Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_111355 (6799 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_111355

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_1297 3 2374 bp MLOC_1297.1 Available Available LOC_Os06g07090.2, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13106.m00737 protein AP-1 complex subunit gamma-1, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_1297






Contig Sequence (6799 bp)

>contig_111355 6799 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAAAATCTCACAGCAAATCTGCAGTGCATTCTGACGTATCTCTTGTTGACCTTCTTCCAA
TCAAGGGATATGCTTATAATATTGTACTCTTCGAGTACAATATTATAAGCATATCCCTTG
ATTGGAAGAAGGTCAACAAGAGATATGTCAGAAACTAAGTCTGGGACACTTATTTTGGGA
CGGGAGTAGATGTTATACAACACCATAAGCTCAGTTTTGCTCTTTTTTGTTTGAAGAACA
ACTTTTGCATACTTGACCCATTGCTCATGTTGTGTTAATTACTGTATACTGTTGTTCCTT
TAGCTCCAGCTTAGGGTAGTGCTGCATGTGTGTTGGATTAGAAGACCCATGAAAGATTCA
TCTTTTCTTCCCTATTTACTGAGAATGTACCACAAAGCACATTTTGTTTGGTAATCGGTA
CTTGTTTGCATATTACATTGGAAATTAACTGCGCTATTTTTCCAGGTTGCAACAAAAACC
GAGTCAAACAAGAATGCTGGAAATGCCATCTTGTATGAATGTGTTGAGACTATAATGGGT
ATTGAAGCTACTAGTGGTCTACGTGTCCTGGCTATTAATATTCTGGGTAGATTCTTGTCA
AATCGCGATAACAATATAAGGTTATTTTTCTATTTATTTTCACCTTGATTGCTCTGTTTT
TTCTCTTAATACTTACATCAGTAAAAATGTTCATCCATCTGCTCTGTTTGGGGTAAAATT
TCACTGTTAATCTATTTTTTTCTTTCAGATATGTTGCTCTGAACATACTTATGAGGGCCA
TTACAGTAGATACACAAGCAGTACAGAGGCACAGGGTGACAATATTGGAGTGTGTAAAGG
TAACAATAAATATAAATCTGTCCGATATGCTGAGTATTTGTCTTCTACTGGGGTTTGGGG
ACCAATGTATGTTCAGTATCAGAATAAGGATTCTTGGTAATTCCTCACCCTCCGAAGGTC
CGCACTTGTGAAAAGTTCAATATTTTAGTACAGTCCACCCAAAAAAAAAGAGAAAATCTG
TTTTAACGTTACTTTATCTTCTATGACGTTTGTATTTCTTTCATCATCTCTCTCCCCCCT
CTGAATTTTGTGGAATCAAAACATGTCCCCGTACAAGAATTGCCAGAAATGCGGGGTTTA
TTCCTTATGCTTCGAGTGTGGTTGTGTTGTAAATAACTTTCCCCAATGCTTGGCATATGT
AGCCTAACATCTTATCAGGAATCTCATATTTCCCTGCTCCCTTGGAATAGATAGTTTCTT
ACTTGCTAAAGGTTGATTCATATTGTCTAGGCCTCTGCTGGCATAGTCATGTTCGGATAC
TGCTGCTCTTTCACAGCAATATCTAACTCAAGGTTTTACACTTTACTCATATATAAGTAA
CTCAAACCTTACTGTACAGTAATTCAGTGTTGCAATCTTTCAGGCTTTAATTAACATTTC
CATTTATTAATTTTGGAACCTTAGTTCTGCTATTTTGGAACAGTAATTCTGGAACATATT
GTCTAGGCCTCTGCTGGCATAGTCAGGCTGTAATCTATTCAGTGTTACTCATGATGTAAC
ATTTTCAATCACCTGTGCACCTTTCAGGATGCCGATGCCTCCATTCGCAAAAGGGCCCTG
GAACTTGTTTATTTGTTGGTCAATGATACCAATGTAAAGCCTCTGACCAAAGAGCTCGTC
GACTACTTGCAAGTAGCTGATCCAGACTTCAAAGAAGATCTCACAGCCAAGATATGCTCC
ATAGCTGAAAAGTTAGTATTTCTCTTTTTAGGGGGGTTTCCTGTTGATGTATGACACGTT
TAACAAGGTTGCGTCTCTAATAGGTTTTCTCAAGAAAAGTTATGGTATCTTGATCAGATG
TTCAAGGTTTTATCCCTGGTAAGTGCCAAAATGCAGTGGATCTATCTTGTATCGGAAAGG
TTTGCAGTCCAGAACATATTGGGTATTAGCAATGTAGCCTCTTCATTACAATGTTGTTGG
ACCTAGTAGGAAGACTTAGCTATCATCATTGCTTTCTCAATCTGTTTTATGGGGAAGTCT
GTGCACATGGTACACACCGGGACTAGCAAGTGAGGGTATCAGTGTATCACAGACTATCAC
TATCATTGACCTCCATTGACAAATGACAATACTGCATGAGAATATGGAGGTTGCAGAGAG
AATTTGATTTTGTGGCCTACTGGTGATACCTGTTACTTAAGTGATTTGATTTAGGTTTGC
GGGTTAGATTAAGAAACTGTTGGTTAAGTAGTTTGAAATAGTTGGCCGACAAAGATTACT
AGAATCATCAATAATGTGTTGTTCTTGTTCACGTTCGTTAGAAATCCAAGAAAAGTCTAG
CCATCTGAGAAATAAAATGTCTAGTAATGTGCTATTGGAAATGTATGAATTCACGTTGGT
ACTATTGAATGCATATGAATGCTTGAACCTACAAATGGAACATACACATACCTCCAGTTC
TGCAATGACCAATATAGAAAACAATTTCGAATTTATGCTGCACTTCTATTAACAGGCTGG
AAATCATGTGAAAGATGATGTGTGGCATGCCCTTATTGTTGTAATAAGCAATGCGTCCGA
ACTTCAAGGATACTCAGTGAGATCATTATACACGGCTTTACAAGCATACAGTGAACAGGT
TTGGATTTAGTTTTTATTCTTCATAATGTATGCCATTCGATTCCATCCATCTTAACATCT
CAGTCTATCTGACGTGTGTAACCTTGTTGACATTGCATATTTACACAACAGGGAAGTTTA
TTGAGAGTAGCTGTTTGGTGCATTGGTGAATATGGTGAAATGCTAGTGAACAATGTCGGC
ATGCTTGAAGCTGAGGGACCAATCACGGTGAGTGCACATTCTTGTAGGCCATGCTATTCT
TGATGTTCTGAACTACCTAGACAGGTTTCAGCTGTATTTTAAGTTTCACCTACTCCAATA
GCTAGCACATATATGTCACAATATTGTCTGATCCCCCATTATTGTTCTCATTCTTCTTTC
TGCTTTCACGATCTATATACTTCCAATAATTGCTGGCAGTATTTCTCGGCACAACATTCA
TTTAATTATGTGGTATTTAGTCTAAGAGAGTATTCGGATGAGTAAATTACATTGTGGGTA
AGAACAGCTTGTGAGGTGGATGCAACTATGTACGGAACTCTACAACCGTTTGTTTTGGTC
ACAAAGCTTGATTAGTGGGCTCAAAGTGGGTCAGTTAAAGGCCACTTGTGCTAATAATGC
TTAGTCAGCATCCAACAGTGAAGTGTCTGGGGCTTAGGCTCTCAGTCCCATGAACTTTTG
CAAGGCTAATATTCCATTTGGTAGTATTACTTTTCTACCGTATTGTTGTCAGACATCATA
CCAAACACATCAACTTGTGCAGGTAACAGAATCCGATGCTGTTGATGCTGTGGAGCTAGG
TCTTAACCGTTATGCTGCAGATGTGACAACTAGGTCTATGTGTCTAGTTGCTCTTTTGAA
GCTCTCCTCACGGTTTCCATCTATGTCGGAGTAAGATATCTTCCGACTTGACCTTGTACT
GTAGTTGAATAACTTCTAAAAAAAATACCTGCTCAAAGCTGCAATGGTTTTGGGAACCAG
TCTAATTTGTTCTTTTGGTTCTCCTGTATCCATAATATTTCGGTAATTTCTGAATACTGC
AAAACCATTTTCCACGATGACTTCTAAATCTATGCAATTGTATCATCTTTTATTACAATT
GAATTTTGGACCTGCTGGGTTTTCAAATATGGAGTTTTTGTCCTTCACTTACGATAGAAC
TATGTAATGCCGTATTGATGTCTACACTATGGTAGTCATATGGTGTATTTATGTATGATT
TCCTCATCTTTTTGTACATACTACTGCCATTGTGCATTTGTTTATGTTTCTCATCTTTTT
GGCATCTCCACGAACTTCTGTACAAATTCACCACATCTTTTAGATCCTTGCCATGGTGCC
AGGTTGTTACCTGGAAAGGCTTTACCGTGTTATATAACGTAAATAGTGTTAACTACTGCC
AACTGCTTCTTACATTATATTTACATTAAATCATATGATTTATCTTTCTTAACAGGAGGA
TAAAACAAATAGTTGCCCAGAATAAAGAGAATATGGTGCTTGAACTACAGCAAAGATCAA
TTGAATTCGGTTCCATTATACAAAGACATCAGTCTATCAGGTGGGCTACAGAACTTCTAA
ATATTACTGCATAGACTTTCTCTTTTATCCTGGTACTTATGAATGGTATTAACCTTACAG
AAATGTGGTATGAGTGCAGGTCATCTTTGCTTGAGCGTATGCCTGTACTGGATGAAGCTA
CTTATCTTGTGAAGAGGGCTAGTGCTACACAAGCAACTATTCCAGCATATAAGCCTGCAG
CAGTCACTCCTGGAGGCCTTAAGCTTCCTAATGGTGTAGCAAAACCTGCTGCAGCTCCAT
TAGTTGATTTGCTTGATTTAAGTTCTGACGATGCACCAGTCACTACCACTGCTTCTGCTA
CTGCAGCACCTAGTGATTTTCTCCAAGACCTTTTGGGTATTGGTGGGACAAATTTATCAA
CTGCAGGTATTTTGTTTTGCATTTCCATTATTGTTCTCTTGGACATGCCTTGTTACTTTG
CTTCTCACTTGACGCAAATGGTGCTAGATGGTACTTCATAAGTTCCTTTCGTTTTGTTCA
GGAGCACCTTCATCTGCAAGCACAGATATTCTAATGGATCTTCTATCCATGGGATCGTCT
CCTTCACAGAATGGTCTGCCAGCTCCAGGTTTGAGTTTTCCTGCCCAAGGTAAAAGTAAC
TCTAATTGTAACAATGACCTTATTTTCTGTTTTTGTAACCATTGCTGATCTGTCTAACAC
TTCTGTATAACAGAGAAAAAACCCGTTTCTGCTACACCTCAAGTTGGTTCTCTTGTACCT
GAACCTATGGACCTACTCGGCAGTTTGTCATCAAGTGCATCTATTTCTGGTTAGTTTGGT
TGATGCTAACAGTACCAGTTGCTTCCTCTGTATCTGTTTATCGCCAGTCCCAAATTGTAA
TACTTGTGCCTCAGGAACTAAATCCACTATCGCTGCACCTCAAGCTGTGGATCTGCTCGA
TAGTTTGTCACCAAGTACATCCGTTTCTGGTAAGTTTAGTTTTAGAGTTTTGCAAGGAAG
AACTGACCATGATATGTCAATGTTCACTGAAAATTCTATTTGAGCAGGACTTGAAGATAC
TCGTCCGTCAATAACGGCTTTCCAGAGTGCAACTTTGAAGATCACCTTTGATATCAGAAA
ACAGCCTGGAAAGCCACAGGAGACTACCATCCATGCCACTTTTACAAATTTGACATCTAG
CAATTATACAGATTTCATTTTTCAGGCAGCTGTTCCAAAGGTAACATCATGTTCCCTTGG
GTCAAGGAAATATAGCCTAAAATTGTGGTGGATGCTTGTTTCTTTGCTTGTTTTATTGAC
TAATGGCTAAAATATTTTCTGATACTGATGGAATGTTCCTTATGCTTTCCTAAACGATAC
TGCAGTTCATTCAATTGCGACTGGATCCAGCTAGTGGTAACATTGTTCCAGCTAATGGGA
AGGGTTCAGTCACACAAGGTTTCAGTGTCACGAATAATCAGCATGGGCAGGTTTGATTTG
CATCCTTCACTTTGGGTTCATCTTCCTGACTAGATTGGATTGCATTCCACATTGGGAATT
TACGCTCCTTTTATAGCTGAGACCATCCTATAATGCATAGTGCATCATTTCCATTCATGT
GCCAGTTACCAGCATGACAGCATGTACATAGCAGGCTGAGAAGTGAATTGTCTGTAGAGT
TTGGTAGTGCTTTATAAGAAGAGAGTCGATTATTCCATCAGTTATCAGAGGCTACACTCT
AGATTGCCTATCATGTCATCGTACTATGGTAGCACCTGCATAAATAACCTTTTGATAAAT
GAACACGGTTAGCCATGATTAGAGAATGAGTTTATTTGGTTTCTCTTCGATGTTTTGTAC
TTATCGTTTCTGCCCTGCTGCGATGGCTGATTTATCTTTGTCGCCTCTAATGAATGTTCA
CGCAGAAACCACTTGCAATGCGGATCCGGATGTCTTACAAAGTGAATGGCGAGGACAGGT
TGGAACAAGGCCAAGTCAGCAATTTTCCACCTGGAGTATAGTGCCATTTGTGTGTAACCT
ATGTTTTGTTGTGATAGCTATGTTTGTGCCCGGGGCAGAGGGGAGATTCTTATCTCTTGT
TATACTTTTTCGGCTCTTATTCCCCATTTGAGGGCACTTAAACAGATAGTCCAGCTTGCC
CATCATTGTCTCAATATATAGTGTATAGTAGTTCACACCAGTGTAAAATCTTCGGAATCA
TCATAATGTATTTTCATGCATGTGTATTTCACATTTAAAGATAATCAAAATTATTTGGCA
TGCCCCCTTGAGTTATCAAGCAATAAATGAAAAACTTGTCGCAATCATAGTTGTTTGGGA
ATTTCTTAGTTCATATTACCTCCGTCCGAAAATACTTGTCCTAAAGATGAATGTATCTAG
ACTTATTTTAATTGTAGATACATCCATTGTATGCATTTTTAGGACAAGTATTTTCGGACG
GAGGGAGTATTAAGTAAGCCAAGATGCAGGAACTCAACCAAATGAGTTCAAGATCAGAGG
TGTTTCTTGCCTTCATCATCCGTTGTCACTTTCTAATGGAGATTTTTCTCCAGGAGATCG
ACTCTCTCCTGCTCGTCTACAAGGAGATGTAGTCATCGCGTTTGGCAAGTGACTTTTAAG
GGTGTGTTTGGTTGCTGTC