Contig Sequence (2410 bp)
>U35_4357 2410 Hv_44K_v2
GAAGAAGTCCTGGCAAGGCTCGACACACTGGTATCAAGATTGTTCAGCAGATTGCTATTC
TCATGGGCTGCGCTGTTCTGCCTCACCTTAAGAACCTAGTTGAGATCATTGAGCATGGTC
TAAGCGATGAGAACCAGAAAGTGCGGACGATCACAGCTCTCTCTCTTGCTGCACTTGCTG
AAGCTGCTGCGCCCTATGGTATAGAAAGTTTTGATAGTGTCCTGAAACCTCTCTGGAAGG
GTATCAGATCTCACCGTGGAAAGGTCCTTGCTGCCTTCTTGAAGGCTATTGGTTTCATCA
TCCCTCTTATGGATGCTCTGTATGCCAGTTACTACACGAAGGAGGTGATGCAAGTCCTGA
TTAGAGAGTTCCAGTCCCCAGACGAAGAGATGAAGAAGATTGTCCTGAAGGTTGTTAAGC
AGTGTGTCAGTACAGAGGGTGTGGAGGCTGATTATATCCGGAGTGACATCCTTCCAGACT
TCTTCAAACACTTCTGGGTTAGGAGAATGGCCCTAGATCGTAGGAACTATAAGCAACTTG
TGGAAACAACAGTAGAGATGGCAAACAAGGTGGGAGTTACTGGTATCGTTGGGAAGATTG
TTGAGGATCTGAAAGATGAAAGTGAGCCTTACAGGAGAATGGTGATGGAAACAATTGAGA
AGGTGGTGGCTAACTTGGGTGCTTCGGATATCGATCCTCGCCTGGAGGAGCTGCTTATTG
ATGGCATCCTGTATGCTTTCCAAGAGCAGACAAGTGATGATGCAAATGTCATGCTTAATG
GTTTTGGAGCTGTTGTGAATGCGCTTGGCCAGAGGGTCAAGCCTTATCTTCCTCAGATAT
GTGGTACCATTAAGTGGCGGTTGAATAACAAGAGTGCGAAAGTTAGGCAGCAAGCTGCTG
ATCTGATCTCAAGGATAGCTATTGTGATGAAGCAGTGCCAGGAGGAGCAGCTTATGGGTC
ACCTGGGTGTTGTGCTATATGAGTACTTGGGAGAGGAGTATCCTGAGGTGCTGGGTTCAA
TTCTCGGAGCATTGAAGGCTATCGTGAATGTTATTGGTATGACTAAGATGACGCCTCCAA
TCAAGGATCTCCTTCCTCGTCTGACCCCCATCTTGAAGAATAGGCATGAGAAGGTCCAAG
AGAACTGCATTGATCTAGTTGGTAGGATTGCTGATCGTGGAGCAGAATTTGTACCAGCTA
GGGAGTGGATGAGGATTTGTTTTGAGTTGCTGGAGATGTTGAAGGCTCACAAGAAGGGTA
TCAGAAGAGCCACTGTGAACACATTTGGTTATATCGCCAAGGCAATAGGGCCACAGGATG
TGTTAGCCACTCTGTTGAATAACTTGAAGGTGCAGGAGCGACAGAACCGTGTGTGCACTA
CTGTAGCAATTGCTATTGTTGCTGAAACGTGCTCGCCTTTTACAGTTTTGCCCGCCCTCA
TGAATGAGTACCGAGTTCCGGAGCTAAATGTTCAGAATGGTGTTTTGAAGTCTCTCTCTT
TCCTCTTTGAGTATATTGGTGAGATGGGGAAAGATTACATATATGCTGTCACTCCCCTGC
TCGAAGATGCCCTAATGGACAGGGATCTGGTACACAGGCAGACTGCTGCATCTGCTGTTA
AGCATATGGCTCTGGGAGTTGCTGGCTTGGGTTGTGAGGATGCTCTTGTCCACTTGCTTA
ACTATATCTGGCCCAACATATTCGAGACATCTCCCCATGTTATAAATGCCGTCATGGAGG
CTATCGAGGGGATGCGAGTGGCTCTAGGTGCAGCTGTGGTTCTGAATTATTGCCTCCAAG
GCCTTTTCCATCCAGCAAGGAAAGTACGCGAAGTATATTGGAAGATCTACAACTCGCTGT
ATATTGGTGCACAAGATGCACTTGTTGCTTCTTATCCTGCACTAGGCGATGATGGAGACA
ATATCTTCAGCCGTCCAGAGCTAGCCATGTTCGTATGATCTATATTTACATACCCTGCTT
TGTGAAGACTTCACATTTTGAGGAGTATCTTATGTCCAGGGTATTTCTTTCCAAGTGTTC
CACTGAAGAGTCTTCTTATCTTGATCTGCGACCGGGCGAGCGACGTGGCAGAGAAGCATG
TTTATTTCGCCGTGGCTGATAATATGTGAAATCAAGTCCTTAATAGTGAAGACAATACAA
TCATACTAGCATGAACATCGTCTTATTTATCATGTATATTTGGTTATGATGGCCAGCCTC
TGCTGTCAAAACTCTGTTTTAGCGATGTCTTGTAACGCTGTAAACCGTCAAGCTCTGTAC
TATGTGTGCTGTGGCATGATTATGTCTGGAATGCTTGCGTTGTTTTACGGTTGATCACCT
TTCGTTGTTTTACGGTTGATCACCTTTCGTGTTTAACACATATTGTTTTTTGTAAAAAAA
AAAAAAAAAA
Homology of Contig U35_4357 to Model Species (E-value threshold 1e-50)
Pseudo-peptide dataset | Hit | Hit length | E-value | Description |
---|
Rice v7 | LOC_Os02g05410.1 | 817 | 0.0 | protein|splicing factor 3B subunit 1, putative, expressed |
Brachypodium v1_2 | Bradi3g03690.1 | 1280 | 0.0 | |
Arabidopsis v10 | AT5G64270.1 | 1269 | 0.0 | splicing factor, putative | chr5:25706909-25710718 FORWARD LENGTH=1269 |