Map Locations of contig_103945 (9518 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_103945

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_544 5 1806 bp MLOC_544.3 Available Available LOC_Os03g11050.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13103.m01243 protein mannose-1-phosphate guanyltransferase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_544






Contig Sequence (9518 bp)

>contig_103945 9518 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGTTGGTCCATCACTACCTCAATAGCCAGCGGCCGTTGTTCCGTGGCTTCATTCCGGGCC
ACCTTCCGGCGTTGAATCGCAACCGAGAGAGTGGGCATCTCCTTCTTTGGAAGGACTACT
TTGATACAACAAATCTGTTGTTCAAACATCTGAAAATCCGCCACCGTTTTCGTATGAGTA
GGCATCTTTTTAACTGTATTAGAGAGGGGGTGGTCGGCTACGATGACTATTTCGAGTGCA
AAGAGGATGCCGTTGGAAAGATTGGTTTCTCCTCTTATCATAAATGCACTGCCGCCATCC
GAATGCTTGCATACGGAGTGTCCGGTGATCTCATTGACGAGTACGTTCGTATGAGCGAGT
CTACATGTCTAGAGTCCCTGTATAAGTTCTGCAAGGATGTTATTGCTGTGTTTGGCCCTG
AGTACTTGAGAGAGCCGACTCTTGAAGATACTAGAGGCCGTGGCGTCTCAAGATTTCTGG
ATCTGGCACTCTTTCTTTGGCATGGACGGACCACACAATCCTATCAACGTGCTTCGGCGC
TCGTCAGTGTTTGCTAGGCTTGCAGAAGGCAACAGCCTACCGGTGAACTTTACTATCAAC
GAGCACAACTACGACAAATGATACTACCTGGGTGACGGTATCTATCCTCAGTGAACCACT
ATTGTCAAGACAATCCCCGATCCTGTCGGAGAGAAGAGGAAAATATTTGTCCAAGAGCAA
GAGAGTGCTAGGAAGGATGTCGAGCAAGCCTTTGGTGTTTTGCAATCTCGATNNNGCATC
GTTCGGTATCCTGCTAATACCCGGAGCATGCAAAAACTGTGGGAGGTGATGACTCCTTGT
GTGATCATGCACAATATGATCGTAGAAGATGAGTGTACGGAACGTCCGTACGATGAAGGG
TTTCAGTTTCAGGGTGAGAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACAACGTTTGAACAG
TTCATCCAATTTCATCAATGACATGCGTGATTGGAAACTCACGTGTAACTGCAAAATGAT
TTGGTTGAGCATATGTGGGCTCATGTTGGAAATCAATAGTTGTATCTTCTTTATTCGTCT
TGTAAAACTATGCTATTTTATTCGACTGAAACTATGTTATTTGACTATATGTTTGAATGC
AAAAGCAATGCAAAATGAACTATTTGTTGAAATAGGGTGGCCAATCAACCACGCTGGCGA
GTCGACGTGTTGGACACAGTGCCTGATTTATATATAAAACAAAACGGACGCTGGACAAAC
GACTGATTCAAACGAATAAAAAACGAACAAAATTACGGTCCATTTGGAATTTGGATCGCC
CGGTTGGTTGCAGCCTTTCGCTAGATCTCAGTCCGGTTCAACGAGTCCAACGCACCACCA
CCCCCGCACCCCGATGCCGGATCGCGCGCACAGATCCCACCGGATCCAGGTGCGCGGAAC
CCTCCACAGTCCAGCAGCCGTACCCGTGTGCTGCAAACCCCGTAGAATCAGAGCCCACCA
TCGTCTCCAACCCAACTTCATCTCAGCAGCGCCAACAACACACGCGCGCACGCTCCCGCC
TCGCCCCGCCCCGCCCCGCCCGTCATCGTCAAACCCCACGCTCCAAACGCTCCTCGCCCC
CTCCGACTCCCCTCGCCTCAAATCTCACCAGTCACCGTTCCGCCAGTCTCAGCCCCGCCG
CCGAGGCGCCGCGCGCAGCCATGGCCGGCTCCGAGCAGCGCGTCGTCGCCGTCATCATGG
TCGGCGGCCCCACCAAAGGTACGCCGCAGATCTGTTCCCCCGCCCGCCATCCGGCGCGAA
CCCCCTCCCCTTCCGCGCGGCGCTTGTCTGATTGTCCGGTGGTTGGTTGGGTGTGCAGGG
ACGAGGTTCCGGCCGCTGTCGCTCAACGTGCCCAAGCCGCTCTTCCCGCTCGCCGGCCAG
CCCATGGTGCACCACCACATCTCCGCGTGCCGCCGCGTATGACCCGCGCTCCCTCCTTTT
CCTCTCTGCCTTCGCATTTGCTTGGTGGCTCGTGTCAGAATTGAGGCCTTTTCGATCCCG
CTGCTGCAGATCCCCAACCTGGCACAGATATACCTCATCGGCTTCTACGAGGAGCGGGAG
TTCGCCCTCTACGTATCCTCCATCTCCAACGAGCTCAGGATCCCCGTCAGGTTCGCTTCG
TGCCCTCCCAGCCCTTCAATTCACTTACTGCCAGTTTAGGCGCGTCGGATTCAGATAGTG
GTGAGCTGCCACTGACGGAGTTTTGCTTAATTCTAGGTACCTGAGAGAGGATAAGCCGCG
CGGGTCAGCCGGAGGGCTCTACAGCTTCAGGGATTACATCATGGAGGATAGTCCGGTCTA
ATCTTGACCCATTTTCATCTTGATTTATTTATTTTGAAATGTGGAATTGAATTAGTCGTT
TATCATTTGCCTTTATTTGTTAGTGTGGATTCTAGTGGGTTCCTTCAACCCGGGATATTT
GAGTGGCGGTTTCTACTTTAAGACTGCTTTGGCTCGCATGATTCGAAAAACACAAGAATA
GGGAAAGCTTAGGAATAAGATGTGATGAAATTTGGAATCCTACATGATAGAAGACACATA
AACAAGTAATAGAAATTATTTGGTTGCACCGCAGAAAAAACACAGGAATTTTGCATAGGG
ACTGAATGGATGCCATAGTTGTCTCATAGACTCAAATTTCCAGGAGGTCTAACCTCTTGC
TAGGAGTCCTATTGAATACTCCCTCCATTCCATAATGTAGTGTGTCCGTGCTTTTTGAGA
TTCAAGTTTGACCGTAAATTTAACCAACCCGGCGACTGCGGCGGGAGCAAAAATTATGCC
ATTGAATTCCATAATGTAGTGCGCTCGCGCTTTTCGAGATTCAAGTTTGACCATAAATTT
AACCAACATGGGCGACTGCACTGGAGCAAAAATTATACGATTGAATTCGTATTGAAAAGA
AGTTTTCAATGGTATATTTTTTGCTCCCGCTGCAGTCGCCCACGTTGGTTAAATTTACGG
TCAAACTTGAATCTCGAAAAGCACGGACGCACTACATTATAGAATGGAGGGAGTAGTGTA
GAAAAGCAACCCATAGGAATTTTTGAGGGACCATTTCTTTGAATCTAATGGACTGAACGG
AAAAATTCCTATGTATTTAGAATCCTGCAAAATTCCTTTGTAATTCTCTAAACCAAAGAG
GCCCTAAGAGATATGCAATTGCTTGGGTCTGACTGGCGTCTACTTTGCTGTGCTGGGTCA
GATTAAGGGAACTTCTGCTCTCTAAATATCCTTTTGTTATGTTTTTTGCAGGCGCACATT
GTTTTGCTGAACTGTGACGTCTGTTCTAGCTTCCCCTTGCCAGACATGCTCGGTAGGTTG
CCAAGTAGCTGAAGTTGGGATTGTTCATTTCGTATTAGCATATTAACAATGTTTGCTTTG
TTTGTTTCTGTTGGGCACTCATCACTAAATGTATCACCATCTCATCATTGCAGAGGCCCA
TAAAAAGTATGGAGGAATGGGCACTTTGCTAGTCAATAAGGTGTGAGAATATCATACTAG
TAACTTATTAGCGATAACCAGAGTTCTATATAGTATTCTAATGCATAACATTATTCCCGA
AATCATTCTCAGGTATCTGCGGAATCAGCTAACCAGTTTGGCGAGTTAGTGGCTGATCCT
GAAACAAATGAACTGTTACACTATACAGAAAAACCAGAGACTTTTGTGAGTATGCATTGC
TTAATTTTTTTTGTTTTGAGCGGGTGATTATTTGTTTATTTGGTTTGCTGTTGTATCCAC
TGGGAGACTTGTGCCTGCCTTAATTGGTTTTCAAATTATTTTGGCATAAGCAATGCTTCC
TAATAATTAGCTTAGCTCTAATGCATTTTATGCATGTGTAGGTGAGTGATCTCATAAATT
GCGGAGTCTATATATTTACTCCCAATATACTTAATGCAATCGAGGATGTCTTGAAACAGA
AGAAAGATAGAGGTATTATGTTCATTTATATTACTTTTTTTTTGCCTTTTAAACTGCATG
TAGTTTACACCCTTTTCTTCACCTTGCCATTAATTTTTGCATAATTTTGTTTTGGGCATG
CTCCCACGAGGCATATTTTATTTTTGTTAGTGCCGCCATTCAAACCATTAGTCAAAGAGG
TTTGACTGTTCCAGTTGACCTAAAATTCTGACAGCTTGGTGACATACAAATTTGAGAAAT
TAGATAAGTTCTAGTCAGTTAATAGCATTTTCTTCATTACCCTTGTTTTGTTTCTCCTAT
TGGTACTTCCTATTTACAGTACAAACTTTAATAACTCTCAATGCTAAATTTCAGCTAATT
TGCGCCGTGTATCCAGCTTTGAAGCTCTTCAGTCCGCAATGAAGTATGCGTGTATCTCCT
ATTCATTTTCTTGCATATTTATTTGGGCTATTTGTTAGTTAATTTGCATTTGATTATTTT
TTAATCCTGGAAACTGTTGGTACTATTTTAAAGAATATGATGTAGTATCCACCAAGTTAA
TGCATCACCAGGAAGTTGAACGTGAACATCGAGAGGTCTATCGAGTTTTTAAGCTCTATC
TTGTAATGCAAATGTCTTGGAACTTCTATTTTCAAACATAACCATAATACTGTTGATCTT
TTTAGCAAATCAAGGTCTCATTAGATGTGGATTAATTGTCCAGAAACAAGAATTCACTTT
CATGATACTGTTATCCTTGTGATATGTTCGCAGTAATACTTTCATAATGAAGTGCTTAAC
ATGTCTTCCCTGTTCTAAGTCATTTGCTGTACCTCCAAGATTTCCCTCTTATGTCAAATA
TAGGTAAGTTCAGGGCACATGGGTTGCTACGACATGATATCATCACAATAAAACCAATGT
TTGCCATGTTTTCTGAAGTTGTCTTCTGGGATGGTCCTTTATTTGCTTGAAGGTGTCATG
ATCCTTTGTTTAGGTTCCGGGGGGATAGTGCATAAAAATATAAAATCATAGAATATGGCT
GACACGGCTATCATATCAATTCAGCAAAAGAAAATAAATGGGTAGGAGGACTAATTGACC
ATCATACTGTCCTTGCTGCTTTTGTAGAAGAAATTATATATTTTTTTCTATTGGTGTTGG
CCTGATCAAGGGCCTGTCTCTAGCATTTCTATGTCGAAGCATACCCGTATTCTTTGCAAC
ACGGCTATTTTGTCTTTTCGCTAGTTTTTCCAAGAAATCTGTACAAAAATGGTAGAGCTT
CCATTAAGGTGATCCCAATGTATTTATATGATGCTGAACATCTTGTGTTAATTGTCAACA
GGGCAATTCCAGCAGATTATGTTAGGTTAGATCAAGATATCTTATCTCCTCTAGCAGGAA
AGAAGGAACTTTACACATACGAGACACTTGATTTTTGGGAACAGATCAAGACTCCAGGGT
AAATATAGTTCTTGACAGTGCTCTTTCTAAACTTGGAATTGTTGATTGACCAGAATTGCA
TCTTTGCATAGGATGTCTTTGAGATGCTCTGGTCTATATCTCTCCCAGTTTCGCCATACC
TCTCCTCATCTCTTGGCCTCTGGAGATGGCAAAAAGGGTGCCACTATTATAGGTGACGTG
TACATCCATCCATCTGCAAAGGTTCACCTAACTGCAAAGGTAACATGTGGTTCTTCCACA
TATTTTGAGTAGATTGCGATATACCATGGTATCTGATATCCTTGACATATTTGTTTATAA
CATATGAGTAGTTAGTGATGGTTTTATCTTTTCTATATTCTACCCATATACAGATTGGCC
CCAATGTCTCAATATCAGCAAATGCACGCATTGGAGCAGGAGCCAGGCTTATCAATTGCA
TCATTCTGGATGATGTTGAAATTATGGTTAGTCTTCTCTGTTTAGCAAGTGATAATCGAC
ATCTAGGTACCTGTATCTCAGATAATTCCTTTGGTTGCAGGAGAATGCAGTTGTTATACA
TTCAATAGTAGGGTGGAAGTCAACAGTAGGGAAATGGTCACGTGTACAGGCAAGATTTTC
TATACATGGCTTACCTACCCTATTAAAAATTACGTTAACCCTCATTTTCAACTCCTTCAT
CCTCTAGCATCTATACAAAGCTTAGAGCCTTCCATATTCCAATTATTTCGAGGTTTCTGT
TCTAATCCAATTTGAGAAGCAAGAATACATCTTTGATCTTAGGTTTGAGTGAAATGAATA
TACATGCGAATATGTGATCTTATGTAGATTTTATCACTGTTTATGCTTCTCTCCACTGTA
CACACCTACTGTTTGTAAAATAATATTTATGGTTCTGTCATCTGTGCGCAAAATTACTGT
GATTTTGCTGAAAAGAAATGTTACTTCTGTTGTGATCTAAGTTTGCCGTAACATGCTTCT
AACGATGATACAATTATGTATCCTGCTAATCCAGTCTTCTCTGGGTGCATTACTTAACAA
ATTTACTCTTCTGAATACAGGGTGAAGGTGACCACAATGCCAAACTTGGTATCACCATTC
TTGGTAAGTGCCTGCCTAGATGATATCTTGTTACCTTCCCATAAAGATCTTGTGGTAATA
TGCTTTACATAGGGATAGTTCTTGTGCTTGATTTGATGTGCTATCTAAATACAGGTGAAG
CCGTTGATGTTGAAGATGAGGTAGTTGTAACTAACAGCATCGTGCTCCCAAATAAAACTC
TCAATGCCAGCGTGCAAGATGAGATCATCCTATAATATCCATTGCACAACACATATCTTT
ATTAAATCCTGAATAAGGTCTTCATACCAAATATGTAATTTTCCTTCTTTTTCTTCTTCT
TTACCCCCCTCATGTATGCTTCCATTAGATTGGGGTCATTAGTCTGTACAAGGCATGTGA
TGTGATATTGGTGTAATTTTGTTTAGCATTCTGGCATCAAGTTCACTGGTGTAGAAATTG
TACAAACAGATCACAGCACTTCTATTGAGAACTGACATTTTGTTATGTGGATCTATTGTG
AGTAGTTGCTGTACTTTGAGATGCCAATCACCTTTCATGGCAACTGTTTTACTGCTGAGG
ATATTCTCTTCTGAATGTAAAAGTTTCAGCTAAAGTACGTACTGTAGAAAAGTTCTTGCA
GTGGGACTCTCCATCTAATATTTAGAACGGAGGGAGTATGTTATACAAACTAATTATGGC
ATCCAGGGCCGGGCCGGCAAAATCCGGGCTCTGTGCAAAACTAAAAAATGGGGCCTATGT
CATTCAAATTTAGAGATTATGCATCGATTTTTGGCAATTAGATGAACTGTCCTAACTCAC
CTAGTTTTATGTGCTATCTGGTTGAACTGCTATACTGTAATTTTTAGCCGAGGCAAAAAC
CAATCTCTAACAGAGTAACGATCCTGTTAAAAATTAATTAGAAAATTAAGAATTAGAAGC
ACGAACCAAAGTTAATCGAAAAGAAGGACTCGCTAGCGGCAACCGGTAGGTTAAGTGTTT
TGAACACGTCAATCACCCAGAGGATGGAATCATCGAAGCCATGAAGCACGTGGACACCGG
AGTCGGTGACGGATGGATATGAGTATCCGATGAGGCGACGAGTCTGAATTTTGAATTTTG
GGAGAGGAAGGCAACAACGGTTCGAGAGGCGGAAAGACCGATCCCATTTCCTGTAGCAAT
ACCATCACGCCGACGCAATTGTTGTGGTTTCCCGATCGATCAACTCTAGTACTCCACGAT
GTCCTTGTTTTTTAGACCGACGTGCCGATCACAATCTTTTTTTTTTAGGGATGAACATCT
ACTTTATTCATCAAAGTCCACATGGAGTGGATACATCTTTGGTCGTGGGACACGCCAAAC
CAGACGCGACGGCCTGGACATCTAGAAAGAGCAAATTTAGCTAAACTATGCGCATCTACA
TTAACATCTCGGCGTTCATAGGAAAACATAGAATGAAAAGTTACAGCTTTCATATTTATC
TCACTGATGATTGCACCATATCTTCCTCTTGCTCTTCTGTTGATGTCTGAGACTACCTGT
TGGCAATCAGACACTATACTGATGTTACTGATGTTGAGATCTTCAGCAAGGGAAAGGGCT
TCACGGCACGCCAGGGCTTCTAGTGTTGCCGGATCGAGCATACCTTCGATGACCAGCGCC
GAGCTACCCAAGAAGTTACCGCCTTCGTCCCTGCATACAACAACAACATCGCCTCCTCTC
TCCGGCATAACTCCAGCGTCGACATGGATCTTGTAGAAACTTGGAAGTGGCCGCTTCAAC
TTTCCAAGCACCGCCCGGGTGGCTGCACCAGTGTGGCTGGTATGGCGAGGGGTTTGTCGA
ATGATGCCTAGATCATCAGTGAATCTCTGGACAAACATATTTGTAGCTTGGGAACTCTGG
AAGATTCCTTCATGGATGGCCTTGCGTCGAGCATGCCAAATGGACCAGAGAATAATGGTC
ATGAGCACAAAATTTTCATGTGACAACATCTCCATCAGCGTGAACAACCACTGCTTGGAA
TTAGGCTCTGTGGTTTCTATCATTTTATGTGTTAGCTCTTCATTGGATAAAGCCCAAACA
CTCCTTGAAGCTGAACATTCGAGGAGTGAATGTCTCCATGAATCATGGACTCCACACAAG
CCGCATTGGTTGGAATGAGACATGTGTCGATGCGCTCGAACGTCATTTGTAGACAGGGAG
TGTTTGGAGAGTCTCCAAAGGAACATACACACCTTGCTCGACACTTTAGTTTTCCATAGT
GACTTCCATGCTCCCTCTTCTGCCCTTGAGATGGATGGTCCGACATCACCTTCCAACCAT
TCCTCCCTCCTCTGTCTTGTAGCAACCAACATGTTGTAAGCTGATTTGACTGAGAAAATG
CTCCGCTTATCGTAATGCCATGCCCAGAAGTCGGATAAGTTCCGTGTGCAAAGCGGTATG
CCCAAGATAACCTAAGCATCCATTGGCATGAATGTTGATTGAACAAGTTGTCTATTCCAG
GATACCGTCACGTTGATGATTAGCTCGGAGACCAACACCGGCAGGTTAGGCACCAGACAC
TCGTAAGACGAAGCATCTCATCACACAACAACTAGTTGTGAGCCCAAATCTTAGTTGAAG
ACCCGTTACCAATGCGTATCAACCCTTGTTTCAGGGTATCTCTACCTTCAACAATTGCTC
TCCACACCTGGCTAGGATGACTTCCTAGTTCAGCCTACAGAATGTCAGAATTTGGATAGT
ATATGCTCTTCAACACTCGTGCACTTAATGTATTTGTGTTTTGCAGCAAACGACACGCCT
GTCTGGCCAACATAGCTAGATTAAAAAGTTCAAAATCTTTGAATCCCAAACCTAACCATG
CCTTTTGGTCGAGTCATCGATTTCCAGGAAACCCAATGCGGTTTTATTTTCCCTTCCTTG
CTTCCCCACCAGAACTTTCTGATTAGCATATTCAGGTGTTCACAAAGCCCTCGTGGTAGT
TTAAAACAAGGCATGTGAAAGAACATGGATGTCGCCTAGAGGGGTGGGGATGAATAGGCA
CTTTAAAATAATTATGGTTTAGGCTTGAATAAATGCGG