Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_110239 (3227 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_110239

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_1185 1 775 bp AK364404 Not available Available None
MLOC_1186 1 478 bp MLOC_1186.1 Available Available None
MLOC_1187 1 434 bp MLOC_1187.1 Available Available LOC_Os08g07950.1, FRAME:-3, EVALUE:3e-27, 13108.m00818 protein NB-ARC domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_1185






CDS Structure of MLOC_1186






CDS Structure of MLOC_1187






Contig Sequence (3227 bp)

>contig_110239 3227 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGAGAACCAATGCCATCTGCTCTCTAATTGCTACATCACATGTCTCGTCCACTAGAATAG
AAAACTTAGAATCCTTGATCTCTTCACGAATATGCTTCCTAACTTTCAATGCTTAAATAC
CCAAAATCTCTTGTTGGATTCCTAACTTTCAATGCTTTTCAGAGTACTTTGAACAGTATG
GAGCATTCTCCAAAATAACTTCAGTAATCTCAGGGTTGAATTCCGCAAGGAGCTTTAACA
ATTCAATAAAGTTCCCTCTGTTCTTTGACTCTGGAGTTTCATCATGGCCTCTAAATGCAC
AAGATTGTGTTGTAAGCCACTTAACAGCTGCAATTGATACTTTCACCCTCAGCCTGTTTC
TTTCTATCTCCCTCTGGTTTCCCACTGCTACAACATTTTCTAAATGGCCTTGCTGATTCA
AGAAGTCATGCCATGCTTTGGTTGCATTATTATGTTAACAGCAAGGTTCAGAACCTATGT
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GATGACCACATGGCGGCCCTGTCTTTGGGACAGTTGATTACAGTTTATAGTTCAGCGATA
AGTGATCAGTTAATACAGTAGCTTTAAATAGTGCGTGGTATGACCGCTAACGCTGCTATT
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TGAAGCTAGACTTTCCTACAATATGTGTAAGATACTAGCATCAAAATATTATTTTTTGTT
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GCATGTGCATGGTCAAATTATTATTGTTGTAATATCAAACTGGTATTTTGGTAAATATTG
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AATTTTACTTTTCTCTATATGCTAAAACAATAGATTTGAGCATTTTCGTTTTAGTAAATG
ATAAATATAATGAAAATGGGCATGTTTAGAGCAATACACAACCAACGGGATGGACAAAAC
TGCAACCACTTGACGACAAGTCTATTTCCTTTATGCATTATTTTATAGTGTAATTTGCAC
CATATCCGTTCGCGAATAGGCTTTCATATTTTTATATGATAAAAGAGGAGGAACAGTAAA
CTACCTAACATAATAATTGTCTCTAATGTATACCTGGATATCTATTCTCTTTTGAATAGT
GAACAATCAAATTGTATTTATTGTGTGATTCTGTGAAGCTCTCTCATTATCTATATAAAG
TTAATTGTTTAGTTTGGTCAGAATAGGTCATAGGTGAAACGAAAATAAGAACATTTTATT
TTAAATATATTGTGAAATTTTCAATAAATAGTTTGATATCTTATCTAAAGAGTGCATCGT
TTAGTAGGTGATTCATTTCTATTATGTTACTTCATATACATTTTTCATTTTTAGTATGAT
AAGGATATATGTTAAACTCAATGAAAAGACAAGATGAAACTTTCCAAATAGAAAGCGGGA
CCGTTCAATTTCATTACTCCATGGAATTAAAAGTTGAATTCCATAATTTATAGCATAGGT
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GAATAATGGTGATGGTGTTGTTAGTCTTGACGCGTATCTTCTGTTTTGCTCTAAACCAGG
AGTAGAACGATCAGAGACTGCTGCACTGGGAGCTGATATGGTTATTATGACAATAAGTGC
AGTTGATGGGTGGACTGAACATGACACTAAACTTATCAAACGTGTCATGATTGATAAGGT
ACCATCAGTTTCATTTTCTCAACAATTTTGTTGATGCTGTCTGGTTACCTGGTTGTTGGT
TTGCATGCCTTCTGTTTGAGGAAAATATTCAGCAAATTCTGCATTGG