Map Locations of contig_108744 (7433 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_108744

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_1045 1 733 bp None Available Available None
MLOC_1046 1 1088 bp AK250137.1 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_1045






CDS Structure of MLOC_1046






Contig Sequence (7433 bp)

>contig_108744 7433 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATTACAATCCGGTTTTTATTGGCCTGCTCTTTTTAAAGATGCTCGTAAGTATGTCCTTTC
ATGTGATGAATGCCAAGGAGTTGGTAACATTGGTAAACGTCACGAAACGCCTATGAATTA
CTCACTTGCTATTGAACCATTTTATGTCCCGGGCTTTGATTTTATGGGACCTTTTNNNNN
NNNNNNNNGGTATACTCATATTTTAGTTGTTGTGATTACATTACTGAGTGGGTAGAAGCA
ATTCCAACTAGTAGTGTTGATCATAACACTTCTATTAAAATGTTTAAATAAATCATTTTC
CCGAGGTTTGGAGTCCCNAGATATTTAATGACTAATGGTGGTTCGCATTTTATTCATGGT
GCTTTCCGTAAACTCCTGGCTAAATATGATGTTAACCATAGAATTACATAACCTTACCAT
CCCCAGTCTAATGGCCAAGTTGAATCGAGCAACCGATAAATAAAACTAATATTGCAAAAG
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GGACAGAGAATTAAGCATTACATCTGAGGTACGTCCATTAATGTTGAAACTAACATTATC
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AAAGTATGGGGCAATGTATCATGTGTGCGACTTGAAGTTCGACCGGGTATATAAATGTCA
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CTCAAGAAAAATAATTTTTGAAATATAAAAAAATCAACAAAAAATGTATGCATTTATAGT
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ATGCATCTTGGGGAGTTTACTATGACATTATAGTAAAATCCCATAAATGAAAAAAATGTG
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AGAGAGAGAGGAGGCATGCAGATTTCTATTCACACTTGCATGCAGCCATGCATGTGAACC
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TATACTTCTATGGACAAAACAAGAGTGTCGGTCATTCATCTTTTTTTTTGGAAGAGTTGT
GTCATTCATCTTTTTAGTTTGGGAAACATTTGAAAACGACGCACCGACCGAAACACCTCG
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GCTCCCAGCCACCCATTCGCATGAATCCCACCCATCCTTCCTCTTCTTTCTTCTTCCAGA
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TACTCCGGCCAGCATGCTTCCAGGCTGCCGTCAGGTCACATCGCAACCAAAAATTGCACC
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CTACAAACGTTGTCAAATTTTGCTACAACCAGCGTTCAATTTTGCTACAAACTGTATTTT
TCTGTGCTACAAACGGTGTCTAGTTTTCTGCAACTGGTGTCCAATTTGGCTACAACCTGC
ATTTTACCGTGCTACAAACGGTGTTGAGTTTTGCTACAACCAGCGTCCAATTTTGCAACA
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CCGCCGCAGATCGGAGACGGGAAGACGCGGGGGCAGGAGGCTCTGTTTTCCCACTGTGCG
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TGGGTTTGTCCGCAGATCCAACGGATGTGAATGGCTGCATCCGACGGTCTGGGCTGGACC
GGCCGAACCGTTGTGCCGGTCCGCCGGCGCAGATCGCTGCCCTTTTAGTTTTTTTTAAAA
GAATTCTGTCATTCATGTGACAAAGAAGTCTCCACTCGGCAGGTCCGGACCGTCGGGCCG
ACTCCACACACACGGCTTCCGCGGGCCGCAGTAGAGTGCCCATTCTCCTCACGTATCTGG
GCCGGGAGAGTGTCACACTGCCACTATATATATGGGGCAAGCAAAGCCGCCCTAGGGTTC
TTCCTCCACCCCTTCCATTCTCTTCTTCCGGGAGCGCCGCCGCTTCCTCATCCCTCACCT
CTCCGCTCGGTAGCCGGAAGCGAAACCCCAAGGTGAGCCGGACCTCCCCCTCCTCCCCAG
CCCCCCGGTCGCCTCGTCGGCGCGTCGCTCCTCCGTAGCCCGCACTAGCTGCTTCCTCGC
CGATCGCTTTGACCGGTTCCAGCCTCCTCGCTAGCTGGATGCGCGCAGTTCCCTTACGCT
GGATTCGTCGTCGTTCCTCTGCGTTTTTCCCGTTCCCAAGCGCTGTAGATCTACTAGTTT
TGTTCGCCCATGATTGCCTGTTTCCGGATGGATTTTCTTCTGACGTCTGTAGATGTTATT
CCGTCGCCATGAACCTGGATCTGTTGTTCCGGTGTTGGTTTTGGCCGTTTTGCTATGCTG
TTCGTTCAAGGGGTTTGATAGAATGCTCGAGCTGTAGGGTATTTGCTCGCTCGTTTGCGT
GCCTGTCGTAACCTGGTGGGCGCTGTTCTCTGCTCATGCTCAGATCTTAGAAAATGGTGT
CATTGCTTTGCATGTTCAATTTGATTTGAAAGGTAGCTACCGGTAGTTTATCATCTTGTG
TTTCAGCGTTTTTTCTAAGTTTTGTTCAGTTACTCTGCATGAATTTCTCTCTGATCTGCT
CATTTCGCTTGGATGATTGCATGCTAGTACTTTCCTTGTTTTCCTTGACCCTTCCCTTGC
ATTGATGGTTGCACCACTTTAGAGTTCAACTTAATGACGTTCTCTTTCATTGTTTTTACT
GTTTATATTGGTAATGACATGATATTACATTGAGTACTTATGCATAAAACTGTGGATTCC
GTTACCGATCAACCTTTGCTTCCATTACATTTACCCAAGTCTTATCTTCTTCTGTAATCA
CCTTTACACTGTTTGGCCATTTGACAATATTTTCTGGGGAAGTTTTTCCCTATGTTCCAC
CCCTTCATAAGCTCTACGGACCTGGAAGTACTTGGGTGTTTAGTTAGTGAATCCATTTCC
TGTTTTTGCTTCATAGCTTTTGCATGTATGCTCTGCATAATGCATTCCATTTCTTTGTTA
TTGCTATGTGTTACTTTTTCTCATACTGCAGTTGTCAGTGCTCTTAGTATTAGCTGGCTT
GCTTTGTTGCTGCATTCTCAGTGCACTTTTACTAGTTCTAGTATATTAAATTTAATCAGC
TCAATTGACCATATTATATGTTTCTCTTTATTGGGGCTGTTGGTGGAAATGTTTGTGGTT
TTAATAACATGGAACAGTTATTACTGTCAGATTTTCATGTATAGTTATTCAAACTGTATT
AGTGCTTTACACCCCAATGTTAAGTGCACTTTTGAGTGGACAATTGTAGTTTTAATTACT
TGAACAGTCATTATTGTATTACTGTCAGATTTTCATGTGTGGTTATTCAAACTGTATGAA
TGCTTACACCAATGTCAAGTGCACTCTTGAGTGGACAATTGTGGTTTTAATTACTTGAAC
AGTCATTATTGTATTACTGCCAGATTTTCATCTGTGGTTATTCAAACTGTATTATTGCTT
GATTCTGATAGCTTGCTATTCTTTGAACAGAAAGTATAGTCCCAGCGTGAAATTCAAAAG
CAGTCAAGATGGTGAAGTTTACGGCGGAGGAGCTCCGTGGAATTATGGATAAAAAGAACA
ATATCCGTAACATGTCTGTTATTGCTCATGTTGACCATGGTATGTGACCGAACAGTGTCA
GTTGTCTGTAATTGTCAAACAGTTCAATCTTGTTGATTGATGTTTTTGTAGCCTGCTCTT
AGTTGTGCTATATTATTTCTAAAAACTGGATGTTAGTTAAATTAATTTAGCTGTTTCACT
TTTTTGAAATAAGTTTCAGCCCTTGCTGTCTCCTGGAGATTATTCTAACTGCTTTTGTAT
GATTGATTTATGCTTTAACAAGCTTTAATGTAACTATTGGCATGTAATCCCATGGTTCAA
AATCTATGCCGTATGGTGTATGCTCATTTTCGTTGCTGAATGTGCTACAATTTACACGGT
TGTACTTGGTAGCACAAAATACATGTCCCTGCATTTCTGTTTTTTACAATGTCCCACCAG
ATTTTGTTAACCATGTTACTAAATACCTGGTTTGTCTTTTAATCATGGTTTGTTTCAACG
TACTCTAATGTTGTGTCATACTTTCATCTCTCAGTAGTTAATAAGTTCAATTATCTATAT
TCATGTATATTGTGTTCAACTGTAAATCCTGATGCTTGTGCACCGCCCTCATATATTATT
TACATGTTTGCAGGCAAGTCTACTCTTACGGATTCCCTTGTGGCAGCTGCTGGGATCATT
GCCCAGGAAGTAGCTGGTGATGTCCGCATGACTGATACCCGTGCAGACGAGGCAGAACGT
GGTATTACAATCAAATCCACGGGTATCTCTCTTTTCTATCAGATGACTCCTGAATCACTC
GAGATGTACAAGGGCGACAGGGATGGTGATGAGTACCTGATCAACCTTATCGATTCACCT
GGCCACGTTGACTTTTCTTCGGAAGTCACAGCTGCTCTTCGTATCACTGATGGTGCTTTG
GTGGTTGTCGACTGTATTGAGGGTGTGTGTGTGCAGACTGAAACTGTGCTGCGCCAAGCT
CTAGGTGAGAGGATTAGGCCTGTTCTTACTGTGAACAAGATGGACAGATGCTTCCTTGAG
CTTCAAGTGGAAGGCGAGGAAGCATACCAGACTTTCTCCCGTGTCATTGAAAATGCCAAT
GTCATCATGGCAACATATGAAGATGTTCTCCTTGGTGATGTCCAAGTGTACCC