Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_111288 (2904 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_111288

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_1293 1 306 bp None Available Available None
MLOC_1292 1 231 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_1293






CDS Structure of MLOC_1292






Contig Sequence (2904 bp)

>contig_111288 2904 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCCCGCATCTTGATAGCCACTTTCCTAAGATTCTGTGCAACGTTGCCACCTTCCGCCCTC
CCTTCATCCCATGCCTCCTTGATAGCTGCTGGACACCCCTCCTCCTGTAGCCACCATGCT
TCAAAGCGAAACCCCCTATCGCCCCCTTGACTCTGCCGGCCGATTCCACCCTCCGTATTG
ACGATTAGCGGTCTATGATCCGAGTGGCATAGACGCCCATGCACCACGCGCACTTGCTTG
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CTCCGGCCATTGAGTGACAAGAGTCTGCCACCGCACCGGCGAGCGCCCCGAGATGCATCT
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TGCCTAAACATAGCAGCACTTATGTCACCTTTCCAACTTGTATTTGTTTTCCTATCGTGC
TACCCTATTGGTTACTGGAAAACTGGACATGTATGTTAATGGACTACAATATGGATGACC
TGCAGGTGCATCTGGTGGAGTGGCTCAAGATGATGGTGGGCATGAGAAAAGTTGAGGAGC
GTTGAAGGACTGTTTGGAGGCTAAGTGTTTTGATCAACAGAACATATGCTATTCCAGAAG
ATTTTAACATACTAACTAATGGTTTCTATAATTTAAACATATGCAATGTTCACTTATATC
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TGCTTGTTCTCTCATTTTCTGGTAGTAGATCACTATCCTATAAAATAATAGTTGTGTTGC
GGGCAATTAACATCTACACTTTTGTTTGGTTGAGATTATACATGCTTCTAGATAGTGCAG
AGTACACAAAGAGACTTTAGAACTTGCAGAAGTATATATCTGTATGTTTAATGGTTATTT
TGAGTTGTTATCATTAAGTTTGTGAGATGCTAATTATGCTTTTACTAGGGTTTTTTTCAT
GCAAACAAAAGAGAACTTAAAGTTATGTTTATATGGCTTAGGTTATGATTTATGTTTATC
CCTTCTAGAGCTTCATGTTATTTA