Map Locations of contig_100906 (7976 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_100906

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_144 2 1007 bp MLOC_144.1 Available Available LOC_Os03g51510.3, FRAME:+3, EVALUE:6e-56, 13103.m05604 protein ribosomal protein L6, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_144






Contig Sequence (7976 bp)

>contig_100906 7976 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCCGATTGGCCAGCCTCCAGGCCGAGAGGGTGAGGGGCGACGTGGTCGGGCCAATAGTA
GGCTTCCACGTGGCCGACTGGGCACTACTCAGCCACGCCAACGCCGACAGGTTCCAATCG
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CAGCATATTAAGATGTGCGTCACATTTGTGGTGCCGTGGATTTCATTTGGTTTTCTCGTG
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GAAAACCCAACCATTAGTGACGGCCTAATGCCAAATTACAAGCGAACTTGGCTAAACTAT
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AGACTTTCACTCCAGATAGAGCCCACGTAATGCTCTTCCAAAAGGCTGAGCCACTACCAC
CCCTACTCCAGAGAATGTTCGGGGAGTTTACAATGTAATTATAGCTGATAATTTTTTGTC
CAGTCCCGGACTGGATCATCCATAAAGCGTTTCCTCCATGAAGCCAATAGGGCCATGTTA
AATTATTTTAGATTAGGGATCCCTAAACCTCCGAACTCTTTCTTCCTCGTGATCTGCCCC
CACCTAGCTAGATGGTATTTATGTTGGTCATCTAAATCTCCCCAAAAGAAATGAGCCATC
TCGGCATTGATAGCATTAATAGCCCATTTGGAGAATCTAACCACGGACATAAGATAAGCA
GGTATGCTGATAATACAGGCACAAAGCAGAATAATTTTGCCTTTGTACGTTAAGAATCTA
CCCATCCAACCAGAAAGATTCTTAATGATTCTATCTATAATCGGCTGAAGGTCTTCATGT
CTAAGGTTATCATAATGCACATGTAAGCCAAGGTATTTAATAGGGAAACTACCAAGTTTG
CAACAGAAAATTTGTGCAAACTCCTTAGCCAGATCTTCTTCCACATTAATGGTCATAAGA
TCACTCTTATGGAAGTTGATCTTCAGACCTGATAAAGTTTCAAAACAGGCCAGAAG