Contig Sequence (1420 bp)
>U35_16471 1420 Hv_44K_v2
TCGAGCACTGTTGTCCCCACCGCACTCCACACACCCCCGCCGGCCTCACCGCGCACCAGG
CTGCCGCTCTCCACCGTGCCAATGGCGCCCGCCCGAGCAGCCCTCCTCGCCCTCCTCGTG
GCCGCGCTGCTCCCGCCTGCTCTGTCCCGTGGGCAGGGGCGTGGCCCGCACCTGCCCGGG
CACGGCCTGGTCCATCGGCACGGGCCTGGCATCGGTCACCACGCCCACGCGCCGCTCGGC
GGTGGCGCCTGGGCGTCCGCTCACGCCACCTTCTACGGCGGCGGTGACGCTTCCGGCACC
ATGGGCGGGGCGTGCGGCTACGGGAACCTCTACAGCACGGGGTACGGCTCCAACACGGCG
GCCCTGAGCACGGCGCTCTTCAACAACGGCCTCAGCTGCGGGGCCTGCTTCGAGGTGCGG
TGCGACCCGGGCGGCACCGAGGCCGGCGCGCCCCACGCCTGCCTCCCCGGCTCCACCGTG
GTGACTGCCACCAACTTCTGCCCGCCCAACTTCGGCGAGTCGTCCGACGCCGGCGGCTGG
TGCAACCCTCCCCGCGCCCACTTCGACATGTCCCAGCCCGTCTTCCAGCGCATCGCGCTC
TACCGCGCCGGCATTGTCCCCGTCTCCTACCGCAGGGTGGCGTGCCAGAAGAAGGGCGGC
ATCAGGTTCACGATCAATGGCCACTCGTACTTCAACCTGGTGCTGGTCACCAACGTGGGT
GGCCCCGGCGACGTGCACGCGGTGTCCGTCAAGTCGACGCGCTCGGCGGCGTGGCAGGCG
CTCTCACGCAACTGGGGGCAGAACTGGCAGAGCAACGCGCTGCTCGACGGGCAGGGCCTC
TCGTTCCGCGTGACGGCAGGCAACGGCCAGTCCGTGGTCTCCAACAACGCCGTCCCGCGC
GGCTGGTCATTCGGCCAGACCTTCAGCGGCGCCCAGTTCCACTGAGCGCCTGCATCATCC
GCAGACGCAGTACCATCTGGTTGTAGTAGTGGTTTTAGCGAGTGGTGGTCGTCGTCAACC
TCCCGATTGGAGCGTGCTGGGAAGCGCCATGGTTTTATGGTTGGTCCTTCCTCAGGCATA
CGTTCGTGGGGATTCGAGTTAGTAGCAGGTAGTTAGGCCTGGTATTATCATGGGCTTTTA
ATTGTCCTGGTGTGGTGTGTGTGCTAGCTGAACATTTGAACGAGGTTTTGGCTAGGATGG
CAGCGGTGGTAAAGGCTGGTTTGATTAACCGATGCCGCCTTGTATCACCCGCCGATTAGC
GAATGGGCCTCTTGGGTAGTGGCCTTTGTCTCGAGGATGTTTTGGTGTGTTCCTTGTTTG
TGTGTGTGGTGTGTGCTTGGCTGTGATGTAACCTCAGACCGAGTTAATTTGAGCCTCTGG
CTTTTGGATGTTTCACTTTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
Homology of Contig U35_16471 to Model Species (E-value threshold 1e-50)
Pseudo-peptide dataset | Hit | Hit length | E-value | Description |
---|
Rice v7 | LOC_Os02g51040.1 | 292 | 6e-134 | protein|expansin precursor, putative, expressed |
Brachypodium v1_2 | Bradi3g59460.1 | 293 | 3e-141 | |
Arabidopsis v10 | AT2G03090.1 | 253 | 2e-109 | | Symbols: ATEXPA15, EXP15, ATEXP15, ATHEXP ALPHA 1.3, EXPA15 | expansin A15 | chr2:917361-918554 REVERSE LENGTH=253 |