATAACATC
TTGCTTCTAAAATTATCCCGAAGGTTGGTTGTACCACCCGGATAATTCCTCTTTATTTTA
TGTCTTTTCTGTGGTGTCCCTAAGGCGCCCGATTGTGTCTTGTTATTTATTTTTATGCTC
TTTCTATGGTACCGCTAAGATGCCCGACTACGGCTTGTTATTTAGTTGTATGCCCTTTTT
GTGGTGTCGTTAAGACGCCCGACTGCGCCTTGTTATTTATTTTTATGCCCCTTCTCTGGT
GTCGCTAAGACGCCCGACTNNGGCTTGTTATTTATTTTTATGCCATGTATGAGGTGTCGC
TTAGACACCCGACGGTGGTAAGTTAATACTTTTTAACCTTTTGAGGCGTCGCTCCAGACA
CCCGATCGGTGCCTTTTTATTTTTCTGTTGGGATATCTCGGGAGGATTGCTGCCGATTTA
TCCACTAACTTACTTTATTTCTAACACACCTATTTGATAATTATGATCTGAACCATGCAT
ATTAACAATTAACTGCATGCATCTCATCTTTTATACAAACTGTTTGCTTGTTGATGTGGC
CAGATATGAATGAAGGAGACATCATGGAAAGAATTCGATAGCGAGTCCGATGTCTAGAGN
NNNNNNNNNCAGTCTTGCGATCTTGGAGTCTGCCACTGTATTATTTCACCGCATTCGTTA
CCACGAATAAATCATCAAGCCTCACTCTGACGCTTGGCGCGTAGTAGTAATTGTCATGTC
ACATTACTCTGATGTGACGTGCCCCTTTTATTACAAGCAGTAAAGATATCCCATTACCAC
AGTAACATATTCGTATGTGTGAAACTTGGACATGTTGTAATAATTTCTAGAGCGATCTCT
GCTCTACTCTGTTTAATATTAAGTACTGCTGATTTTCTGTATCAAGATGAGTCTATCAAT
GGAAAATATTTTTCTACACTGATGACGCTCATGGTTGATTTCCAATAAATTATTTTATTT
GGAAACCTGTCGTGACAGGCTTGGCATATGATTTGTCAAGTGGAAAATCGGTAGGGCCGA
GTAGAAATAGTTGGTGGCACCGATTTTGCTCGTGTGGATAGAGATATTTTGTGAGAGAAT
GTTTGAGTATTTTTTGGTGGCTACCTCTAAGCANTTGAGCAACCAATTCATCATAATATC
CCACCCCCTTTTAATAGTATTGGTTTTCCTATCAAATCAAAGTGATTTCTCACAAATGTA
CAATGTAGAATCTTCTTGCTTGAAGCTTGAGCCAATCATATCCCTTTCCTTGCATCAAGG
GGCTTCTNNNCACAATCCTATAGCCAAGGCATGTTTCAACCTTTTTCCAAATATACTTGA
ATAAGATCATTAATCCAATGATGCATATGTTATGATCAATTATCAAAACTATCTTAGAAA
ACAATTATGCTTCCAGCGAGTAAGCCAAATCTCAGGCCAGTAGAGCTTGTATGAGCTTAC
CATAGCCTATCAAACAAGCCACAAATGAAGGAACAACAGTATGCATAGAATATCTTGGAC
AAGTGGATGCAAACCCAAAGAAAGAAAATAAAAAGAAAAAAAGGAGATAAACACACCAAA
ATTGCTTTTGGAGGCCGAGCTCCATGAATGCCTTCAAATTCAAACTTCATTTTTTTGAAA
AAAAATATTTTAACATTTCAAAAAAAATCTGAAAAAATACATAGGTAGATAAAGGTATAA
CACACAAGTGTGTAAATTTTTACAAGTAAATAAGTTGAAATAAGGGCTATGCAAAAAAAA
AAAAATCTAAAGCTTTTTAACACATGACACTATTCATCCTCTCAAGCCTTGATTTTGTCT
TTTTTGTATAGGCTGCGTCTTAAAGTATTTTCGCCTGAAATTTTACATACACACAGATTA
CACACTTGTTTAGTTGTACATTTTTTTCAGATTTTTTGAATTCAAAAAATTCGAATTTTG
ATTTTTTTTAAAAAATCAGCCTCCATGACTCCCGGGTGCCAAAACGCCATTCTCAGGAAC
ACAGCTACAGAATGGCCGGATGCAAACCCAAGGAAGTAAGAGAGCCTACTGTTTCGATAT
CTCCTGCTGTGATCAAACCATACTCTTGTAAGAACTGGCGGCACAAGTGGCCATCATAAG
CTAGGTTGAGGCAGGCAGCGTATAATAACAGTAAACCATAGACAGCCAGTACGACACCTT
CAGTATAGTGTAACAGCCCACGAAATACGTAAATAACAAGTAAGCAGTCCGTTTACATCG
TGACCATGGCTAAAGCCTTAATTGGTACAGGGTAAAGCATGCATAAGTTAAAAACACACG
CACACACACCTCACGTTACGATTGTAGTTTGGGCAATTACACTGGATTTCCTCTACATTC
GGACGCTAATCTCACGATCTCTAGCGTGGCTATCTTACACGCCCTCGTTTGGGCCAACAA
ATATATGTACAAATGAAAGAATATTGTACAAGTCAGCCCCCAAGAAGGCCCACCGGCAGC
GGTCAGTGACTCGGGCATTGCAACTGGCTGAGCCTTGCATTGAGGGCTTCGATGTACGTC
CGCAGTCGGTGTCGGTCAGATCTAGTCAGGGACAAAGGCGGGTTGAGGGCGAGCGATGGT
GCCTCGATCAGGAGAAAACGCAGTAAGCATATTGCCTTTGTATACCGCGACATGGCCGTC
GCCACTTTCCCCATCATCTCAACAACCTGCAACCAAGACCAGAAAGAAAACAAAATGAGT
GGGCGGACAAAATCGTAAAACACCAACGTTGGTTCTCGGATGAAACACAGCATGATGTAC
TTACACCACCATGCCTCCCATATTCTAGTGCATATTGAAATATTATTTCGACCGCGTCGG
GCATCGCTGTAGCATCTGCATGCATAGCCCACTATCAGCACAAAAGAAAGTCTTGAAAAA
CAGATGATAATGGCTCACGGCCCCAAGCAAGCCCCAAGCAAGGTACAGTACCAGGTATCT
GCCCTACAGTGCTTGCAAGTTCTTCCGCATGTTCAACTTCAGTGAGAAACTGCCTCTCAA
TCTGTGTGCATTCTTCATCAGCCATTTGAGAATTTACAAGCAAATGGGGAGCGTCAGTAT
CAAGCCCCTTCATAGTGATATCATGTGAGGGACTCTCTCTGGCAGCTGAAGCCGCATATG
AATTGCATATGTGAATTGCTTGCTTCCAGGTTGCAAGAATAATTAGCTGGATCGAGAATG
CCTCCAAGTGCCTGCCACCTTTTATCTTCAAAGATTTTGGGTGGTTGATCAACAAGACGT
AAAAAGAAGTTAGCAGTCACATAGATAATGCTCACAAGCTTACTTGAGGCAGATCAATGT
GATAGAAAAACATAATAGCTTGCCGCAGTAAGAAAAGCACACAAACATCTGAACAAAAAG
TTCCAACATCTCAAAAAGTTGAGATGAAATAAAATATAAGAGAATTAAAAAGGAAAGCAA
GGAAACAAAGACGAAAGAGTCATCAAGCATATAAATTTACCTCTTCTTTGACCAACTCCG
CTATGGTAGAAGCATACTGCCCCAATAATCTAATCCTGGTCAGATAATCAGATGGTGGTT
GATCCAAGCCATCACTCAGGTACGCAGATCCCTGTGAAGTACCAGATATTGGAGAACAAT
GACTGTCCAGGCTACCAGTTCCAGCAGACTGTTGCCTGTTTATTGCAGTGCCATTTATTG
GCATTGGTGCACTCGGAGCAGCTAAGTTTGGTGGCGATACAGAAGGATTCTCATATTTAG
CCGGCAAATTGCGCTGTAGAGAGGCACTTGTTGAAGAGGAGGATCCTTCCGCATGTCCAG
ACACAAAGACATATTCCTGATCTACAAACTCTAATGAATCAATGATAGGGGAATCTACAT
TACAAAGCAAAAAATAATGAATTCAGTAAGAACTATTCACAATGATAATGAAGGAATGTG
TGATAAGACTTCGATACCTTCTGGATAAACACCTTTAGCCCCATGTCCTTCACCAATCTT
GCTTTCTTTGGTCCTTTGACCAGGATGGTCCAGACGCTGACTGCTAGGTGCATAATTATT
GCCCATAATGTATCTGGAGAACAGACCTGTATGCTTCGACGGACTCTGGCCTGAAGTTTT
ATCCAACTTTTTACTAGTAGCAAACCCATAAGATTTCAGTGGGGCATTACTCTCAGGAGC
AGGACTCTCCTCCTGTCCAGTTGACAGATCTAAAGGAAAAGGCATACAATCTTCTTGAGA
ACTTTGGCTCGAAAGCCTCATTGGACTGCTTTTCGTCAAGGGAAGGCCATCTCTTGTGTC
TGACGGTGTCCGACTGCCAATGCGCTACATAATATCAAACACATTGCATGATGTGGTATG
AAGAGCAAAAGTAGCAGATGTTACCTCAAGATTGTCTCTGGAGCATGTTCAAAGAGAAAT
GGATGATTCACAAACTCTTCAACTGTAAGGCGTTCCACTGCATCAATGACACAGATTAGA
ATAGTACCATTAATACTCCTTAATATATATGGTAACATTGTGATGACTTTAAAACTTAAA
ATTGCACAGGCAAAAAATAATTGTGGATTAATAAACAATTATCTTCCTCTGGTACAGCCT
AATTCACAACTCA