Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_105451 (4139 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_105451

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_735 4 1855 bp AK364912 Available Available None





CDS Structure of MLOC_735






Contig Sequence (4139 bp)

>contig_105451 4139 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGCAAGTATGAATCGGTCATTAAA
AGGAAGTCATGGTCAAATTTACATGTTGAGACTATAGTGATATTCAAAACGTCCTATGTT
CTTGAGCAGAGGCACTATCTTAATGTTGATATGGCAGGCGCGACATCTAGTTACCAAAAG
TGAAGGGATGTTACCACATTGTGCTTGTTCGGGTTTTCAAAGCCTAGCGCTATGGTATTT
ACTATCCTTCATTGTATACTTTGGTACTGCATGTCAGGTTGTTAGATGAAATTTTACCTA
AATGATGAATCTCGTCCTATCTCTGCTGTACTCAGTAATGAGTGCATCATATCACTACAG
CTATTAGTTCTCTATTCTTTTATGAATACCGCCATAGCAGTTTAAACCTGTTAGAACTTA
CTCACCAAATTTCAGAATTCTTTCAGTAAGCTTGGATAATTTTCTTATCTCAAACATATT
TTATAACATATCCATTTGCTCAGACTCCTGGTGTATCAAGCGAGCCTCCTCTTTTGAGCT
TCAGTGTGGATAATATTGATACAGTTAAGTTATTGGAACTCCTAGGCCCAGAAAAGGTTG
ATCCAGTTGATGTCAAGGCTATTAAGGAAAAGTTTTTTGGCTACACAACATTCTGGTTGA
CAAGAGAAGAACCCTTTGGTGATCTTGGGGAAGGAGTCCTTTTTGTTGGGAATCTCCGAG
GGGACAGAGAGGAAATCTTTGGAAAACTTCAGCAGCAGCTACGTGAACTTACAGGCGACA
AATACAATCTTTTCATGGTGGAGGAGCCCAATTCAGAAGAGGATGACCCACGTGGAGGAC
CACGTGTTAGTTTTGGTTTGCTTAGAAGAGAAGTTTCTGAGCCTGGGCCTACTACCCTGT
GGCAATACGTTATTTCACTGTTACTTTTCCTTCTCACCGTGTTCTCCTGTATTGAGCTAG
GAATTGCATCAAAGGTACATCTGCCTAATCTGTTATATGATACCAGAGCTTAATACCCTT
CTATACTAGGTTGCTAATAAATATTTTACCTGCACAGATAAGCAGTCTTCCACCAGACAT
TGTTTCATATTTCACTGATCCAAATGCGACTGGACCCCCACCTGACATGCAACTTTTACT
TCCATTCGTGGAATCAGCTCTGCCAGTGGCTTATGGCGTCTTGGCTATCCAACTATTTCA
TGTAAATCACATCAAAGATCTGTTCAGCATTTATTTTTCTTCCTAGTCTTTCAATAGTGC
ATCTTGTACACCAGTTCAAGCTTAATAATTATTGCTAAACTCATTCCAACATTAACATAA
CATAATTGCTACTAACAGGCTTGTGTAAATACTCAAATCTGAATAACTGCTCTATCCTTT
ATAACATGCTAGTCGGTAGTTTAAATCAAACTATTCAATTGATTAGCTATGCTCCGAGCA
ATTGAACGCTGACATCAACTAGCAGATAATGGTGTATCAACGGATCCTTTAATTAAGTAG
TGATGCAGTTAGTGGTCTGAGCTGTTATTCATGAAGCCCCTATGTTTGTAATTGTTTGAC
CTGACCTACCATGTTACATTCTAATGCAGGAAATTGGACATATTTTGGCAGCATACCCAA
AGAAGGTGAAACTTGGCATTCCTTTCTTCATTCCGAACTTCACTCTTGGAACTTTTGGTT
CAATTACCCAGGTTAGTATGTTTAATAGAAGAAATATTATAATATGTATTCCCTCCATAA
AGTTAGAGAGGGAGTAATAGGTTGCATCAGACAGGAATGTATTGTGCTGCTATTTCATTA
CTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAGCGTTTTTTAACTACACTAGTGTCAAAAATGCT
CTTATATTATGGGACGGAGGGATTATATATCAACTAGTTGATCACTAATTCGCTAGTATG
CCATGATGATGAAGAGTTGGGTAAAATCTTGAGTTCTTGAATATATTGCGCATTATGTAT
TGCCTGATTCCCGACCTGTAAACATGATAGCATCGGAAAAATAGGCCACTTTTAAGTTTC
TTTTACTCCCCTCCCTCCCTTGTGTATGGTGGTAAATAATATTAAATCTGTTGGAAGATG
CTTGAGTAGTGATATTGTTTTTCTACTTTGGGTGTCATCATTCATGAGAGGTACATTCCA
GGGTCTAAATATTAAGGAAACACCCATTTTTTGACCTATCGGTTATTTTGTTTGACATGT
CTAATTTTGTGAACCAAGTTGCAAAAGTGATATGATTGTGCATATTTATCTCCAACCACT
ACTTGGAAGTTTCCTTATTTTCATCATCCACTCCTGTAGTTCAAATCCATTCTGCCAGAT
CGAAAGACAATGTTTGACGTATCAATGGCTGGTCCTTTGGCTGGAGCTGCACTTTCTTTT
TCAATGTTCTCTGTAGGCTTGTGGCTCTCCTCAAATCCTGCTGGGGCAACTGATTTAGTT
CAAGTACCCAGCAATCTGTTCCAGGGTTCTTTGTTACTTGGACTTATTAGCAGAGCAATA
CTTGGTTACAGGTGAATGCTACCTGGAATTTTGGACTTTTACTTTCTGCCATTTAAACTA
GTATTTGATTTCGTTATACTATTGTTTAAGTTTTTATCTGTCCTGGTTCCAGATGTGGTG
GCTGCGCTTTTTTCTTCAGTCCATCGTGTTATCCTGTTACGATACAGCACCATTTTAGAA
CACTCAGAAAGTGTGTGCTACTTTCCTGATTCTCACTCATTGTTGCGGTTTTTGAGAAGT
GTGCCGGATTAGCTGAAACTCTTCTAGTTTTAGGAGGATTTTTCCCTTGATCAACTCAAG
TAGAATATCAGTGGTTTTCTTAACTCCCAACTTATAGATATTTGATGAATTATTACGAGT
AACGGGGTCTTCTGTGAGTGAGGATAGTTAAGCATTAAAAACTGTTACAGCTTACAAACC
ATGTTGGTACCATGGTTTTGTAGGCGTTGCTTCAGCGTCGCTTCAGCACTGATGATGTGT
CTTTATCCCTTGAGGATGTTCTGTTCTGTGTGGAACGGGATAGTAGCCCATCTCGGCATG
TTCCATTTCCTCTCTAATACATGTGCCAATTGCTCTGTTCCCACGTTGCCAAGCCACCAT
CTCGCCTTACCATCCTGCCTTAAGCGCTTGATAGTTAAAGTAGGGGTGAGGCACCTAGCT
TCGCCTTATACCACTTTAAAAACCATGGTTAGTAATACAACTTCTGCTGAATATACTGGT
ATACCCATCATCCATGATAGAAGTTATTAACTTTGTACTATACTTTATCAACTGCTCAAC
TCTGGATTTTGTAGTTTTGATAATGAATTCTATCTTTCTATTTTCTAATGAGCTTAATTT
TATTTTCAGTGCTCTGCATGCTGCTACAGTTTCTATCCACCCTCTTGTGATCGCTGGCTG
GTGAAGTATCGTTCACGAATTTGCCTGACCTCTTATAACCAAACAGATTTTGTTTGTCTC
ATTGTTCCTGCAAATTCTGCAGGTGTGGTTTAACAACAACTGCCTTCAATATGCTTCCTG
TTGGATGTCTTGATGGTGGAAGAGGTTTACAGGTAAAAATTAGTGTAATTTTTTTATGGA
TGCAACCAAATAATCACGCTGGACCGTATGCATGTCCCTTCGTCTAGAAATATAGGTCAT
TTTAGCCATCTCTTTTTGTCCACATATGAATTTCAATTTCAAAGAGTTCTCCCCTCCGCT
CCTCCTATACACCCAATGGCCAGTACTTCCATGAATAAATGAATCTCCTTCCCAGTGCTC
CTCCTTGGAGAGCATAATTAGAGGCTAGTAAGAGAAGAGCATGATGACTGTTTTAGGCTA
TTGTGTAATTCTTGTACACATGGTTAAAGTTATATATTTGTGGGCAGGAGTATGTGGCAG
TAGCTACTCCTTTTGAGAATGGCTCTCGGTTTCTCTTCCTTGACAGTTAATACTGCTTTC
AGGCCCTTTTTTTTTCATTCACCTCCCTTATAAGGGTGTGTTTGGTTTGAGAACCAAAAG
ACATGGCATGTCATGGTCTCGTTCTGAAGGAATGGGTTGGTTCCATTCTTGTGTTCGGTT
GAAGATAAAAAATGTCATGGGTTCGTTCCATTCTTGTGTTTGGTTGGTGATATGAAATG