Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_112272 (6033 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_112272

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_1411 2 1387 bp AK376710 Available Available None





CDS Structure of MLOC_1411






Contig Sequence (6033 bp)

>contig_112272 6033 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGCCACCACCGCGACGTCCCCTGCCATGGGAGGAGCCACGAGAACGAGAGCCACCGCCAC
GGCCCCTGGAGGCTGAGTTGGCCGACGACTTGAAGCCGCCGCTGGAGCCGTGGTATTGTG
CCATGCGCTGGTCAATGTTACTAAGAATGGCGAAGAGCTCGTCAAGGGTTACCGGAGTGA
CGCGGGCGTCCAAGGCGGAGACCAGGGGCTGGTAATCTTGATCAAGCCCGTGGATGATGT
AGGACATGAGCTCGTCATCCTGGATGGCTTTGCCGGCTGCTGCGAGTTCATTAGCAAAGC
CTCACATGGTTTCCCTTCTGCGCGTTGATCAGCGCAGTTCGGATGTTGTTGACGCGGCTG
AGTGACTGCGACAAGAACATGCTCGCCAGCGCCACCCAGAGTTCTCGCGTCGTGGTGATC
GTGGTCACCGTGATAAGCACTTCTTTGAAGAGGTTTTGGAGCAGGTAGCCAAGGACCTGC
TGGTCTTCGCTCACCCAGGTTGGATGAAGGGGATTCGTCTCAGAGATCTCCTTCCCGGCG
GTGTCCTTGGTGATCAGGACTTTGACCGGTTCAGGTGTCGTGCCGTCGACATAATGGTAG
ACGCCGGCGCCCCGCGGCTGTGCTGTGATCTGAGTTCGCCAAAGAACATAGTTGGTGTGG
GAGAGTTTCTCCGGAACCCTGCCGCTGAGCAACGGCTGATGGGATGTGGAGGAAGACATG
GCGGCTGCGCACTTTAGTGGAGGCGGACTAGCTAGGTTAATGGAGGAAGATTGCTCTGTA
TACCATGTGCGACAATGCAGGAAACGTCTTAGCCCTCTTGGTCGACGTGTTGCATGTTAT
ATAGAGGGGTTGTGAGCCCAAACACACTTACAAGTTTGTTGGGAGAGATATTCTAGGGAT
ACAACTTGGAGAAGAAGGAAACAAGAGATAAGAGAAGATAAAGATTACATGAGTATCTAT
CCTGTCTAACTACTCCTCCTTCGATTGGGAATATCCTCCTTCAAGTATGCAATGCGGCTA
GCACAATATCACGTTTAACAAAAAGGACAGGAAGGAGTACCTCTTCTAAGTTTTCTTATT
TCTGAGCCATGGTATTTGCACCTAGTAAAGAGACTAGAAGAATTGAGGACATGAGTAAAA
AATATATTAAGGTGGTCGGATCCTTGCCCGAACCCTTGCGTGGACAGGAGCTACATGCAC
CGGGCTGTACGTTAATCAAAGGGAAGACTAAAATCGGTTGCTCAATTAATCCCAATGTGT
TAAACATTATGTGTGAGACCCTATTCTACTACTTTGTTTGATCTGGTAATCTAAAAAATT
CAATTCCATATCATGACATATCTAGGATAGTACTTCCACTTTATTCCAAAATACTTGTCG
TGGTTTGGAGTGGAGGGAACAGCCGTTTGAGAGAATATGATCGAAAGCTAACTAGCTATC
TCCTACCTAGAATGCATGAGACCGAAACACTGCGGCTTCTTTGATTGACATGATAGGGAA
AATGGAGGAACGGAAAGGGCATACCAATAAGATATGTGTGAAACAGAGGATTGAAGAAAA
TAAGAACTCTGAAAAATTGGGCCGTTTGATTTGCAGGAAAAGAGAGACCATAGAAATTGT
AAAGGTGGCCATTATATATCAGCTCAAAACTCCCTTCTTGCGGCAATTATTTGCTTGATG
GAATGCCAATAAGGTTCAGAGTTACGGTTTGTCTCGTACAATATGCACAGGCTAATAAGG
TTCGGAATTACGTACACACATAAATGGACCCAGGCCCAGCTGCAAGCTATAAAGATCTAG
CTAGAAAGATAGGGCACTCTTATGTTCTGTGCTTTTCGGAGTATAGTAGCTTTGCTCGTT
TGGGCAGGAAAGCATCCAATGCCCGGCATTCTATTGTACTGTCTATGTATCTATCTGCAC
CTTTGGGCTAAAAGAAGAAAAAGTATGGTTGATAAGACAAAAGAAAAGACTGTCTTAATA
AGGCAAAAACAACTGCCTACACACATGTACATGTATGGACGGCGAGCAAGCTTGATAGTG
AGATCTAGGTACAAAGATATCCCCCCCCCCTCCCCCCGTAACAAAATATAAGACTTTTTT
TATGCCCTAAGCAAAACCAAAAAACGTCTTATATTTTGGTAGAGGTAGTAGATCATAGAG
TATTTCTGTTATGGCTTTTTGGGAGTAGACGTTTTGGCCATCCAATACCCAGAATTGTAC
ATATACATCTATTATCTGTGCTTTTATATAGCCTAGAAAGAAGACAATGGAGTGTCCTAC
AATTCCGAAGAAGTATAAATGTTTCCTCAGCAAACAAACAGAGCTGTATTTCTAGTCCTC
CTAGAAATACGACCAGCAGCATATGCATACATGTGATGTGTGTCTCCTTGATTTCACCAA
ACCAACCCAAATCCTTCGACGTGTAGACGCAGACGCTTGCCGTATTTACACCAGGCCAGG
GGCCACAATTTTGTCGGCACGGTGAACAGACACTCACTCCAAAAAGAACTTGCCACAAGT
AACTTTGCCTGTCTAGCAAGCAAAGGGAGAGGAAGCGAGTTCTAGCAAAGAAAAAGCAAA
GGAGAGAATGAGAGGTATATTTTCTTCCAGTACGACGCGTGAGCTTAATGATTGCTCAAT
AGTTACTTCCTCCATCCCATATGTGAATATATTGAATGTAATAACGTCGTATATTATGGG
ATGGAGGGAGCTATGGAGTTTCACGTTAAGCTAGTTAAAGCAACAAACTACATATTATTT
TCTCAAGTTACACCATCTAATCAACCCAACCCAGCCCATAGGAGTTCAATGTATAGTTAG
TTCCAGAATCTAGCATCAAATTTCGTGGCCAGATTGTTGAAGAATTTGATTTTCTTAGAT
ATTTGTTCTAGTACCTGTTAACTAGTGCTCACGGGTGCTCGCCAGCTTAACAAGCTTCAG
ACGATTGTGAGCAGGGTTTTCGCTTGTTAAGCCTACCGAATATAGCAAGCACGAGCTTAA
TGCGTACCTCGTGAACTAGTACTAATTAAGGCCATGTACAATGTTGAGAAGATAGTTTTC
TCTTCATCATCCCCGTCATCCACTCTAGAGATGAAAATAAAAAACACACGTTAGTATATG
ACTAAGGGGATGACATTTAGGATAAGGAACAAAAAGTTGGTTTTATCTTGAGTTCTCAGA
GAGATCATCTCTTAGTTAAGTACTCCCTCCGTATACTAATATAAAAGCGTTTAGATCACT
ACTTTAGTTATCTAAACACTCTTATATTAGTTTACACAGAGAGTAACAAGGAACTCACAA
CTAACCTTTCATTTCTCCCTCTCGTACAAGTTACTCCCTCTGTTCCATAATATAAGAGCG
TTTTTTACACTAGTATAGTGTCAAAAACATTCTTATGTTATGGAACGGAGGGAGTAGTAA
TTATACTAAACGATGGCACCATCACTAAAACGAAAGAAGACTGATATATCATCCCGTTGT
AGGTGACGTGGTGCACTCCTAATGAAGACTCCACATGCTCCAGAGGGCCCAACGGCACTC
AGCCTTTAGCTACTTCTCTCTCAACATTTGCCTCCTTTGCTCAGTTGTCTATTTAAGAGA
GGAGAAGGATGATGAGTTAAACAACAAACCGAAGAAACCTCCACTAAACCCTACAATAGG
AAGTTGGAGCATAAGACGAGATCGGAGTAACCAGGTATTGATCGATCCGACCACTCCCTC
CTTCCCTCTCCCTGCCGTTGTGATGTTCACCATTCTGACATAAATTATTTAAACTATTGT
GACCGTGATAGAGATTATGGCTTCACCATTTTGTGGCATCTCCACATGTGGCCTCAATGC
CGCCGCTCCTACGGGATTCTCCACCAAGAAGACGCTTTCCCTGGTTTCGCCCACATTTGT
TTCACTTGCCCAAGAAATCAGGCCTAGGAGAAGGTGCAATTTCAGAGCAAATGCCGCAAA
GGAACTGTATTTCAACCAGGATGGGTCGGCTATGAGGAAGCTCCAGGTGAGTTGTACAAC
CTAATTGCTCTCAGTTAGAAAATGCTACTATAATCTTGCGTCTTTCCGGTTTTAGATGCC
AACATTTCTGGTTGCATGTTTCCCTATCAGACTGGAGTGAATAAGCTCGCGCATCTGGTT
GGAGTTACTCTTGGTCCAAAAGGACGGAATGTTGTCCTTGAGAGCAAGTATGGACCACCT
AGAATCGTCAATGACGGTGTTACGGTGGCGAAAGAGGTATGTGTCATTACAATTTATTCT
TACCATGCAATCCTAATATAAGCTGCCCTCACAAAAAAATCGTAATGTTGGCTGCTGACC
AGGTTGAGCTCGAAGACCCTGTCGAAAATATTGGAGCTAAATTGGTTAGGCAAGCTGCTG
CTAAGACAAATGACTTGGCTGGTGATGGTACAACAACATCGGTCATCCTTGCTCAAGGAA
TGATCACCGAGGGTGTTAAGGTACACCAATATAAAAATCTTGTGTCTTGTCTTTGATAGC
ATAAATATTTTATATATTCGATCGGTTCGGTAAATAATGTTAGGTTTGTTTACTTTCTCC
AGATTGTAGGTGCTGGTGCTAATCCAGTACAGATTGCCCGCGGTATCGAGAAAACAGCCA
AAGCACTAGTCTATGAGCTCCAAAAGATGTCCAAGGAGGTTTAGATTTGCTAATCTATTA
TTCAGTTCTGGAAATACATTCATTCTGAATTCTATATCACATTTTCTCTATCGTTCTATG
ATAAATACTCGAACGATCTTGTAATGCAACAAGAAAATGCATTGGATTATAGTAACTCTG
CTCCCTATGCTAATTATGAACGGAGCAGATGACTCACCCCTAGGCCCTAACTACCATTCA
TGAGATATTAGACCATTGTTTTCATTTTCAGGAGCCCTAATCCTCATTTGAATCTCATAT
ATTATTTTTCAAAGGGAGTACCGTCTATTTGAAATTCAAATTTGCCAAGTTGCATTAAAT
ACTGCAGGTCAAAGATAGCGAACTTGTCGATGTTGCTGCTGTAAGTGCTGGAAATGATTA
TGCAATTGGCAACATGATAGCTGATGCTGTGAACAAGGTTGGGCGACATGGGGTAGTCAC
GCTCGAAGAAGGAAAGAGTTCTGAGAACAGCCTCTATGTGGTCGAAGGGATGCGGTTTGA
CCGCGGCTATATTTCTCCCTACTTTGTAACCGACGGTGAAAAAATGACAGTGGAGTATAA
CAAGTGCAAGGTCTGTCACACATTGTCTTGGAAGTTCGTCTACTTATTTCAGTTAGCACA
ATCTCCATGAGTTTTTTGTGCTCTTAAGCTAATATATTTATAATATTGCTCAGCTCCTTC
TCGTGGACAAGAAAATTAACAGCGCCAAAGATCTTATCGCTATTCTAGAGGACGCTATTA
CGAGTGGATATCCAGTTCTAATAATTGCAGAGGACATTGAGCAGGAAGCTCTTGCAGCCC
TCGTGCTCAACAGGCTTAGAGGCTCACTACAGATTGCTGCTATAAGAGCCCCTGGTTTCG
GGGAGCGCAGGAGCCAATACCTCGATGACATCGCCACTCTGACAGGAGGTGGGCTTGATG
ATTGGTGTGATACGATGTGTCCCGTTGTGAAATTTGTTCAGTTATAACGGTCATTCTTCA
TGTAGGCACTGTCATCAGAGACGAATTTGGAGTGCCCTTGCATAAAGCAGACAAAACAGT
CCTAGGAACTGCTGCCAAGGTTGTAATTACTAAGGATTCAACAACAATAATTGGAGATGG
TACTACACAAGAGGAAGTAATCAAAAGGGTGACACAAATCAAGAACCAGATTGAGGTCTG
TATATATTTGTCGAATCATATATGTGTTCTTGTTTTTCTCATGGCTCTTCTTTGTTTATC
AAGTCTCTTTTGGATGCTCCATTTCTCCTGTATATGTAGTTCAATTATCTTGCCTTGCGC
AAGTGCGTGTCTCACTTAAGTATGGATGAAAATACCCTGGCTAAAATTTCATTCCGAAAC
ATTTTTTTTCAGGCTACAGAACATGAATATGAA