Contig Sequence (1295 bp)
>U35_25887 1295 Hv_44K_v2
GGGAGCTCGATGGTTACTGGGCTCGTGCGGTCCAATCAGTGTGAGGAGGCGTTGAGGGTG
TTCAGTGAAATGATCGGGATGGGTGTCGTCCCGAATGAGTCTGCACTGGTGAGCGCTGTC
TCAGCATGCTCGCTGCTGCGGTCGTTAGAGCACGGCGTGTGGGTACATGCGTATGCCAAG
CGGGAGCTGCAGGGGATGAGCCTCATCCTCGCCACAGCCATTGTTGACATGTATGGTAAA
TGTGGGGGTATCCATAACGCCGTCAGGGTGTTTGCTGCAATGCCAGTGAAAAACATCTAC
TCATGGAACTCGATGATTGCTGGGCTGGCCATGAACGGCAGGGAAATGCAGGCCTTATCA
CTCTTCTGGAAGATGCAGATGGCTGGTGTTCGGCCGAATGATATAACCTTCATCGGGTTG
CTGGGCGCTTGTAGCCACTCAGGCCTCGTCGATGAGGGCCGCTGGTTGTTCAACATGATG
GTTAATGGCTTTGGAATCCAGCCAGTCCAAGAGCACTATGGCCTAATGGTTGATTTACTC
GGTCGGGCAGGTCATGTTAGGGAGGCGGTTGATTTTGTGAACAGCATGCCGGTGGAGCCG
CATCCGGGCTTATGGGGTGCGCTTGCTGGCGCCTGCAAAATCCATGGTGAGGTGGAGCTT
GGTGAGGAGATTGCCAAGAAACTCATTGAGCTGGAGCNCCGTCATGGTAGCCGGTACATC
CTCCTGTCAAACATATATGGTGCATCGAACAGATGGGATGACATGGCCACTGTGCGAAGG
CTCCTTAAGGATCGCAAGGTCCCCAAGGGCACTGGCAATGCCATGGTTGGAAATGATGTT
CAGTCTATGAAATCCATGATGGATTAGTATTCCTTTAGACAGTGACATGTCAGGCGCTTT
CCCAGGCTGGGTGGCATGAGGTTGATCACGCTCTACCTTATAGACATCATTGTGCTGAAA
CAAGCCTCCATAGGGGAGAATGTTTGATTTATGTGTTACTGTATACCTAATTTCTTATGT
GGCAGACTGCAATCAACATGGTGCAGAGCTGCAAAATGCTGTCAAGAAGCCGAGAGTTCT
TTGTATTTGAAATTTTTGAATACTTACCTGAAGATGCAGAATTTCAGAAAATATGCACCT
AAGGACTAAGGCATGCATATTTGTAATTAAATTCTAACGGGAAGAGGCAGAACCCGAAAA
GCCATCACGAGGTTCAGGTTCATTGAATAATTTCTTGCAACCTTTCCGTGTACTTCCTTT
TTAATGTATGGTTGAATCAGATGGTACGCAAACCA
Homology of Contig U35_25887 to Model Species (E-value threshold 1e-50)
Pseudo-peptide dataset | Hit | Hit length | E-value | Description |
---|
Rice v7 | LOC_Os02g41560.1 | 494 | 3e-146 | protein|pentatricopeptide, putative, expressed |
Brachypodium v1_2 | Bradi3g49211.1 | 498 | 2e-151 | |
Arabidopsis v10 | AT2G02980.1 | 603 | 7e-61 | | Symbols: OTP85 | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | chr2:868468-870279 FORWARD LENGTH=603 |